Revealing environmental chemical exposome in a diverse prenatal population and relationships to maternal and perinatal health (REVEAL)

揭示不同产前人群的环境化学暴露及其与孕产妇和围产期健康的关系 (REVEAL)

基本信息

项目摘要

ABSTRACT - Revealing environmental chemical exposome in a diverse prenatal population and relationships to maternal and perinatal health (REVEAL) Our renewal application builds on our original R01 by advancing analytical chemistry and computational techniques to characterize more fully the prenatal chemical exposome and its links to adverse maternal and perinatal health outcomes (e.g., gestational diabetes, preterm birth, and low birthweight). Prevalence of these outcomes has increased and is linked to chemical exposures in the US population. Prenatal exposures to a broad range of environmental chemicals, including plastic related chemicals and per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS), have been shown to adversely affect health, but technological challenges have left significant data gaps hindering our ability to characterize environmental exposures and drivers of disease. Over 350,000 chemicals and compound mixtures are registered for production worldwide, and thousands of high–production volume chemicals are used extensively in the US, yet human biomonitoring capacity covers a very small fraction of the chemical exposome. In our previous R01 we pioneered a nontargeted analysis (NTA) workflow, with significantly improved computational and analytical methods using high-resolution mass spectrometry (HRMS) in a demographically diverse population of maternal-newborn pairs. We were the first to identify multiple chemicals in maternal and newborn sample used in high volumes in the US not previously detected in human blood samples including chemicals used in personal care products and fragrances, production of plastics, surfactants, and stain treatment. We also identified over 50 novel chemicals with limited to no information on their uses or sources and found significant associations between exogenous and endogenous compounds, several chemical groups (siloxanes, PFAS, and chemicals used in plastics and rubber) and biomarkers of lipid metabolism and regulation, supporting a link to gestational diabetes. For our renewal project, we propose to expand our study population by analyzing an additional 750 2nd trimester pregnancy samples, 300 of the samples matched to our original 3rd trimester samples. We will contribute to improved understanding of the prenatal chemical exposome by integrating NTA with improved computational methods including a chemical suspect database ~1,000,000 exogenous and endogenous chemical features in combination with upgraded software for supercomputing to identify ~500 chemical prenatal exposures and estimate their concentrations using new machine learning algorithms. We will use this data to characterize complex relationships between multiple exogenous chemical exposures, endogenous effect biomarkers, and maternal and perinatal health outcomes. The overarching goal of this renewal is to develop an integrated package of analytic and computational tools that allow expanded capacity to identify and calculate chemical concentrations and their link to adverse maternal and pregnancy outcomes, critical to information public health interventions to prevent harmful chemical exposures.
摘要 - 揭示不同产前人群中的环境化学暴露和 与孕产妇和围产期健康的关系 (REVEAL) 我们的更新应用程序以我们最初的 R01 为基础,通过推进分析化学和计算 更全面地表征产前化学暴露及其与不良母体和胎儿的联系的技术 围产期健康结果(例如妊娠糖尿病、早产和低出生体重)。 结果有所增加,并且与美国人口的产前接触化学物质有关。 广泛的环境化学品,包括塑料相关化学品以及全氟烷基和多氟烷基 物质(PFAS)已被证明会对健康产生不利影响,但技术挑战已经存在 巨大的数据差距阻碍了我们描述环境暴露和疾病驱动因素的能力。 全球有超过 350,000 种化学品和化合物混合物已注册生产,其中数千种 高产量化学品主要在美国使用,但人类生物监测能力涵盖 在我们之前的 R01 中,我们首创了非靶向分析 (NTA)。 工作流程,使用高分辨率质量显着改进了计算和分析方法 我们是第一个在人口多样化的母婴群体中进行光谱测定(HRMS)的人。 识别出在美国大量使用的孕产妇和新生儿样本中的多种化学物质,这是以前从未有过的 在人体血液样本中检测到,包括个人护理产品和香水中使用的化学物质, 我们还鉴定了 50 多种有限的新型化学品。 没有关于其用途或来源的信息,并发现外源性和 内源性化合物、多种化学组(硅氧烷、PFAS 以及塑料和塑料中使用的化学品) 橡胶)和脂质代谢和调节的生物标志物,支持与妊娠糖尿病的联系。 更新项目中,我们建议通过分析另外 750 名第二三个月的患者来扩大我们的研究人群 怀孕样本,其中 300 个样本与我们最初的三个月期样本相匹配,我们将做出贡献。 通过将 NTA 与改进的计算相结合,提高对产前化学暴露组的理解 方法包括化学可疑数据库 ~1,000,000 个外源和内源化学特征 与超级计算升级软件相结合,可识别约 500 种化学产前暴露情况, 我们将使用新的机器学习算法来估计它们的浓度。 多种外源性化学暴露、内源性效应生物标志物和 此次更新的总体目标是制定一个综合的孕产妇和围产期健康结果。 分析和计算工具包,可扩展识别和计算化学物质的能力 浓度及其与不良孕产妇和妊娠结局的联系,对信息公共卫生至关重要 防止有害化学物质暴露的干预措施。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Gaussian graphical modeling of the serum exposome and metabolome reveals interactions between environmental chemicals and endogenous metabolites.
血清暴露组和代谢组的高斯图形模型揭示了环境化学物质和内源代谢物之间的相互作用。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021-04-07
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Bessonneau, Vincent;Gerona, Roy R;Trowbridge, Jessica;Grashow, Rachel;Lin, Thomas;Buren, Heather;Morello;Rudel, Ruthann A
  • 通讯作者:
    Rudel, Ruthann A
Translating community-based participatory research into broadscale sociopolitical change: insights from a coalition of women firefighters, scientists, and environmental health advocates.
将基于社区的参与性研究转化为广泛的社会政治变革:女性消防员、科学家和环境健康倡导者联盟的见解。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023-08-30
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ohayon, Jennifer Liss;Rasanayagam, Sharima;Rudel, Ruthann A;Patton, Sharyle;Buren, Heather;Stefani, Tony;Trowbridge, Jessica;Clarity, Cassidy;Brody, Julia Green;Morello
  • 通讯作者:
    Morello
Integrating Exposure Knowledge and Serum Suspect Screening as a New Approach to Biomonitoring: An Application in Firefighters and Office Workers.
整合暴露知识和血清疑似筛查作为生物监测的新方法:在消防员和办公室工作人员中的应用。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    11.4
  • 作者:
    Grashow, Rachel;Bessonneau, Vincent;Gerona, Roy R;Wang, Aolin;Trowbridge, Jessica;Lin, Thomas;Buren, Heather;Rudel, Ruthann A;Morello
  • 通讯作者:
    Morello
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Tracey J. Woodruff其他文献

Improving the Quality of Toxicology and Environmental Health
提高毒理学和环境健康的质量
  • DOI:
    10.1016/j.ijheh.2023.114311
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    6
  • 作者:
    P. Whaley;B. Blaauboer;Jan Brozek;Elaine A. Cohen Hubal;Kaitlyn Hair;Sam Kacew;Thomas B. Knudsen;Carol F. Kwiatkowski;D. Mellor;A. Olshan;Matthew J Page;Andrew A. Rooney;E. Radke;Larissa Shamseer;K. Tsaioun;P. Tugwell;Daniele Wikoff;Tracey J. Woodruff
  • 通讯作者:
    Tracey J. Woodruff
Screening and characterization of 133 physiologically-relevant environmental chemicals for reproductive toxicity
133 种生理相关环境化学品的生殖毒性筛选和表征
  • DOI:
  • 发表时间:
    2024
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Gurugowtham Ulaganathan;Hui Jiang;Noah Canio;Ashwini Oke;Sujit Silas Armstrong;Dimitri Abrahamsson;Julia R. Varshavsky;Juleen Lam;Courtney Cooper;Joshua F. Robinson;J. Fung;Tracey J. Woodruff;Patrick Allard
  • 通讯作者:
    Patrick Allard
Upstream adverse effects in risk assessment: a model of polychlorinated biphenyls, thyroid hormone disruption and neurological outcomes in humans.
风险评估中的上游不利影响:多氯联苯、甲状腺激素破坏和人类神经系统结果的模型。
  • DOI:
    10.1016/j.envres.2012.05.013
  • 发表时间:
    2012-08-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    8.3
  • 作者:
    A. Wise;F. Parham;Daniel A. Axelrad;K. Z. Guyton;C. Portier;L. Zeise;R. Zoeller;Tracey J. Woodruff
  • 通讯作者:
    Tracey J. Woodruff
The Guide - evidence-based meets of evidence for on growth.
该指南 - 以证据为基础的增长证据集会。
  • DOI:
    10.1002/jemt.10346
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.5
  • 作者:
    J. Lam;Erica Koustas;Patrice M. Sutton;Paula I Johnson;Dylan S. Atchley;Saunak Sen;Robinson;Daniel A. Axelrad;Tracey J. Woodruff
  • 通讯作者:
    Tracey J. Woodruff
Rapid identification of reproductive toxicants among environmental chemicals using an in vivo evaluation of gametogenesis in budding yeast Saccharomyces cerevisiae.
使用芽殖酵母酿酒酵母配子发生的体内评估快速鉴定环境化学物质中的生殖毒物。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2024
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Ravinder Kumar;Ashwini Oke;Beth Rockmill;Matthew de Cruz;Rafael Verduzco;Anura Shodhan;Xavier Woodruff;Dimitri Abrahamsson;Julia R. Varshavsky;Juleen Lam;Joshua F. Robinson;Patrick Allard;Tracey J. Woodruff;J. Fung
  • 通讯作者:
    J. Fung

Tracey J. Woodruff的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Tracey J. Woodruff', 18)}}的其他基金

UCSF Environmental Research and Translation for Health Center (EaRTH Center)
加州大学旧金山分校健康中心环境研究与翻译(EaRTH 中心)
  • 批准号:
    9918111
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 59.41万
  • 项目类别:
Administrative Core
行政核心
  • 批准号:
    9918112
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 59.41万
  • 项目类别:
UCSF Environmental Research and Translation for Health Center (EaRTH Center)
加州大学旧金山分校健康中心环境研究与翻译(EaRTH 中心)
  • 批准号:
    10598480
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 59.41万
  • 项目类别:
Administrative Core
行政核心
  • 批准号:
    10382449
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 59.41万
  • 项目类别:
UCSF Environmental Research and Translation for Health Center (EaRTH Center)
加州大学旧金山分校健康中心环境研究与翻译(EaRTH 中心)
  • 批准号:
    10382448
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 59.41万
  • 项目类别:
Administrative Core
行政核心
  • 批准号:
    10598481
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 59.41万
  • 项目类别:
Discovery of novel environmental chemicals in a diverse population of maternal-infant pairs
在不同母婴群体中发现新型环境化学物质
  • 批准号:
    9355643
  • 财政年份:
    2016
  • 资助金额:
    $ 59.41万
  • 项目类别:
Discovery of novel environmental chemicals in a diverse population of maternal-infant pairs
在不同母婴群体中发现新型环境化学物质
  • 批准号:
    9157911
  • 财政年份:
    2016
  • 资助金额:
    $ 59.41万
  • 项目类别:
Discovery of novel environmental chemicals in a diverse population of maternal-infant pairs
在不同母婴群体中发现新型环境化学物质
  • 批准号:
    9768469
  • 财政年份:
    2016
  • 资助金额:
    $ 59.41万
  • 项目类别:
The UCSF Pregnancy Exposures to Environmental Chemicals (PEEC) Children's Center
加州大学旧金山分校怀孕期接触环境化学品 (PEEC) 儿童中心
  • 批准号:
    9320022
  • 财政年份:
    2013
  • 资助金额:
    $ 59.41万
  • 项目类别:

相似国自然基金

本体驱动的地址数据空间语义建模与地址匹配方法
  • 批准号:
    41901325
  • 批准年份:
    2019
  • 资助金额:
    22.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
时空序列驱动的神经形态视觉目标识别算法研究
  • 批准号:
    61906126
  • 批准年份:
    2019
  • 资助金额:
    24.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
针对内存攻击对象的内存安全防御技术研究
  • 批准号:
    61802432
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    25.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
大容量固态硬盘地址映射表优化设计与访存优化研究
  • 批准号:
    61802133
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    23.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
IP地址驱动的多径路由及流量传输控制研究
  • 批准号:
    61872252
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    64.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

The Proactive and Reactive Neuromechanics of Instability in Aging and Dementia with Lewy Bodies
衰老和路易体痴呆中不稳定的主动和反应神经力学
  • 批准号:
    10749539
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 59.41万
  • 项目类别:
Clonal hematopoiesis and inherited genetic variation in sickle cell disease
镰状细胞病的克隆造血和遗传变异
  • 批准号:
    10638404
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 59.41万
  • 项目类别:
Integrative genomic and functional genomic studies to connect variant to function for CAD GWAS loci
整合基因组和功能基因组研究,将 CAD GWAS 位点的变异与功能联系起来
  • 批准号:
    10639274
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 59.41万
  • 项目类别:
Mitral Regurgitation Quantification Using Dual-venc 4D flow MRI and Deep learning
使用 Dual-venc 4D 流 MRI 和深度学习对二尖瓣反流进行量化
  • 批准号:
    10648495
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 59.41万
  • 项目类别:
Transfer learning leveraging large-scale transcriptomics to map disrupted gene networks in cardiovascular disease
利用大规模转录组学的转移学习来绘制心血管疾病中被破坏的基因网络
  • 批准号:
    10696753
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 59.41万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了