Biospecimen Core for Procurement of Human Somatic and Reproductive Tissues for Senescent Cell Mapping

用于获取人体体细胞和生殖组织以进行衰老细胞图谱绘制的生物样本核心

基本信息

项目摘要

BIOSPECIMEN CORE - PROJECT SUMMARY Senescent cells play a role in development and disease. Because the cumulative exposure to senescence stimuli increases with time, senescent cells accumulate in aging tissues. Although senescent cells may be protective, they can also fuel aging and pathologic conditions through gene expression changes and acquisition of a Senescence Associated Secretory Phenotype (SASP). The SASP consists of altered secretion of cytokines, chemokines, growth factors, and proteases, which can cause chronic sterile inflammation and alter surrounding tissue structure and function. The overarching goal of our Tissue Mapping Center, via the coordinated efforts of the Administrative, Biospecimen, Biological Analysis, and Data Analysis Cores, is to generate a blueprint of cellular senescence using morphometric, proteomic and transcriptomic approaches at single cell resolution in three healthy human tissues: the ovary, breast, and skeletal muscle. The SASP will be interrogated in follicular fluid, the associated ovarian biofluid, through advanced proteomics. Moreover, we will evaluate the systemic SASP in matched urine and plasma samples. To this end, the Biospecimen Core will partner with Northwestern University, the Komen Tissue Bank, and Wake Forest University for the retrospective and prospective collection of tissues, matched fluids, and associated demographic and clinical data from consenting adults via IRB- approved protocols and procedures. Samples will include: ovarian tissue (N=50, 42-78y), follicular fluid (N=50, 27-45y), breast biopsies (N=66, 29-66y), and skeletal muscle biopsies (N=88, balanced for young (20-30y) and old (>70y) ages). Importantly, vastus lateralis (VL) muscle biopsies will be collected longitudinally 3 years apart from healthy males and females, and D3 creatine urine measurements will be used to correlate cellular senescence signatures with total body muscle mass. The Biospecimen Core will procure, curate, validate, and distribute tissues to the Biological Analysis Core and other SenNet Tissue Mapping Centers. Mapping senescent cells in ovary, breast, and muscle will provide the first insights into cellular senescence differences between reproductive and somatic tissues and will elucidate ubiquitous and tissue-specific signatures of cellular senescence. Moreover, these three tissues are relevant to aging because: 1) the ovary ages first in the human body and is associated with a fibro-inflammatory microenvironment, 2) the breast exhibits a strong SASP with aging and has a high fat content which often exhibits cellular senescence, and 3) skeletal muscle deterioration is associated with sarcopenia, the most common cause of age-related frailty, with the vastus lateralis being one of the first tissues affecting physical performance. The muscle biopsies will be obtained longitudinally, with the interval between repeated biopsies being the longest yet attempted in molecular studies on human aging in muscle in both sexes. Thus, we are well positioned to reveal the burden of cellular senescence across the lifespan in an unprecedented manner.
生物样本核心 - 项目摘要 衰老细胞在发育和疾病中发挥作用。因为累积暴露于衰老 随着时间的推移,刺激增加,衰老细胞在衰老组织中积累。尽管衰老细胞可能 它们具有保护作用,还可以通过基因表达的变化和获取来加速衰老和病理状况 衰老相关分泌表型(SASP)的研究。 SASP 由细胞因子分泌的改变组成, 趋化因子、生长因子和蛋白酶,可引起慢性无菌性炎症并改变周围环境 组织结构和功能。我们的组织作图中心的总体目标,通过协调努力 行政、生物样本、生物分析和数据分析核心,是为了生成一个蓝图 使用形态测量、蛋白质组学和转录组学方法以单细胞分辨率研究细胞衰老 三种健康的人体组织:卵巢、乳房和骨骼肌。 SASP 将在卵泡中进行询问 流体,相关的卵巢生物流体,通过先进的蛋白质组学。此外,我们还将评估系统性 匹配的尿液和血浆样本中的 SASP。为此,生物样本核心将与西北大学合作 大学、Komen 组织银行和维克森林大学进行回顾性和前瞻性收集 通过IRB收集来自同意的成年人的组织、匹配的液体以及相关的人口统计和临床数据 批准的协议和程序。样本将包括:卵巢组织(N=50、42-78y)、卵泡液(N=50、 27-45 岁)、乳腺活检(N=66、29-66 岁)和骨骼肌活检(N=88,针对年轻人(20-30 岁)和 高龄(>70 岁))。重要的是,股外侧肌 (VL) 肌肉活检将每隔 3 年纵向收集一次 来自健康男性和女性的 D3 肌酸尿液测量将用于关联细胞 衰老特征与全身肌肉质量。生物样本核心将采购、策划、验证和 将组织分发到生物分析核心和其他 SenNet 组织绘图中心。绘制衰老图 卵巢、乳房和肌肉中的细胞将首次深入了解不同类型细胞之间的细胞衰老差异 生殖和体细胞组织,并将阐明细胞的普遍存在和组织特异性特征 衰老。此外,这三种组织与衰老有关,因为:1)卵巢在人体中最先衰老。 身体并与纤维炎症微环境相关,2)乳房表现出强烈的 SASP 衰老和高脂肪含量通常会表现出细胞衰老,以及3)骨骼肌退化 与肌肉减少症有关,这是与年龄相关的衰弱的最常见原因,股外侧肌就是其中之一 第一个影响身体表现的组织。肌肉活检将纵向获得, 重复活检之间的间隔是人类衰老分子研究中迄今为止最长的尝试 男女都有肌肉。因此,我们有能力揭示整个细胞衰老的负担 寿命以前所未有的方式。

项目成果

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Francesca E. Duncan其他文献

Proteomic quantification of native and ECM-enriched mouse ovaries reveals an age-dependent fibro-inflammatory signature
天然和富含 ECM 的小鼠卵巢的蛋白质组学定量揭示了年龄依赖性纤维炎症特征
  • DOI:
    10.18632/aging.205190
  • 发表时间:
    2023-10-27
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Shweta S. Dipali;Christina D. King;Jacob P. Rose;Joanna E Burdette;Judith Campisi;Birgit Schilling;Francesca E. Duncan
  • 通讯作者:
    Francesca E. Duncan
The National Physicians Cooperative: transforming fertility management in the cancer setting and beyond
国家医师合作社:改变癌症及其他领域的生育管理
  • DOI:
    10.2217/fon-2018-0278
  • 发表时间:
    2018-11-26
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Brigid M. Smith;Francesca E. Duncan;Lauren M. Ataman;Kristin Smith;G. P. Quinn;R. J. Chang;Courtney Finlayson;Courtney Finlayson;Kyle E. Orwig;Hanna Valli;Molly B Moravek;M. Zelinski;M. Zelinski;H. I. Su;Wendy Vitek;James F. Smith;J. Jeruss;Clarisa R. Gracia;Christos Coutifaris;Divya K. Shah;L. Nahata;L. Nahata;V. Gomez;L. Appiah;R. Brannigan;Valerie Gillis;W. Gradishar;Asma Javed;A. Rhoton;L. Kondapalli;Evelyn Neuber;Jill P. Ginsberg;Charles H. Muller;J. Hirshfeld;William H. Kutteh;William H. Kutteh;S. Lindheim;B. Cherven;Lillian R. Meacham;Pooja Rao;Lilibeth Torno;Leonard S. Sender;S. Vadaparampil;Jodi Skiles;Jodi Skiles;Tara Schafer;Oliva J. Frias;Julia Byrne;L. M. Westphal;Danny J. Schust;J. Klosky;Kate McCracken;Kate McCracken;A. Ting;Zaraq Khan;C. Granberg;Barbara A. Lockart;Bert Scoccia;M. M. Laronda;M. M. Laronda;J. Mersereau;Courtney A. Marsh;M. Pavone;Teresa K. Woodruff
  • 通讯作者:
    Teresa K. Woodruff
Follicular fluid aids cell adhesion, spreading in an age independent manner and shows an age-dependent effect on DNA damage in fallopian tube epithelial cells
卵泡液有助于细胞粘附,以与年龄无关的方式扩散,并对输卵管上皮细胞的 DNA 损伤显示出年龄依赖性的影响
  • DOI:
    10.1016/j.heliyon.2024.e27336
  • 发表时间:
    2024-03-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    A. Salvi;Wenping Li;Shweta S. Dipali;S. Cologna;M. Pavone;Francesca E. Duncan;Joanna E. Burdette
  • 通讯作者:
    Joanna E. Burdette
Fertility Preservation
生育力保存
  • DOI:
    10.1016/b978-0-323-47912-7.00033-0
  • 发表时间:
    2024-09-14
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Francesca E. Duncan;Eve Feinberg;Robert E. Brannigan;Maxwell E Edmonds;Lauren M. Ataman;Teresa K. Woodruff
  • 通讯作者:
    Teresa K. Woodruff
Cumulus expansion is impaired with advanced reproductive age due to loss of matrix integrity and reduced hyaluronan
由于基质完整性丧失和透明质酸减少,随着生育年龄的增长,卵丘扩张会受到损害
  • DOI:
    10.1111/acel.14004
  • 发表时间:
    2023-11
  • 期刊:
  • 影响因子:
    7.8
  • 作者:
    E. Babayev;C. Suebthawinkul;Dilan Gokyer;Wendena S Parkes;Felipe Rivas;M. Pavone;Adam R Hall;Michele T. Pritchard;Francesca E. Duncan
  • 通讯作者:
    Francesca E. Duncan

Francesca E. Duncan的其他文献

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Upper Midwest Summit for Reproductive Science
上中西部生殖科学峰会
  • 批准号:
    10754090
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 87.87万
  • 项目类别:
Oocyte genomic instability as a driver of the aging ovarian innate immune response
卵母细胞基因组不稳定性是衰老卵巢先天免疫反应的驱动因素
  • 批准号:
    10278865
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 87.87万
  • 项目类别:
Biospecimen Core for Procurement of Human Somatic and Reproductive Tissues for Senescent Cell Mapping
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  • 资助金额:
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评估用于检测和验证体内衰老细胞的多种技术
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卵母细胞基因组不稳定性是衰老卵巢先天免疫反应的驱动因素
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    10684951
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    2021
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卵母细胞基因组不稳定性是衰老卵巢先天免疫反应的驱动因素
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    10470296
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    2021
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Homeostatic to reactive hyaluronan matrices in ovarian reproductive aging
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Oncofertility Consortium Annual Conference
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Oncofertility Consortium Annual Conference
肿瘤生育联盟年会
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基于单细胞核转录组测序揭示围产期奶牛脂肪过度动员组织微环境及其关键驱动因子
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Human Tissue Procurement and Processing Core
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Human Tissue Procurement and Processing Core
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