Regulation of Liver Metabolism by lncRNAs

lncRNA 对肝脏代谢的调节

基本信息

  • 批准号:
    9975166
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 7.73万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2019
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2019-07-09 至 2021-06-30
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Project Summary The current research proposal is to investigate the physiological function of Gm11967, a novel insulin-dependent long non-coding RNA (lncRNA) identified during my current K01 award. Despite ncRNAs accounting for a majority of the transcriptome, very little is known about their biological significance and functional targets. lncRNAs are a large and diverse class of RNA transcripts with a length of more than 200 nucleotides that do not encode proteins. To date, very few lncRNAs have been characterized in detail; however, recent work has suggested a potential role for lncRNA in metabolic disorders such as diabetes and obesity. Therefore, we re- analyzed genome-wide data sets generated during my K01 award to interrogate the role of hepatic insulin signaling on lncRNA expression to identify novel, metabolically regulated lncRNAs. We identified Gm11967 as one of the most significantly induced lncRNA in liver in vivo. Using mouse genetics, we demonstrated Gm11967 is downstream of the Akt-Foxo1 axis, a central signaling node involved in hepatic glucose and lipid metabolism. Gm11967 shares a transcription start site with glucokinase, a potent insulin-regulated gene that is the focus of my current K01. Given its robust activation with feeding, dependency on insulin action, and close association with glucokinase expression, we hypothesized that Gm11967 plays a central role in the regulation of hepatic glucose and lipid metabolism. We will perform gain and loss of function experiments in vivo to elucidate the biological function of Gm11967 in hepatocytes. In addition, we will perform chromatin isolation by RNA purification (ChIRP) followed by mass spectrometry and/or deep sequencing to identify functional proteomic and genomic targets of Gm11967. Based on my training and expertise obtained during the course of my K01, I have the independence and technical skillsets necessary to complete this proposal. Importantly, these data will build upon the strong foundation of my K01 and will enable new lines of investigation that will lead to a future R01 application.
项目摘要 当前的研究建议是研究GM11967的生理功能,GM11967是一种新型的胰岛素依赖性 在我当前的K01奖励期间确定的长期非编码RNA(LNCRNA)。尽管NCRNA占了 大多数转录组,对它们的生物学意义和功能靶标知之甚少。 lncRNA是一类大而多样的RNA转录本,长度超过200个核苷酸 编码蛋白质。迄今为止,很少有LNCRNA被详细描述。但是,最近的工作有 提出LNCRNA在糖尿病和肥胖等代谢疾病中的潜在作用。因此,我们重新 在我的K01奖中生成的分析基因组的数据集,以询问肝胰岛素的作用 LNCRNA表达上的信号传导,以识别新型的,代谢调节的LNCRNA。我们将GM11967确定为 体内肝脏中最显着诱导的LNCRNA之一。使用鼠标,我们证明了GM11967 是Akt-Foxo1轴的下游,这是一种参与肝葡萄糖和脂质代谢的中心信号传导节点。 GM11967与葡萄糖酶共享转录起始位点,葡萄糖酶是一种有效的胰岛素调节基因,是 我当前的K01。鉴于其通过喂养,依赖胰岛素​​作用和密切关联的强大激活 我们假设GM11967在肝的调节中起着核心作用 葡萄糖和脂质代谢。我们将在体内执行功能实验的增益和丧失,以阐明 GM11967在肝细胞中的生物学功能。另外,我们将通过RNA进行染色质分离 纯化(CHIRP),然后进行质谱和/或深度测序,以鉴定功能性蛋白质组学和 GM11967的基因组靶标。根据我在K01过程中获得的培训和专业知识,我有 完成此建议所需的独立性和技术技能。重要的是,这些数据将构建 在我的K01的强大基础上,将实现新的调查,这将导致未来的R01 应用。

项目成果

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