结直肠癌预后相关基因的功能及表达调控机制的研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30973382
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    34.0万
  • 负责人：
    郑树
  • 依托单位：
    浙江大学
  • 学科分类：
    H1801.肿瘤病因
  • 结题年份：
    2012
  • 批准年份：
    2009
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

本课题基于已有工作基础，采用Affymetrix基因芯片对不同预后的Dukes'B、C期结直肠癌肿瘤组织进行了全基因组表达谱分析，获得了198个差异基因，通过对差异基因的生物信息学功能分析及权重排列，筛选出能最好区分不同预后组的15个基因。在该课题中我们将扩大临床样本使用Tissue Array对候选基因进行验证，找出结直肠癌的预后相关基因，并通过细胞及动物水平的功能实验证实预后相关靶基因对肿瘤细胞增殖、侵袭的影响。为了进一步阐明以上实验获得的靶基因的表达调控机制，我们将从基因组各个水平包括SNP、CNV、甲基化修饰和MicroRNA的调控对其进行研究。因而，本研究首先基于全基因组表达谱分析获得后续研究的候选基因，并通过对靶基因进行功能及表达调控机制的研究，为中国人临床结直肠癌的预后评价提供有效的标志物，并为肿瘤的干预、治疗提供候选靶点。

结项摘要

本研究对结直肠癌患者肿瘤组织进行全基因组表达谱芯片扫描，多种生物信息学分析寻找预后和肝转移相关基因。构建了大肠癌组织蜡块的组织芯片，完善临床病理资料及随访数据库。寻找到预后相关基因ANKRD12, RT-PCR验证发现ANKRD12在癌旁组织中表达明显高于癌组织中的表达，肝转移原发灶中表达明显低于非肝转移原发灶中表达；转入ANKRD12 C端功能域的细胞生长未受明显影响，但转移能力受到抑制；正常结直肠粘膜组织和细胞系sw620、rko的cnv基因拷贝数分布和甲基化位点未见明显差异。寻找到与肝转移和预后相关靶基因NKTR，qRT-PCR和免疫组化证实NKTR在肝转移的原发灶中表达较无肝转移的原发灶明显降低，细胞功能实验提示敲除NKTR可以促进肿瘤生长和转移。寻找到肿瘤干细胞相关靶基因NANOG，该基因在结肠癌细胞系中的表达均高于正常肠粘膜上皮，而在克隆球中的表达又远远高于其原始细胞系的表达，敲除NANOG可以抑制肿瘤的生长。通过对结直肠癌肿瘤代谢物和表达谱芯片数据分析，发现了不同分期肿瘤相关的代谢物质：天冬氨酸、β-丙氨酸、谷氨酸、L-半胱氨酸、5-氧代脯氨酸、同型半胱氨酸。

项目成果

期刊论文数量（2）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Induced pluripotent stem cell-related genes influence biological behavior and 5-fluorouracil sensitivity of colorectal cancer cells
诱导多能干细胞相关基因影响结直肠癌细胞的生物学行为和5-氟尿嘧啶敏感性
  • DOI：
    10.1631/jzus.b1100154
  • 发表时间：
    2012-01
  • 期刊：
    Journal of Zhejiang University-Science B
  • 影响因子：
    5.1
  • 作者：
    Shi, Zhong;Bai, Rui;Fu, Zhi-xuan;Zhu, Yong-liang;Wang, Rong-fu;Zheng, Shu
  • 通讯作者：
    Zheng, Shu
ST13, a proliferation regulator, inhibits growth and migration of colorectal cancer cell lines
ST13 是一种增殖调节剂，可抑制结直肠癌细胞系的生长和迁移
  • DOI：
    10.1631/jzus.b1200037
  • 发表时间：
    2012-11-01
  • 期刊：
    JOURNAL OF ZHEJIANG UNIVERSITY-SCIENCE B
  • 影响因子：
    5.1
  • 作者：
    Bai, Rui;Shi, Zhong;Zheng, Shu
  • 通讯作者：
    Zheng, Shu

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  • 作者：
    魏启春;沈俐;郑树;等
  • 通讯作者：
    等

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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