Modeling and database development for complex glycans

复杂聚糖的建模和数据库开发

基本信息

批准号：
25330358
负责人：
Re Suyong
金额：
$ 3.16万
依托单位：
Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2013
资助国家：
日本
起止时间：
2013-04-01 至 2016-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Revised CHARMM carbohydrate force field for improved description of conformational diversity of N-glycans

修订的 CHARMM 碳水化合物力场改进了 N-聚糖构象多样性的描述

DOI：
发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
0
作者：
李秀栄;渡部茂久;二島渉;杉田有治
通讯作者：
杉田有治

Modeling the MAPK/ERK pathway under crowding environment by the combined multi-scale simulations.

通过组合多尺度模拟对拥挤环境下的 MAPK/ERK 通路进行建模。

DOI：
发表时间：
2015
期刊：
影响因子：
0
作者：
Suyong Re; Po;Yuji Sugita
通讯作者：
Yuji Sugita

A mosaic of water orientation structures at a neutral zwitterion lipid/water interface revealed by molecular dynamics simulations.

分子动力学模拟揭示了中性两性离子脂质/水界面处的水取向结构镶嵌。

DOI：
发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
0
作者：
李秀栄;二島渉;田原太平;杉田有治
通讯作者：
杉田有治

Joint Seminar between RIKEN and Glycoinformatics Young Scientist Community

RIKEN与糖信息学青年科学家团体联合研讨会

DOI：
10.4052/tigg.26.71
发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
0.3
作者：
Suyong Re
通讯作者：
Suyong Re

REMD-based prediction of structure and function of glycans

基于 REMD 的聚糖结构和功能预测

DOI：
发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
0
作者：
李秀栄;二島渉;渡部茂久;杉田有治
通讯作者：
杉田有治

DOI：
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作者：
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作者：
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Re Suyong其他文献

Molecular Basis for Two Stereoselective Diels-Alderases that Produce Decalin Skeletons

产生十氢化萘骨架的两种立体选择性狄尔斯-阿尔德酶的分子基础

DOI：
10.1002/anie.202106186
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Fujiyama Keisuke;Kato Naoki;Re Suyong;Kinugasa Kiyomi;Watanabe Kohei;Takita Ryo;Nogawa Toshihiko;Hino Tomoya;Osada Hiroyuki;Sugita Yuji;Takahashi Shunji;Nagano Shingo
通讯作者：
Nagano Shingo

Practical Protocols for Efficient Sampling of Kinase-Inhibitor Binding Pathways Using Two-Dimensional Replica-Exchange Molecular Dynamics

使用二维复制交换分子动力学对激酶抑制剂结合途径进行有效采样的实用方案

DOI：
10.3389/fmolb.2022.878830
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
5
作者：
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通讯作者：
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Molecular Basis for Two Stereoselective Diels-Alderases that Produce Decalin Skeletons

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DOI：
10.1002/anie.202106186
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
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通讯作者：
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DOI：
10.1002/anie.202106186
发表时间：
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期刊：
影响因子：
0
作者：
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通讯作者：
Nagano Shingo

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10.1002/anie.202106186
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Fujiyama Keisuke;Kato Naoki;Re Suyong;Kinugasa Kiyomi;Watanabe Kohei;Takita Ryo;Nogawa Toshihiko;Hino Tomoya;Osada Hiroyuki;Sugita Yuji;Takahashi Shunji;Nagano Shingo
通讯作者：
Nagano Shingo