Mechanistic dissection of eukaryotic protein biogenesis and degradation pathways
真核蛋白质生物发生和降解途径的机制剖析
基本信息
- 批准号:10623737
- 负责人:
- 金额:$ 57.59万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2018
- 资助国家:美国
- 起止时间:2018-04-01 至 2028-06-30
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Abstract
My lab currently has two main areas of interest: 1) a new chaperone system (eFOLD) that enables biogenesis
of eukaryotic translation elongation factor 1 alpha (eEF1A); 2) endoplasmic reticulum (ER) and peroxisome
degradation by selective autophagy. Errors in eEF1A biogenesis result in rapid degradation by the
ubiquitin-proteasome system (UPS) thus making protein degradation a natural link between the two areas.
Both eFOLD and selective autophagy are controlled by distinct stress responses (e.g. heat shock vs. amino
acid starvation) but jointly serve as effectors of protein homeostasis (proteostasis). Both areas raise similar
questions regarding substrate selectivity: How does a specific eFOLD chaperone co-translationally recognize
an aggregation-prone region of eEF1A nascent chains? How is terminally misfolded eEF1A recognized for
degradation by the UPS? What signals on damaged or unwanted organelles are detected by specific
autophagy receptors to orchestrate encapsulation of organelle targets into autophagosomes? To answer
these questions, we are dissecting biogenesis and degradation mechanisms that select substrates of grossly
different sizes, respond to distinct physiological cues, and have widely different temporal dynamics. Using
yeast and human cell culture in parallel, we are exploring conserved aspects of eFOLD and selective
autophagy mechanisms shared by each species, as well as species-specific adaptations. Broadly speaking,
our projects spawn from identification of missing factors by genetic screening or biochemical purification but
all seek a deep mechanistic understanding of mutant phenotypes through biochemical reconstitution with
purified components and protein structure-function analysis. Along this path, we iteratively test our
hypotheses by genomics, quantitative cell microscopy, and theoretical modeling approaches.
抽象的
我的实验室目前有两个主要领域:1)一种新的伴侣系统(Eflold),可实现生物发生
真核翻译伸长因子1 alpha(EEF1A); 2)内质网(ER)和过氧化物组
选择性自噬降解。 EEF1A生物发生中的错误导致通过
泛素 - 蛋白酶体系统(UPS),从而使蛋白质降解成为两个区域之间的自然联系。
Eflold和选择性自噬都由明显的压力反应控制(例如热冲击与氨基
酸饥饿),但共同充当蛋白质稳态(蛋白质稳定)的效果。这两个领域都相似
有关底物选择性的问题:特定的Eflold伴侣如何共同识别
EEF1A新生链的一个容易发生区域?终端不折的EEF1A如何认可
UPS降解?特殊的损坏或不需要的细胞器的信号
自噬接收器可以将细胞器靶标封装到自噬体中?回答
这些问题,我们正在解剖生物发生和降解机制,这些机制选择了严重的底物
不同的大小,对不同的物理提示做出反应,并具有广泛不同的临时动力学。使用
我们正在探索酵母和人类细胞培养
每个物种共享的自噬机制以及特定于物种的适应性。从广义上讲,
我们的项目是由于遗传筛查或生化纯化而产生的,但
所有人都通过生化重构对突变表型寻求深刻的理解
纯化的成分和蛋白质结构功能分析。沿着这条路,我们迭代地测试
基因组学,定量细胞显微镜和理论建模方法的假设。
项目成果
期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

暂无数据
数据更新时间:2024-06-01
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