網羅的遺伝子発現解析・エピゲノム解析に基づくＡ型胃炎の分子機構の解明

基于综合基因表达分析和表观基因组分析阐明A型胃炎的分子机制

• 批准号: 22K08073
• 负责人: 新美 惠子
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K08073/
• 关键词: A型胃炎; 網羅的遺伝子発現解析; メチル化アレイ; 慢性胃炎; 胃癌; Ａ型胃炎; メチル化解析

多施設共同研究の症例集積がCOVID-19の世界的な感染拡大の影響で難航したが、2023年3月までに、A型胃炎32例、ピロリ感染胃炎18例、正常胃12例の検体集積が完了し、全RNAとゲノムDNAの抽出が完了した。このうち、メチル化アレイを計30例に対して、mRNAマイクロアレイを計36例に対して、miRNAマイクロアレイを計9例に対して、施行した。メチル化アレイについては、世界初のA型胃炎の胃粘膜におけるメチル化状態を解析する研究であり、慢性持続する自己免疫機序による炎症の結果、胃上皮細胞に高度なメチル化状態が誘導されることを発見した。また、メチル化の標的遺伝子として、細胞周期やp53経路に関連する重要な遺伝子のメチル化が起こっていることが確認され、その結果、腫瘍発生リスクを上昇させている可能性が高いことを見出した。ピロリ感染胃炎でも同様の過剰なメチル化が進むことがすでに報告されており、A型胃炎も同様の機序が考えられたが、２つの慢性胃炎では浸潤する炎症細胞の主体が異なっており、メチル化が誘導される遺伝子群も、炎症細胞の違いを反映すると考えられる一定の傾向の違いが認められた。こうしたメチル化の状態の違いが、同じ慢性胃炎ではあっても、発癌ポテンシャルを含めた「A型胃炎とピロリ感染胃炎の病態の違い」を反映していることが示唆された。これらの結果は、Journal of Gastroenterology誌（2022, 57:144-155）に英文原著論文として報告した。現在、ひき続き、mRNAマイクロアレイとmiRNAマイクロアレイの解析を継続しており、前者は36例のmRNA発現データが、後者は9例のmiRNA発現データがすでに得られている。現在はこの結果に基づくバイオインフォマティクス解析、発現解析、ならびに、分子生物学的な実験を進めている。

由于COVID-19在全球传播，多中心联合研究的病例收集被推迟，但到2023年3月，我们已收集了32例A型胃炎、18例幽门螺杆菌感染性胃炎和12例幽门螺杆菌胃炎的标本。正常胃已完成，总RNA和基因组DNA的提取已完成。其中，甲基化芯片共30例，mRNA微阵列共36例，miRNA微阵列共9例。关于甲基化阵列，这是全球首次分析A型胃炎胃粘膜甲基化状态的研究，发现由于长期持续的自身免疫引起的炎症，胃上皮细胞中诱导出高度甲基化状态。我发现了这一点。此外，已证实与细胞周期和p53途径相关的重要基因作为甲基化的靶基因被甲基化，因此，这可能会增加肿瘤发生的风险。已有报道在幽门螺杆菌感染的胃炎中发生类似的高甲基化，并且认为A型胃炎也发生类似的机制，但在两种慢性胃炎病例中主要浸润的炎症细胞也存在一定差异。诱导甲基化的基因组趋势存在差异，这被认为反映了炎症细胞的差异。有人认为，甲基化状态的这些差异反映了“A 型胃炎和幽门螺杆菌感染胃炎之间的病理生理学差异”，包括致癌潜力，尽管它们都是慢性胃炎。这些结果作为英文原文论文发表在《胃肠病学杂志》(2022, 57:144-155) 上。目前，我们正在继续分析mRNA微阵列和miRNA微阵列，已获得前者36例mRNA表达数据，后者9例miRNA表达数据。基于这些结果，我们目前正在进行生物信息学分析、表达分析和分子生物学实验。

项目成果

Autoimmune gastritis induces aberrant DNA methylation reflecting its carcinogenic potential.

自身免疫性胃炎会诱发异常 DNA 甲基化，反映其致癌潜力。

• DOI: 10.1007/s00535-021-01848-2
• 发表时间: 2022
• 作者: Chihiro Takeuchi; Junichi Sato; Satoshi Yamashita; Akiko Sasaki; Takemi Akahane; Rika Aoki; Mitsue Yamamichi; Yu
• 通讯作者: Yu