Analysis on cell filament formation and phenotypic plasticity of Escherichia coli using micro fluid system : rapid adaptation

利用微流体系统分析大肠杆菌的细胞丝形成和表型可塑性：快速适应

• 批准号: 22657006
• 负责人: SHIMADA Masakazu
• 金额: $ 2.07万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22657006/
• 关键词: 1細胞培養計測系; マイクロ流路; 大腸菌; 細胞伸長; 表現型可塑性; 捕食回避説; 低密度良好説; 環境ストレス説; フィラメント形成; 細菌の進化生態学; 天敵の効果; 栄養条件

Using the on-chip one cell micro fluid system, we analyzed three potential factors affecting the cell filament formation of Escherichia coli ;(1) the enemy avoidance hypothesis,(2) the cell performance enhanced at a low density, and(3) the environmental stress. Either one factor or their combinations has/have been analyzed. First of all, we developed the device, so that too many growing cells can be automatically removed from the incubating area(Patent 2011-156767). Applying the device to the Tetrahymena-E. coli co-incubation system, we observed that the cell filament of E. coli forms when we used for two standard mediums for Tetrahymena(1/10PYG and CDM), even though we did not add Tetrahymena's pheromones at all.

利用芯片上的单细胞微流体系统，我们分析了影响大肠杆菌细胞丝形成的三个潜在因素：（1）避敌假说，（2）低密度下细胞性能增强，（3）环境压力。已经分析了一个因素或其组合。首先，我们开发了该装置，可以自动将过多生长的细胞从培养区移走（专利2011-156767）。将设备应用于四膜虫-E。在大肠杆菌共培养系统中，我们观察到，当我们使用两种四膜虫标准培养基（1/10PYG和CDM）时，即使我们根本不添加四膜虫信息素，大肠杆菌的细胞丝也会形成。

项目成果

Natural selection based on stochastic gene expression and generality of phenotypic adaptation

基于随机基因表达和表型适应的普遍性的自然选择

• 发表时间: 2011
• 作者: Wakamoto; Y
• 通讯作者: Y

Single-cell measurement toolbox for studying evolution of restriction-modification systems

用于研究限制性修饰系统进化的单细胞测量工具箱

• 发表时间: 2011
• 作者: Wakamoto; Y.
• 通讯作者: Y.

Optimal lineageprinciple for age-structured populations

年龄结构人群的最优谱系原则

• DOI: 10.1111/j.1558-5646.2011.01418.x
• 发表时间: 2012
• 影响因子: 3.3
• 作者: Wakamoto; Y.; Grosberg; A. Y.;Kussell; E.
• 通讯作者: E.

Multitude of morphologicaldynamics of giant multilamellar vesicles in regulated nonequilibriumenvironments

受调节的非平衡环境中巨型多层囊泡的多种形态动力学

• DOI: 10.1021/la2018456
• 发表时间: 2011
• 影响因子: 3.9
• 作者: Tomita; T.; Sugawara; T.; Wakamoto;Y.
• 通讯作者: Y.

Bacterial persistence based on epigenetically correlated gene expression

基于表观遗传相关基因表达的细菌持久性

• 发表时间: 2011
• 作者: Wakamoto; Y.
• 通讯作者: Y.