沙门氏菌严格宿主适应性的进化

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    30970119
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    35.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0108.病原细菌学
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2009
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

病原菌的宿主适应性是个很重要的生物学现象,关系到新病原体的出现、病原体致病特性的改变、宿主与病原体之间相互作用机制等领域的研究,与人类健康事业密切相关。然而,迄今人类对此了解非常有限。本项目以沙门氏菌为模型,探讨细菌宿主适应性进化的遗传学基础和分子机制。绝大多数的沙门氏菌可感染多种宿主,而伤寒沙门氏菌等少数血清型只感染人,鸡白痢沙门氏菌只感染禽类,等等。我们将通过全基因组序列分析比较广泛宿主和单一宿主沙门氏菌,鉴定出其间的基因组差异。我们设想,沙门氏菌的严格宿主适应性来源于2方面的遗传因素,包括主动(基因横向转移和突变)和被动(基因删除和退化)基因组进化事件。我们将对鉴定出的候选基因进行生物信息学预测,按其理论上的重要性排序,把候选基因在目标菌株上通过基因置换法敲入或敲除,进行动物实验,验证其在宿主适应性上发挥的作用。

结项摘要

病原菌的宿主适应性是个很重要的生物学现象,关系到新病原体的出现、病原体致病特性的改变、宿主与病原体之间相互作用机制等领域的研究,与人类健康事业密切相关。然而,迄今人类对此了解非常有限。绝大多数的沙门氏菌可感染多种宿主,而伤寒沙门氏菌等少数血清型只感染人,鸡白痢沙门氏菌只感染禽类,等等。我们设想,沙门氏菌的严格宿主适应性来源于2 方面的遗传因素,包括主动(基因横向转移和突变)和被动(基因删除和退化)基因组进化事件。本项目我们以沙门氏菌为模型,探讨了细菌宿主适应性进化的遗传学基础和分子机制。我们通过全基因组序列分析比较广泛宿主和单一宿主沙门氏菌,鉴定出其间的基因组差异,并对鉴定出的候选基因进行生物信息学预测,按其理论上的重要性排序,把候选基因在目标菌株上通过基因置换法敲入或敲除,最后进行动物实验,验证其在宿主适应性上发挥的作用。本课题组在分析鉴定出Salmonella paratyphi C基因组152个假基因的基础上,在S. pullorum基因组上鉴定出200多个假基因,为下一步与S. typhi, S. paratyphi A, S. gallinarum等沙门菌的基因组比较研究打下了良好基础。已经初步确定动物实验的候选基因,目前处于菌株构建阶段。与此同时,我们对代表性沙门菌的一系列致病因子进行了深入研究,从功能的角度为沙门菌宿主适应性分子机制的阐明做了重要的积累。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Production of enterodiol from defatted flaxseeds through biotransformation by human intestinal bacteria.
通过人体肠道细菌生物转化脱脂亚麻籽生产肠二醇
  • DOI:
    10.1186/1471-2180-10-115
  • 发表时间:
    2010-04-16
  • 期刊:
    BMC microbiology
  • 影响因子:
    4.2
  • 作者:
    Wang CZ;Ma XQ;Yang DH;Guo ZR;Liu GR;Zhao GX;Tang J;Zhang YN;Ma M;Cai SQ;Ku BS;Liu SL
  • 通讯作者:
    Liu SL
SPC-P1: a pathogenicity-associated prophage of Salmonella paratyphi C.
SPC-P1:丙型副伤寒沙门氏菌致病性相关原噬菌体
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2010-12-30
  • 期刊:
    BMC genomics
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Zou QH;Li QH;Zhu HY;Feng Y;Li YG;Johnston RN;Liu GR;Liu SL
  • 通讯作者:
    Liu SL
Identification of a Known Mutation in Notch 3 in Familiar CADASIL in China
中国常见 CADASIL 中 Notch 3 已知突变的鉴定
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0036590.s001
  • 发表时间:
    2012-01-01
  • 期刊:
    Figshare
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Liu, Ji;Liu, Gui-Rong;Zhu, Yu-Lan
  • 通讯作者:
    Zhu, Yu-Lan
mutL as a genetic switch of bacterial mutability: turned on or off through repeat copy number changes
mutL 作为细菌突变性的遗传开关:通过重复拷贝数变化打开或关闭。
  • DOI:
    10.1111/j.1574-6968.2010.02107.x
  • 发表时间:
    2010-11-01
  • 期刊:
    FEMS MICROBIOLOGY LETTERS
  • 影响因子:
    2.1
  • 作者:
    Chen, Fang;Liu, Wei-Qiao;Liu, Shu-Lin
  • 通讯作者:
    Liu, Shu-Lin
The type VI secretion system gene cluster of Salmonella typhimurium: Required for full virulence in mice
鼠伤寒沙门氏菌VI型分泌系统基因簇:对小鼠具有完全毒力所必需的
  • DOI:
    10.1002/jobm.201200047
  • 发表时间:
    2013-07-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF BASIC MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Liu, Ji;Guo, Ji-Tao;Liu, Shu-Lin
  • 通讯作者:
    Liu, Shu-Lin

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其他文献

多属性决策的广义双基点排序法
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  • 通讯作者:
    刘瑞红

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AI技术路线图

刘树林的其他基金

病原性细菌的基因组进化:物种形成的分子机制
  • 批准号:
    82020108022
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
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  • 批准年份:
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细菌病原性进化中两个关键步骤分子事件解析:致病因子的获得及基因组的适应性重构
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    面上项目
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基因退化与宿主适应:伤寒沙门菌等单一宿主沙门菌动物感染模型的构建
  • 批准号:
    81030029
  • 批准年份:
    2010
  • 资助金额:
    225.0 万元
  • 项目类别:
    重点项目

相似国自然基金

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  • 批准号:
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相似海外基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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