鲿科鱼类系统演化与历史生物地理学研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31872204
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0402.动物系统与分类
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

There are over 30 000 fish species worldwide, accounting for more than half of the vertebrate species, which plays an important role in the marine and freshwater ecosystems, thus the study on the diversity and evolution of fishes is an essential component of the animal systematics and evolutionary research. In the present project, bagrid catfishes (Teleostei: Siluriformes: Bagridae) are employed, covering the majority of genera and species in bagrids, particularly those from Africa, South and Southeast Asia. Based on phylogenomic approach, we aim to provide a reliable hypothesis on the phylogeny of bagrid catfishes with mitochondrial genome and multiple nuclear molecular markers. Another purpose of this project is to investigate the divergence time and evolution history of bagrid catfishes with the molecular clock theory based on their fossil records and the earth's geological history, and then to test the competing hypotheses of "Out of India", "Out of Southeast Asia" or other possible historical biogeographic process.
鱼类的物种数(大于30 000种)占整个脊椎动物物种数的一半以上,鱼类也是海洋和淡水生态系统的重要组成部分,因而鱼类的多样性与演化研究是动物系统学与演化研究的重要组成部分。本项目以鲇形目鲿科鱼类为主要研究对象,涵盖鲿科鱼类的多数属种,尤其是非洲、南亚和东南亚的属种,采用线粒体基因组联合多个核基因分子标记分析的系统发育基因组学分析方法来获得一个鲿科鱼类可靠的系统发育关系假说。在此基础上,结合鲿科鱼类化石记录和地球地质历史,运用分子钟理论和分析方法,推算鲿科鱼类起源演化时间,借以探讨鲿科鱼类的起源演化历史,并检验“走出印度”、“走出东南亚”假说或者其他可能的历史生物地理学过程。

结项摘要

鲇形目鲿科鱼类广泛分布于亚洲和非洲,其历史生物地理学过程是检验“走出印度”或“走出东南亚”假说的理想模型。本项目以鲿科鱼类为主要研究对象,基于14属、84种鲿科鱼类样品,采用高通量测序技术,运用系统发育基因组学分析方法,结合鲿科及相关类群鱼类的化石记录,探讨了鲿科鱼类的系统发育关系及其起源演化历史。目前的研究进展表明,鲿科鱼类并非单系类群,其于渐新世时期起源于南亚地区,如现今的印度、孟加拉国等地,结合地球地质事件,鲿科鱼类的多样性演化与青藏高原的演化密切相关。

项目成果

期刊论文数量(22)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A chromosome-level genome of the helmet catfish (Cranoglanis bouderius).
头盔鲶鱼 (Cranoglanis bouderius) 的染色体水平基因组。
  • DOI:
    10.3389/fgene.2022.962406
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    FRONTIERS IN GENETICS
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Xu, Yuan;Shao, Feng;Chen, Weitao;Ni, Luyun;Peng, Zuogang
  • 通讯作者:
    Peng, Zuogang
Molecular diversity of Uzbekistan's fishes assessed with DNA barcoding.
利用 DNA 条形码评估乌兹别克斯坦鱼类的分子多样性
  • DOI:
    10.1038/s41598-021-96487-1
  • 发表时间:
    2021-08-19
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Sheraliev B;Peng Z
  • 通讯作者:
    Peng Z
基于环境DNA宏条形码的洱海鱼类多样性研究
  • DOI:
    10.7541/2020.125
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    水生生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    舒璐;林佳艳;徐源;曹特;封吉猛;彭作刚
  • 通讯作者:
    彭作刚
Triplophysa sanduensis, a new loach species of nemacheilid (Teleostei: Cypriniformes) from South China
三都三鳅,华南线鱼科泥鳅(Teleostei:Cypriniformes)泥鳅新种
  • DOI:
    10.11646/zootaxa.4560.2.10
  • 发表时间:
    2019-02-25
  • 期刊:
    ZOOTAXA
  • 影响因子:
    0.9
  • 作者:
    Chen, Shi-Jing;Peng, Zuo-Gang
  • 通讯作者:
    Peng, Zuo-Gang
ANALYSIS OF INTESTINAL MICROORGANISMS IN TRIPLOPHYSA ROSA (TELEOSTEI, CYPRINIFORMES)
  • DOI:
    10.7541/2020.2019.169
  • 发表时间:
    2021-01-01
  • 期刊:
    Acta Hydrobiologica Sinica
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Liu Ni;Peng Zuo-Gang
  • 通讯作者:
    Peng Zuo-Gang

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其他文献

青鳉与三刺鱼嗅觉受体(OR)基因的鉴定与进化分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中国科学C辑:生命科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    何舜平;彭作刚;陈明
  • 通讯作者:
    陈明

其他文献

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彭作刚的其他基金

高原鳅属鱼类洞穴类群系统演化与生物地理学研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2021
  • 资助金额:
    58 万元
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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