Cytokines and lineage choice in hematopoietic precursors
造血前体细胞的细胞因子和谱系选择
基本信息
- 批准号:8735141
- 负责人:
- 金额:$ 28.97万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2013
- 资助国家:美国
- 起止时间:2013-09-15 至 2016-06-30
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:AccountingAdultAftercareAliquotBlood CellsCD34 geneCD34+ precursorCSF3 geneCell Culture TechniquesCell LineageCell TherapyCell physiologyCellsDNA MethylationDataDevelopmentEmerging TechnologiesErythroidErythropoietinExposure toGene ExpressionGene Expression ProfileGene SilencingGenesGenetic TranscriptionGenomicsGlycophorin AGoalsGrantGranulocyte-Macrophage Colony-Stimulating FactorHarvestHematopoieticHematopoietic stem cellsHeterogeneityHigh-Throughput Nucleotide SequencingHourHumanIndividualInstructionLabelLengthMeasurementMeasuresMethylationMolecularMyelogenousNatureOligonucleotidesPatternPopulationProductionRepressionRoleSiteSorting - Cell MovementSpecificityStimulusTFRC geneTestingThrombopoietinTimeTranscriptUse of New Techniquescell typecytokineinsightmRNA Expressionmethod developmentperipheral bloodprecursor cellpublic health relevanceresearch studyresponsesingle cell analysistelomeretranscriptome sequencing
项目摘要
DESCRIPTION (provided by applicant): Human CD34+ hematopoietic precursor cells can readily be obtained from the peripheral blood of adults. Treatment of these cells with various cytokine cocktails can induce efficient production of cells differentiated along erythroid, megakaryocytic or myeloid lines. We find that different cytokine cocktails induce rapid and extensive patterns of change in gene expression that are different for different cytokine cocktails. The prominence of these changes suggests that they occur in a large fraction of the CD34+ cells and may modulate the patterns of differentiation of individual cells. The recent development of methods that permit global measurements of mRNA expression, and DNA methylation in single cells make it possible to investigate the role of cytokines in lineage promotion at a level of specificity hitherto unavailable. In the present application we propose to use a combination of single cell genomic scale analyses, and cell tagging and labeling approaches to establish if the same cell can respond differently to different cytokine treatments, and to investigate whether these different responses result in differentiation along alternate lineages. The ultimate goal is to determine the nature of early transcriptional responses to lineage specific cytokines and whether these are instructional as well as permissive for lineage specification.
描述(申请人提供):人CD34+造血前体细胞可以容易地从成人的外周血中获得。用各种细胞因子混合物处理这些细胞可以诱导沿红系、巨核细胞或骨髓系分化的细胞的有效产生。我们发现不同的细胞因子混合物会引起基因表达的快速而广泛的变化模式,而不同的细胞因子混合物的变化模式是不同的。这些变化的显着性表明它们发生在大部分 CD34+ 细胞中,并且可能调节单个细胞的分化模式。最近开发的方法允许对单细胞中的 mRNA 表达和 DNA 甲基化进行全面测量,使得以迄今为止无法达到的特异性水平研究细胞因子在谱系促进中的作用成为可能。在本申请中,我们建议结合使用单细胞基因组规模分析以及细胞标记和标记方法来确定同一细胞是否可以对不同的细胞因子治疗产生不同的反应,并研究这些不同的反应是否导致沿替代谱系的分化。最终目标是确定对谱系特异性细胞因子的早期转录反应的性质,以及这些对于谱系规范是否具有指导性和许可性。
项目成果
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