動的経路分岐を記述する化学反応速度論の開発と反応経路網の速度論的解析への展開
发展化学反应动力学来描述动态路径分叉以及发展反应路径网络的动力学分析
基本信息
- 批准号:22KJ0018
- 负责人:
- 金额:$ 1.41万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2023
- 资助国家:日本
- 起止时间:2023-03-08 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
当該年度は、動的経路分岐の自動探索手法の拡張と、有機化学反応における新奇動的経路分岐探索への適用を行った。研究代表者が以前に開発した動的経路分岐探索手法は、反応経路自動探索法の一つである人工力誘起反応(AFIR)法を基盤とする。AFIR法は反応物分子に様々な人工力を加え、反応物周りの様々な反応経路を探索する。探索手法は、AFIR法がたどる複数の経路が1つの共通の遷移状態(TS)を経由する場合を見つけ出すことで、動的経路分岐の探索を行う。この手法が、既報の動的経路分岐探索において有効であることを以前の研究において示してきたが、mechanical stressの付加や置換基修飾によって新たに発生する動的経路分岐にも適用可能であるかに関する知見は無かった。この問題を解決すべく、当該年度は動的経路分岐の発生機構の解明と、探索手法の改善を行った。まず、過去に報告された動的経路分岐の反応経路上で振動解析を行うことで、動的経路分岐の発生機構を明らかにした。次に、発生機構に基づき改良した探索手法を、動的経路分岐が報告されていない有機化学反応に適用し、その有効性を検討した。その結果、以前の手法では見落とされていた動的経路分岐を探索できることが明らかになった。さらに、動的経路分岐が起こる反応と起こらない反応を判別することが可能であることも示された。またその違いがポテンシャル面の形状で説明できることも明らかとなった。この結果は現在論文投稿の準備を進めている。
今年,我们扩展了动态路径分叉的自动搜索方法,并将其应用于有机化学反应中新型动态路径分叉搜索。课题负责人此前开发的动态路径分支搜索方法是基于人工力诱导反应(AFIR)方法,是一种自动反应路径搜索方法。 AFIR方法对反应物分子施加各种人工力,并搜索反应物周围的各种反应路径。该搜索方法通过查找 AFIR 方法遵循的多条路径经过一个公共过渡状态 (TS) 的情况来搜索动态路径分叉。先前的研究表明,该方法对于寻找已报道的动态路径分支是有效的,但它是否也适用于由于机械应力的添加或取代基的修改而新出现的动态路径分支?这。为了解决这个问题,今年我们致力于阐明动态路径分叉发生的机制并改进搜索方法。首先,我们通过对过去报道的动态路径分叉的反应路径进行振动分析,阐明了动态路径分叉发生的机制。接下来,我们将基于生成机制的改进搜索方法应用于尚未报道动态路径分岔的有机化学反应,并检验其有效性。结果表明,探索以前方法忽略的动态路线分叉点是可能的。此外,研究表明,可以区分导致动态路径分叉的反应和不导致动态路径分叉的反应。很明显,这种差异可以通过势面的形状来解释。目前正在准备将结果发表在一篇论文中。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Kinetic simulation of an intramolecular Diels-Alder reaction based on a reaction path network and ab initio molecular dynamics
基于反应路径网络和从头算分子动力学的分子内 Diels-Alder 反应动力学模拟
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Takuma Ito; Satoshi Maeda; Yu Harabuchi
- 通讯作者:Yu Harabuchi
反応経路網と第一原理分子動力学計算に基づく分子内Diels-Alder反応の速度論解析
基于反应路径网络和第一原理分子动力学计算的分子内Diels-Alder反应动力学分析
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:伊藤琢磨;原渕祐;前田理
- 通讯作者:前田理
動的経路分岐を含む反応経路網の構築と速度論解析:分子内Diels-Alder反応への応用
反应途径网络的构建,包括动态途径分支和动力学分析:在分子内Diels-Alder反应中的应用
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:伊藤琢磨;原渕祐;前田理
- 通讯作者:前田理
Kinetic simulation of chemical reactions including dynamical bifurcations: Application to an intramolecular Diels-Alder reaction
包括动态分岔在内的化学反应的动力学模拟:在分子内第尔斯-阿尔德反应中的应用
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:伊藤琢磨;前田理;原渕祐
- 通讯作者:原渕祐
Kinetic Analysis of a Reaction Path Network Including Ambimodal Transition States: A Case Study of an Intramolecular Diels?Alder Reaction
包括双峰过渡态的反应路径网络的动力学分析:分子内狄尔斯?阿尔德反应的案例研究
- DOI:10.1021/acs.jctc.1c01297
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:5.5
- 作者:Ito Takuma;Maeda Satoshi;Harabuchi Yu
- 通讯作者:Harabuchi Yu
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伊藤 琢磨其他文献
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