血中exosome内circRNA発現解析による膵癌の診断・予後関連マーカー探索

通过分析血液外泌体中circRNA的表达寻找与胰腺癌诊断和预后相关的标志物

• 批准号: 22K08789
• 负责人: 柿坂 達彦
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K08789/
• 关键词: 膵癌; バイオマーカー; exosome; circular RNA

膵癌は早期発見が困難で進行した状態で診断されることが多く、予後不良な疾患である。本研究では、膵癌患者血清中に分泌されるexosomeを単離し、exosome内に存在する膵癌患者固有のcircular RNA (exo-circRNA) を同定することで、早期診断マーカーあるいは予後マーカーとしての意義を明らかすることを目的としている。具体的には以下の3点である。① public datasetの解析による膵癌患者特異的なexo-circRNAの同定、② 膵癌血清臨床検体を用いたexo-circRNAの測定、③ 膵癌患者の臨床病理学的情報とexo-circRNA発現量を比較し、バイオマーカーとしての意義を検討まず、①に関して解析を進めた。膵癌患者(GSE100232)、肝細胞癌患者(GSE100207)、大腸癌患者(GSE100063)、健常者(GSE100206)の4群の血液中exo-circRNAに関するpublic datasetの統計解析を行い、膵癌患者で有意に発現が変動しているexo-circRNAを36個検出した(p<0.01)。今後、発現量などからexo-circRNAの数を絞り込んでいき、有用なバイオマーカーを同定する予定である。並行して、②に関して予備実験を行った。臨床検体の血清からexosomeを抽出し、さらにそこからRNAを抽出する実験系を確立することを試みているが、RNAの収量が少なく時間を要している状態である。実験系が確立した後、③に関して膵癌患者の臨床病理学的情報とexo-circRNA発現量を比較し、診断あるいは予後マーカーとしての意義を検討していく予定である。

胰腺癌是一种预后不良的疾病，因为它很难早期发现，而且往往在晚期才被诊断出来。在本研究中，我们分离了胰腺癌患者血清中分泌的外泌体，并鉴定了外泌体内存在的胰腺癌患者特有的环状RNA（exo-circRNA），从而阐明了它们作为早期诊断标志物或预后标志物的意义。到。具体来说，有以下三点。 ①通过分析公共数据集鉴定胰腺癌患者特异性的exo-circRNA；②使用临床胰腺癌血清样本测量exo-circRNA；③比较胰腺癌患者的临床病理信息和exo-circRNA表达水平，考察其作为诊断的意义。生物标志物 首先，我们对①进行分析。我们对四组患者血液中的外切环状RNA的公共数据集进行了统计分析：胰腺癌患者（GSE100232）、肝细胞癌患者（GSE100207）、结直肠癌患者（GSE100063）和健康受试者（GSE100206），发现我们检测到 36 个 exo-circRNA 具有不同的值（p<0.01）。未来，我们计划根据表达水平和其他因素缩小exo-circRNA的数量，并鉴定有用的生物标志物。与此同时，我们对②进行了初步实验。我们正在尝试建立一个实验系统，从临床样本的血清中提取外泌体，并从中提取RNA，但RNA的产量很小，而且需要时间。实验系统建立后，我们计划比较胰腺癌患者的临床病理信息与③的exo-circRNA表达水平，并检验其作为诊断或预后标志物的意义。