メタボロミクス解析とSingle Cell解析による膵癌間質内代謝物質分布の解明

通过代谢组学分析和单细胞分析阐明胰腺癌基质中的代谢物分布

• 批准号: 22K07171
• 负责人: 寅田 信博
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K07171/
• 关键词: Single Cell解析; 癌間質相互作用; 膵癌; エネルギー代謝; Single Cell遺伝子発現解析; メタボロミクス解析

膵癌は癌の中でもっとも予後不良な疾患の一つであり、5年生存率はわずか8％である。膵癌に対する有効な新規治療法の開発は緊急の課題であり、社会的要求度が高い。これまで手術切除標本を用いた研究が数多く行われ、莫大なゲノム解析やRNAや蛋白など網羅的なデータを得ることができているが、研究の対象は腫瘍組織の増殖を支持する間質細胞にも広がっている。本研究では、間質細胞からの代謝物供給、腫瘍細胞における代謝物利用について、Single Cell遺伝子発現解析や質量分析による関連遺伝子発現から解明を目指すものである。膵臓癌の間質相互作用について、膵癌細胞株SUIT-2単培養とCAF共培養に対してGEM投与、非投与の4群をSingle Cell遺伝子発現解析で比較したところ、共培養群腫瘍細胞の3つのクラスターで、細胞周期G2M/S比が高く、細胞分裂・DNA複製が活性していることが示唆され、CAFが治療抵抗性に寄与する可能性を示した。また、CAFについて、非充実型低分化腺癌胃癌の炎症性CAFとmyoblastic CAFのSingle Cell遺伝子発現解析による比較を行ったところ、炎症性CAFにおいて、免疫抑制機能関連遺伝子の発現が高値であり、充実型低分化腺癌胃癌の炎症性CAFよりも腫瘍促進やEMTに関連する遺伝子発現が有意に高値であることを明らかにし、免疫抑制環境の形成に重要な役割を果たしている可能性を示した。また、胃癌細胞の代謝に関するSingle Cell遺伝子発現解析での検討において、腫瘍促進関連遺伝子の発現と酢酸代謝亢進の関連を示唆する結果が得られており、今後、膵癌での検討を進める予定である。

胰腺癌是预后最差的癌症之一，五年生存率仅为 8%。开发胰腺癌新的有效治疗方法是一个紧迫的问题，具有很高的社会需求。许多研究都是利用手术切除的标本进行的，并获得了大量的基因组分析和RNA、蛋白质等综合数据，但研究的目标也是支持肿瘤组织生长的基质细胞。传播到在本研究中，我们旨在通过单细胞基因表达分析和使用质谱的相关基因表达来阐明基质细胞代谢物的供应以及肿瘤细胞中代谢物的利用。关于胰腺癌中的间质相互作用，进行单细胞基因表达分析以比较4组胰腺癌细胞系SUIT-2单独培养和CAF共培养与GEM施用和未施用的两个簇中的细胞周期G2M/S。比率较高，表明细胞分裂和 DNA 复制活跃，表明 CAF 可能导致治疗耐药性。此外，当将 CAF 与非实体低分化腺癌胃癌中炎症性 CAF 和成肌细胞性 CAF 的单细胞基因表达分析进行比较时，我们发现炎症性 CAF 中与免疫抑制功能相关的基因表达较高。在实体低分化腺癌胃癌中，其肿瘤促进作用和EMT显着高于炎症性CAF，表明其可能在免疫抑制环境的形成中发挥重要作用。此外，在胃癌细胞代谢的单细胞基因表达分析中，获得了提示肿瘤促进相关基因的表达与高乙酸代谢之间关系的结果，我们计划在胰腺癌中进一步研究这一点。

项目成果

シングルセル解析を用いた食道癌内Bリンパ球サブタイプのheterogeneityの解明

使用单细胞分析阐明食管癌中 B 淋巴细胞亚型的异质性

• 发表时间: 2022
• 作者: 中村祥一;大内田研宙;堤親範;久野恭子;奥田翔;大坪慶志輝;寅田信博;水内祐介;進藤幸治;仲田興平;森山大樹;中村雅史
• 通讯作者: 中村雅史

Single cell RNA sequenceを用いた家族性大腸腺腫症各発がん段階のCD4+ Tcellの比較

使用单细胞 RNA 测序比较家族性腺瘤性息肉病各个阶段的 CD4+ T 细胞

• 发表时间: 2022
• 作者: 久野恭子;水内祐介;大内田研宙;堤親範;中村祥一;奥田翔;大坪慶志輝;寅田信博;佐田政史;田村公二;永吉絹子;進藤幸治;仲田興平;森山大樹;中村雅史
• 通讯作者: 中村雅史

Single‐cell transcriptome analysis reveals functional changes in tumour‐infiltrating B lymphocytes after chemotherapy in oesophageal squamous cell carcinoma

单细胞转录组分析揭示食管鳞状细胞癌化疗后肿瘤浸润B淋巴细胞的功能变化

• DOI: 10.1002/ctm2.1181
• 发表时间: 2023
• 影响因子: 10.6
• 作者: Nakamura S; Ohuchida K; Ohtsubo Y; Yamada Y; Tsutsumi C; Okuda S; Hisano K; Mochida Y; Shinkawa T; Iwamoto C; Torata N; Mizuuchi Y; Shindo K; Nakata K; Moriyama T; Torisu T; Nagai E; Morisaki T; Kitazono T; Oda Y; Nakamura M
• 通讯作者: Nakamura M

食道扁平上皮癌TMEのTregに対し術前化学療法が及ぼす影響についての解析

食管鳞癌TME术前化疗对Treg细胞的影响分析

• 发表时间: 2022
• 作者: 奥田翔;大内田研宙;堤親範;中村祥一;久野恭子;持田郁己;大坪慶志輝;新川智彦;寅田信博;水内祐介;進藤幸治;森山大樹;仲田興平;中村雅史
• 通讯作者: 中村雅史