沙门氏菌严格宿主适应性的进化
项目介绍
AI项目解读
基本信息
- 批准号:30970119
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:35.0万
- 负责人:
- 依托单位:
- 学科分类:C0108.病原细菌学
- 结题年份:2012
- 批准年份:2009
- 项目状态:已结题
- 起止时间:2010-01-01 至2012-12-31
- 项目参与者:李飞峰; 徐晖; 李庆海; 霍霄; 王磊; 刘佶; 王春晓; 徐华锋; 刘栋楠;
- 关键词:
项目摘要
病原菌的宿主适应性是个很重要的生物学现象,关系到新病原体的出现、病原体致病特性的改变、宿主与病原体之间相互作用机制等领域的研究,与人类健康事业密切相关。然而,迄今人类对此了解非常有限。本项目以沙门氏菌为模型,探讨细菌宿主适应性进化的遗传学基础和分子机制。绝大多数的沙门氏菌可感染多种宿主,而伤寒沙门氏菌等少数血清型只感染人,鸡白痢沙门氏菌只感染禽类,等等。我们将通过全基因组序列分析比较广泛宿主和单一宿主沙门氏菌,鉴定出其间的基因组差异。我们设想,沙门氏菌的严格宿主适应性来源于2方面的遗传因素,包括主动(基因横向转移和突变)和被动(基因删除和退化)基因组进化事件。我们将对鉴定出的候选基因进行生物信息学预测,按其理论上的重要性排序,把候选基因在目标菌株上通过基因置换法敲入或敲除,进行动物实验,验证其在宿主适应性上发挥的作用。
结项摘要
病原菌的宿主适应性是个很重要的生物学现象,关系到新病原体的出现、病原体致病特性的改变、宿主与病原体之间相互作用机制等领域的研究,与人类健康事业密切相关。然而,迄今人类对此了解非常有限。绝大多数的沙门氏菌可感染多种宿主,而伤寒沙门氏菌等少数血清型只感染人,鸡白痢沙门氏菌只感染禽类,等等。我们设想,沙门氏菌的严格宿主适应性来源于2 方面的遗传因素,包括主动(基因横向转移和突变)和被动(基因删除和退化)基因组进化事件。本项目我们以沙门氏菌为模型,探讨了细菌宿主适应性进化的遗传学基础和分子机制。我们通过全基因组序列分析比较广泛宿主和单一宿主沙门氏菌,鉴定出其间的基因组差异,并对鉴定出的候选基因进行生物信息学预测,按其理论上的重要性排序,把候选基因在目标菌株上通过基因置换法敲入或敲除,最后进行动物实验,验证其在宿主适应性上发挥的作用。本课题组在分析鉴定出Salmonella paratyphi C基因组152个假基因的基础上,在S. pullorum基因组上鉴定出200多个假基因,为下一步与S. typhi, S. paratyphi A, S. gallinarum等沙门菌的基因组比较研究打下了良好基础。已经初步确定动物实验的候选基因,目前处于菌株构建阶段。与此同时,我们对代表性沙门菌的一系列致病因子进行了深入研究,从功能的角度为沙门菌宿主适应性分子机制的阐明做了重要的积累。
项目成果
期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Production of enterodiol from defatted flaxseeds through biotransformation by human intestinal bacteria.
通过人体肠道细菌生物转化脱脂亚麻籽生产肠二醇
- DOI:10.1186/1471-2180-10-115
- 发表时间:2010-04-16
- 期刊:BMC microbiology
- 影响因子:4.2
- 作者:Wang CZ;Ma XQ;Yang DH;Guo ZR;Liu GR;Zhao GX;Tang J;Zhang YN;Ma M;Cai SQ;Ku BS;Liu SL
- 通讯作者:Liu SL
SPC-P1: a pathogenicity-associated prophage of Salmonella paratyphi C.
SPC-P1:丙型副伤寒沙门氏菌致病性相关原噬菌体
- DOI:10.1186/1471-2164-11-729
- 发表时间:2010-12-30
- 期刊:BMC genomics
- 影响因子:4.4
- 作者:Zou QH;Li QH;Zhu HY;Feng Y;Li YG;Johnston RN;Liu GR;Liu SL
- 通讯作者:Liu SL
Identification of a Known Mutation in Notch 3 in Familiar CADASIL in China
中国常见 CADASIL 中 Notch 3 已知突变的鉴定
- DOI:10.1371/journal.pone.0036590.s001
- 发表时间:2012-01-01
- 期刊:Figshare
- 影响因子:--
- 作者:Liu, Ji;Liu, Gui-Rong;Zhu, Yu-Lan
- 通讯作者:Zhu, Yu-Lan
mutL as a genetic switch of bacterial mutability: turned on or off through repeat copy number changes
mutL 作为细菌突变性的遗传开关:通过重复拷贝数变化打开或关闭。
- DOI:10.1111/j.1574-6968.2010.02107.x
- 发表时间:2010-11-01
- 期刊:FEMS MICROBIOLOGY LETTERS
- 影响因子:2.1
- 作者:Chen, Fang;Liu, Wei-Qiao;Liu, Shu-Lin
- 通讯作者:Liu, Shu-Lin
The type VI secretion system gene cluster of Salmonella typhimurium: Required for full virulence in mice
鼠伤寒沙门氏菌VI型分泌系统基因簇:对小鼠具有完全毒力所必需的
- DOI:10.1002/jobm.201200047
- 发表时间:2013-07-01
- 期刊:JOURNAL OF BASIC MICROBIOLOGY
- 影响因子:3.1
- 作者:Liu, Ji;Guo, Ji-Tao;Liu, Shu-Lin
- 通讯作者:Liu, Shu-Lin
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