パイオニア転写因子による再生エンハンサーのプライミング機構

先驱转录因子再生增强子的启动机制

基本信息

批准号：
22K06233
负责人：
越智陽城
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Yamagata University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

エンハンサーのプライミングとプライミングが維持されている状態 (Primed状態) は、細胞の運命を決定するプロセスにおいて極めて重要なステップである。再生エンハンサーを活性化させるには、なにより最初に閉じたクロマチンを開ける必要がある。これを担う転写因子はパイオニア転写因子と呼ばれるが、再生においていずれの転写因子がその役割を担うのか、それら因子がどのように再生エンハンサーのヌクレオソーム上の標的DNA配列を探索しオープニングに導きプライミングするのか、プライミングされた状態のエンハンサーに如何なる情報が加わると、標的遺伝子の転写が開始されるかなど、全く不明であり、解決すべき問題として残されている。この目的で、本研究課題は、損傷した組織を再生させるか否か、損傷後の細胞の運命決定のプロセスにおいて最初のステップであるクロマチンのオープニングを担うパイオニア転写因子の同定と、それら因子によるプライミング機構とプライムされた状態(Primed状態)から脱してPoised状態に向かうメカニズムを明らかにする。本年度は、オープンクロマチン領域にエンリッチしている転写因子結合モチーフのKLFファミリーに着目し、KLFファミリーのいずれが再生特異的なオープンクロマチン領域の活性化因子でるのか検討すると伴に、標的遺伝子の一つAdra1aについて阻害剤を用いて再生への影響を検討した。

增强子引发和维持的引发状态（Primed状态）是决定细胞命运过程中的关键步骤。为了激活再生增强剂，首先需要打开封闭的染色质。负责此的转录因子被称为先锋转录因子，但是哪些转录因子在再生中发挥作用，以及这些因子如何在再生增强子的核小体上寻找目标DNA序列并引导其打开并启动它呢？完全不清楚向引发的增强子添加什么信息来启动靶基因的转录，这仍然是一个有待解决的问题。为此，本研究项目旨在鉴定负责染色质开放的先锋转录因子，这是损伤后细胞命运决定过程的第一步，并确定这些因子的启动机制，并阐明其逃逸机制。启动状态并走向中毒状态。今年，我们重点关注富含开放染色质区域的 KLF 转录因子结合基序家族，并研究了 KLF 家族的哪些成员是开放染色质区域的再生特异性激活剂。我们使用抑制剂研究了 Adra1a 对再生的影响。。

项目成果

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Transgenic Xenopus laevis with a limb-specific shh enhancer, outlines the competence to express shh in regenerating limbs

具有肢体特异性 shh 增强子的转基因非洲爪蟾，概述了再生肢体中表达 shh 的能力

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Reimi Tada;Takuya Higashidate;Takanori Amano;Shoma Ishikawa;Saki Nara;Koshiro Ishida;Akane Kawaguchi;Haruki Ochi;Hajime Ogino;Nayuta Yakushiji-Kaminatsui;Joe Sakamoto;Yasuhiro Kamei;Koji Tamura;and Hitoshi Yokoyama
通讯作者：
and Hitoshi Yokoyama

McGovern Medical School(米国)

麦戈文医学院（美国）

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Retinoic acid control of pax8 during renal specification of Xenopus pronephros involves hox and meis3

原爪蟾肾脏特化过程中视黄酸对 pax8 的控制涉及 hox 和 meis3

DOI：
10.1016/j.ydbio.2022.10.009
发表时间：
2023
期刊：
Developmental Biology
影响因子：
2.7
作者：
Durant-Vesga Jennifer;Suzuki Nanoka;Ochi Haruki;Le Bouffant Ronan;Eschstruth Alexis;Ogino Hajime;Umbhauer Muriel;Riou Jean-Fran?ois
通讯作者：
Riou Jean-Fran?ois

全ゲノム動態解析が解き明かす腎再生におけるアドレナリンレセプターの役割

全基因组动力学分析揭示肾上腺素受体在肾脏再生中的作用

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
鈴木菜花;荻野肇;*越智陽城
通讯作者：
*越智陽城

Versatile utilities of amphibians (Part 3)

两栖动物的多功能用途（第 3 部分）

DOI：
10.1111/dgd.12829
发表时间：
2022
期刊：
Development, Growth & Differentiation
影响因子：
0
作者：
Michiue Tatsuo;Kato Takashi;Ochi Haruki;Zorn Aaron;Hayashi Toshinori;Inoue Takeshi;Kondo Mariko;Taira Masanori
通讯作者：
Taira Masanori