Phylogeography of dipterocarp species based on whole chloroplast genome sequencing

基于全叶绿体基因组测序的龙脑香科植物系统发育地理学

• 批准号: 22K06374
• 负责人: 上谷 浩一
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Ehime University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K06374/
• 关键词: フタバガキ科; 東南アジア; 熱帯雨林; 葉緑体ゲノム; 遺伝的多様性; 系統地理; 葉緑体塩基配列

本研究では，従来の短いDNA配列解析からは不明瞭であったフタバガキ科樹木の分布域形成の歴史を解明するために，フタバガキ科主要3種の葉緑体全ゲノムデータを解析することで，遺伝的多様性の地理的分布を明らかにする。初年度は，これまでに採取したDNAサンプルの精製および乾燥標本からのDNAの再調整をおこなった。次世代シーケンシング用サンプルの調整に十分なDNA量を満たしていないサンプルが多数あったが，当初の予定していたフタバガキ科主要3種以外の種を含む複数種のDNAサンプルの準備が完了した。

在本研究中，为了阐明传统短DNA序列分析尚不清楚的龙脑香科树种分布范围的形成历史，我们分析了龙脑香科三种主要物种的全叶绿体基因组数据，揭示了龙脑香科树种的地理分布。遗传多样性。第一年，我们纯化了迄今为止收集的DNA样本，并对干燥标本中的DNA进行了重新调整。尽管有很多样本没有足够的DNA来制备用于下一代测序的样本，但按照原计划完成了包括龙脑香科三个主要物种以外的物种的DNA样本的制备。

项目成果

MIG-seq法を用いたフタバガキ科樹木セラヤの遺伝的変異と集団構造の評価

利用 MIG-seq 方法评价龙脑香树 Celaya 的遗传变异和种群结构

• 发表时间: 2023
• 作者: 小笠原実里・Cobb AR・Sukri RS・Metali F・田中憲蔵・米田令仁・Azani MA・Lum SKY・上谷浩一

Community phylogeny and spatial scale affect phylogenetic diversity metrics in a species‐rich rainforest in Borneo

群落系统发育和空间尺度影响婆罗洲物种丰富的雨林的系统发育多样性指标

• DOI: 10.1002/ece3.9536
• 发表时间: 2022
• 影响因子: 2.6
• 作者: Okuno Seiya;Yin Tingting;Nanami Satoshi;Matsuyama Shuhei;Kamiya Koichi;Tan Sylvester;Davies Stuart J.;Mohamad Mohizah;Yamakura Takuo;Itoh Akira
• 通讯作者: Itoh Akira

Genetic structure and population history of a peat swamp forest tree species, Shorea albida (Dipterocarpaceae), in Brunei Darussalam

文莱达鲁萨兰国泥炭沼泽森林树种 Shorea albida（龙脑香科）的遗传结构和种群历史

• 发表时间: 2023
• 影响因子: 1.1
• 作者: Misato Ogasahara; Ale;er R. Cobb; Rahayu Sukmaria Sukri; Faizah Metali; Koichi Kamiya
• 通讯作者: Koichi Kamiya

Leaf morphological traits of nine major tropical trees of Shorea species (Dipterocarpaceae)

龙脑香科九种主要热带乔木的叶片形态特征

• DOI: 10.13057/biodiv/d240344
• 发表时间: 2023
• 作者: MUFARHATUN NUR;SUSILOWATI ARIDA;HILWAN IWAN;ARROFAHA NAWWALL;YULITA KUSUMADEWI SRI;DWIYANTI FIFI GUS;HIDAYAT ASEP;KAMIYA KOICHI;RACHMAT HENTI HENDALASTUTI
• 通讯作者: RACHMAT HENTI HENDALASTUTI

Morphological and molecular evidence of natural interspecific hybridization between Dyera polyphylla and D. costulata in Sumatra and Kalimantan

苏门答腊岛和加里曼丹岛重叶植物与多叶植物自然种间杂交的形态学和分子证据

• 发表时间: 2022
• 作者: Aulianisa EN; Siregar UJ; Siregar IZ; Hamzah H; Ogasahara M; Kamiya K
• 通讯作者: Kamiya K