High resolution transcriptome analysis in protozoan parasites

原生动物寄生虫的高分辨率转录组分析

基本信息

批准号：
22780258
负责人：
YAMAGISHI Junya
金额：
$ 2.33万
依托单位：
Tohoku University (2012)Obihiro University of Agriculture and Veterinary Medicine (2010-2011)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至 2012
项目状态：
已结题

项目摘要

By using RNA-seq and TSS-seq which are one of the application of next generation sequencers, it becomes possible to obtain transcriptomes of wide variety of living organisms. We applied the methods on representative three stages which consist of lifecycle of an obligate, intracellular, parasitic protozoan, Toxoplasma gondii. As a result, we demonstrated gene expression profiles of the three stages as well as putative DNA cis-elements which regulate the gene expression.

通过使用下一代测序仪的应用之一的RNA-seq和TSS-seq，可以获得多种活体生物体的转录组。我们将这些方法应用于代表性的三个阶段，包括专性、细胞内、寄生原生动物弓形虫的生命周期。结果，我们展示了三个阶段的基因表达谱以及调节基因表达的假定 DNA 顺式元件。

项目成果

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专利数量（0）

Full-Toxoplasma

全弓形虫

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Protective effect of a prime-boost strategy with plasmid DNA followed by recombinant adenovirus expressing TgAMA1 as vaccines against Toxoplasma gondii infection in mice.

使用质粒 DNA 进行初免-加强策略，然后使用表达 TgAMA1 的重组腺病毒作为针对小鼠弓形虫感染的疫苗的保护作用。

DOI：
10.1016/j.parint.2012.04.001
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
1.9
作者：
Yu L
通讯作者：
Yu L

Full-parasites: database of full-length cDNAs of apicomplexa parasites, 2010 update

全寄生虫：apicomplexa 寄生虫全长 cDNA 数据库，2010 年更新

DOI：
10.1093/nar/gkq1111
发表时间：
2011-01
期刊：
影响因子：
0
作者：
Tuda J;Mongan AE;Tolba ME;Imada M;Yamagishi J;Xuan X;Wakaguri H;Sugano S;Sugimoto C;Suzuki Y
通讯作者：
Suzuki Y

Characterization of Toxoplasma gondii 5' UTR with encyclopedic TSS information

利用百科全书式的 TSS 信息表征弓形虫 5 UTR