Comprehensive identification of abnormally spliced RNAs and elucidation of their significance

全面鉴定异常剪接的RNA并阐明其意义

• 批准号: 23510234
• 负责人: SAKAMOTO Hiroshi
• 金额: $ 3.49万
• 依托单位: Kobe University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23510234/
• 关键词: mRNA品質管理; 生殖細胞; エキソン連結部複合体; 細胞質スプライシング; 線虫; 異常スプライシング; 性決定遺伝子; RNA品質管理; 遺伝子; 核酸; ゲノム; 発現制御; 性決定

In Y14(RNAi) and mag-1(RNAi) animals, unspliced tra-2 RNA is leaked to the cytoplasm and unusually spliced to tra-2s RNA by the cytoplasmic splicing enzyme IRE-1. The protein produced from tra-2s RNA acts dominant-negatively against normal TRA-2 protein because transgenic animals expressing TRA-2s protein showed germline masculinization like Y14(RNAi) animals. Interestingly, the leakage of unspliced RNA caused by the inhibition of Y14 or MAG-1 was also observed for almost all genes examined so far. Moreover, inhibition of eIF4AIII and SAP130 also caused leakage of unspliced RNA to the cytoplasm. Double RNAi analysis indicated that Y14 interacts with both SAP130 and two other splicing-related factors. These results suggest that the EJC core subunits associate with pre-mRNA and function as the gatekeeper to watch and block premature export of unspliced RNA, thereby contributing to mRNA quality control in C. elegans.

在 Y14(RNAi) 和 mag-1(RNAi) 动物中，未剪接的 tra-2 RNA 泄漏到细胞质，并通过细胞质剪接酶 IRE-1 异常剪接为 tra-2s RNA。由 tra-2s RNA 产生的蛋白质对正常 TRA-2 蛋白质呈显性负向作用，因为表达 TRA-2s 蛋白质的转基因动物像 Y14(RNAi) 动物一样表现出种系雄性化。有趣的是，迄今为止检查的几乎所有基因中也观察到了由 Y14 或 MAG-1 的抑制引起的未剪接 RNA 的泄漏。此外，抑制 eIF4AIII 和 SAP130 也会导致未剪接的 RNA 渗漏到细胞质中。双 RNAi 分析表明 Y14 与 SAP130 和其他两个剪接相关因子相互作用。这些结果表明，EJC 核心亚基与前 mRNA 相关，并作为看门人来观察和阻止未剪接 RNA 的过早输出，从而有助于线虫中 mRNA 的质量控制。

项目成果

線虫C.elegansにおける生殖細胞形成に関与するクロモドメインタンパクMRG-1の局在機構の解析

线虫生殖细胞形成中染色质结构域蛋白MRG-1的定位机制分析

• 发表时间: 2014
• 作者: 巳波孝至;高崎輝恒;坂本博
• 通讯作者: 坂本博

MRG-1 acts as an epigenome interpreter of Lys36 methylation on histone H3

MRG-1 充当组蛋白 H3 上 Lys36 甲基化的表观基因组解释者

• 发表时间: 2013
• 作者: Teruaki Takasaki; Thea Egelhofer; Andreas Rechtsteiner; Hiroshi Sakamoto; Susan Strome
• 通讯作者: Susan Strome

線虫C.elegans生殖細胞におけるスプライシング関連タンパク質リン酸化酵素SPK-1の機能解析

秀丽隐杆线虫生殖细胞中剪接相关蛋白激酶SPK-1的功能分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 土橋匠;高崎輝恒;井上邦夫;坂本博
• 通讯作者: 坂本博

線虫C.elegansにおけるRNAの輸送経路を決める機構の解析

线虫RNA转运途径决定机制分析

• 发表时间: 2013
• 作者: 相澤理丞;井上邦夫;坂本博
• 通讯作者: 坂本博

Translational inhibition by deadenylation-independent mechanisms is central to microRNA-mediated silencing in zebrafish

不依赖去腺苷化机制的翻译抑制是斑马鱼 microRNA 介导的沉默的核心

• 发表时间: 2012
• 作者: Mishima; Y.; Fukao; A.; Kishimoto; T.; Sakamoto; H.; Fujiwara; T.; Inoue; K.
• 通讯作者: K.