MACCHESS CONSORTIUM FOR SYNCHROTRON RADIATION IN MOLEC MED: TCR, MHC

MOLEC MED 同步辐射的 MACCHESS 联盟：TCR、MHC

• 批准号: 6339166
• 负责人: DON C WILEY
• 金额: $ 2.23万
• 依托单位: CORNELL UNIVERSITY
• 依托单位国家: 美国
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 美国
• 起止时间: 2000-08-15 至 2001-08-14
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://reporter.nih.gov/project-details/6339166
• 关键词: bioimaging /biomedical imaging; biological products; biomedical resource; proteins; radiography; structural biology

We have now been able to freeze all the virus crystals mentioned below. Thus, nearly all our data this year were of frozen crystals. This created vast new possibilities. In the past, we have had to use one new crystal every two to six exposures (depending on the crystals). Now we can collect a whole data set (often almost 500 exposures) with a single crystal. That makes possible a vast new array of experiments with mutants and ligands that were not readily possible previously. (a) Parvoviruses The following conditions were explored for feline and canine parvoviruses. (i) pH changes from 5.5 to 7.2. This alters the ability to hemagglutinate, in other words, alters the ability of the virus to bind to specific receptors in the Rhesus monkey erythrocytes. (ii) The effect of Ca2+ ions. These ions are associated with changes of conformation of the hemagglutinating loop on the viral surface. (iii) Soaking and co-crystallization with various sialic acids, which are the terminal carbohydrate residues used by the virus in binding host cells. We have also obtained some initial diffraction patterns of porcine parvovirus capsids assembled in a baculovirus expression system. (b) Picornaviruses We have collected complete data sets of some antiviral compounds bound to human rhinovirus 16 (HRV16). We have collected complete data sets of some drug-dependent HRV16 mutants. These viruses are unstable in the absence of drug. We collected some MAD data on ICAM-1, the receptor to the major group of rhinoviruses. We solved this structure and have fitted the structure into cryo-EM reconstructions of the complex of ICAM-1 with HRV16. This is the first atomic resolution study of a proteinaceous receptor interaction with a virus. We obtained some initial results on crystals of encephalomyocarditis virus. (c) Microviridae We have collected a partial, relatively low resolution data set of a3, an E. coli bacteriophage homologous to fX174. (d) Other Results We collected data on crystals of a mutant of the "whisker" protein of phage T4 (this was "warm" data). We obtained initial results of crystals of the prolate head of phage f2

我们现在已经能够冷冻所有提到的病毒晶体 以下。 因此，我们今年几乎所有的数据都是冷冻晶体。 这创造了巨大的新可能性。 过去，我们不得不使用 每两到六次曝光一颗新晶体（取决于 晶体）。 现在我们可以收集整个数据集（通常接近 500 曝光）与单晶。 这使得一个巨大的新的 一系列不易完成的突变体和配体实验 以前可能。 (a) 细小病毒 下列条件是 探索猫科动物和犬科动物细小病毒。 (i) pH 值从 5.5 变化 至 7.2。 这改变了血凝的能力，换句话说， 改变病毒与特定受体结合的能力 恒河猴红细胞。 (ii) Ca2+离子的影响。 这些离子 与血凝构象的变化有关 病毒表面形成环。 (iii) 浸泡和共结晶 各种唾液酸，它们是末端碳水化合物残基 病毒用于结合宿主细胞。 我们还获得了一些 猪细小病毒衣壳组装的初始衍射图 在杆状病毒表达系统中。 (b) 小核糖核酸病毒 我们有 收集了一些抗病毒化合物的完整数据集 人鼻病毒 16 (HRV16)。 我们收集了完整的数据集 一些药物依赖性 HRV16 突变体。 这些病毒在体内不稳定 没有药物。 我们收集了一些关于 ICAM-1（受体）的 MAD 数据 主要的鼻病毒组。 我们解决了这个结构并得到了 将结构拟合到复杂的冷冻电镜重建中 ICAM-1 与 HRV16。 这是首次原子分辨率研究 蛋白质受体与病毒的相互作用。 我们获得了一些 脑心肌炎病毒晶体的初步结果。 (三) 微病毒科 我们收集了部分、分辨率相对较低的 a3 的数据集，一种与 fX174 同源的大肠杆菌噬菌体。 (四) 其他结果 我们收集了有关突变体晶体的数据 噬菌体 T4 的“晶须”蛋白（这是“温”数据）。 我们得到了 噬菌体f2扁长头晶体的初步结果