遺伝的多様性の高い宿主-寄生者系での多様性維持機構と生態・進化動態の理論的解明

具有高遗传多样性的宿主-寄生虫系统多样性维持机制和生态/进化动力学的理论阐明

基本信息

  • 批准号:
    17J06741
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.83万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2017
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2017-04-26 至 2020-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

平成30年4月から9月末(長崎大学着任に伴う特別研究員辞退)までの半年間、バーゼル大学動物学研究所(スイス連邦)のDieter Ebert教授の研究室に滞在し、客員研究員として共同研究を実施した。Ebert教授は本研究課題の研究領域で世界をリードする研究者であり、彼と年次計画2年目の課題であるシミュレーション解析の方向性を打ち合わせた。同時に、打ち合わせた内容をシミュレーションモデルとして実装することで効率的に研究を推進することができた。まず当初の予定通り、ランダムな感染行列(相互作用)を1000個作成し、各々で再現される個体群動態を観察した。その際、どのような種間相互作用があるときに、何種のホストとパラサイトが生き残るかを記録した。これにより、ホストとパラサイトの共存種数と感染行列(相互作用)の関係を洗い出すことができる。特に大きな進展として、共存が成り立つときの相互作用の特性(NestednessとModularity)を計測し、この二つの指標(NestednessとModularity)から共存が成り立つ種間相互作用の条件が導かれた。具体的に言えば、シミュレーションの開始時から終了時に至るまでにNestednessは劇的に低下し、Modularityは分散(増加傾向)することで最終的な共存が固定されることが分かった。これにより遺伝的多様性の維持機構としての種間相互作用が実際にどのような構造を持つのかという問いに、ある程度の予測を提供できると考えている。特別研究員PDとしての役目を、計画時の半分(1年半)の期間で終えることとなったが、これまでの成果を無駄にすることなく、本研究課題は今後も継続して推進する予定である。なお本年度の発表業績としては、感染現象に着目している点で本課題とも共通する性感染症の数理モデルの発表など、合計7報の原著論文発表と、4回の学会発表を行った。
从2018年4月到9月底(长崎大学到来后拒绝了特别研究人员),他留在了巴塞尔大学(瑞士)动物学研究所的Dieter Ebert教授,在那里他作为访问者进行了联合研究。 Ebert教授是该研究主题研究领域的世界领先的研究人员,我们讨论了模拟分析的方向,这是年度计划的第二年。同时,通过将会议内容作为模拟模型实施,从而有效地促进了研究。首先,如最初计划的那样,创建了1,000个随机感染矩阵(相互作用),并观察到每个人的种群动态。在本文中,我们记录了存在哪些种间相互作用,以及有多少种宿主和寄生虫幸存下来。这允许宿主与寄生虫之间的共存物质与感染矩阵(相互作用)之间的关系。一个特别重要的进步是在发生共存(嵌套和模块化)时测量相互作用的特征,而这两个指标(嵌套和模块化)导致了共存发生共存(嵌套和模块化)的种间相互作用的条件。具体而言,发现嵌套从模拟的开始到结束时急剧下降,并且模块化分布(增加趋势),从而固定最终共存。我们认为,这可以为哪些结构间交互作用作为维持遗传多样性的机制的问题提供一些预测。尽管他在计划的一半时间(1。5年)中完成了特殊研究人员PD的角色,但他计划将来继续促进这一研究主题,而不会浪费迄今为止所做的结果。此外,今年演讲的结果总共包括七篇原始论文,包括针对性传播疾病的数学模型的介绍,这也是该问题的共同点,因为它着重于感染现象,以及在学术会议上共有四个演讲。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Density-dependent population model of effective release policy for Ayu fish
香鱼有效放流政策的密度依赖种群模型
  • DOI:
    10.1016/j.ecolmodel.2018.09.021
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Katsumata Yuki;Uehara Takashi;Ito Hiromu;Yoshimura Jin;Tainaka Kei-ichi;Ichinose Genki
  • 通讯作者:
    Ichinose Genki
University of Basel(スイス)
巴塞尔大学(瑞士)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Demography of sexually transmitted infections with vertical transmission
  • DOI:
    10.1016/j.amc.2018.12.002
  • 发表时间:
    2019-05-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Ito, Hiromu;Yamamoto, Taro;Morita, Satoru
  • 通讯作者:
    Morita, Satoru
Risk sensitivity of a forager with limited energy reserves in stochastic environments
随机环境中能量储备有限的采集者的风险敏感性
  • DOI:
    10.1111/1440-1703.1058
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2
  • 作者:
    城潤一郎;田畑泰彦;Hiromu Ito
  • 通讯作者:
    Hiromu Ito
Long-term persistence of agricultural pest insects by risk-spreading dispersal
通过风险扩散传播农业害虫的长期持续存在
  • DOI:
    10.1007/s11284-018-1615-z
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2
  • 作者:
    Maica Krizna Areja Gavina;Kotaro Aoki;Genki Ichinose;Jomar Fajardo Rabajante;Hiromu Ito;Satoru Morita;Vincent A. A. Jansen;Jin Yoshimura
  • 通讯作者:
    Jin Yoshimura
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伊東 啓其他文献

HTLV-1の蔓延リスク予測と最適な拡散防止戦略の構築
预测 HTLV-1 的传播风险并制定最佳的传播预防策略
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    村田 勇樹;城 潤一郎;田畑 泰彦;伊東 啓
  • 通讯作者:
    伊東 啓

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  • 发表时间:
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薬剤資源における「共有地の悲劇」の回避戦略:薬剤耐性の拡散防止社会の実現に向けて
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    23KK0210
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.83万
  • 项目类别:
    Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research)
社会的ジレンマが生み出す薬剤耐性菌の蔓延防止戦略
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  • 批准号:
    21H01575
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 2.83万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
多ホスト-多パラサイトモデルによる赤の女王仮説の検証と多様性維持機構の解明
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  • 批准号:
    16H07075
  • 财政年份:
    2016
  • 资助金额:
    $ 2.83万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
絶滅回避の進化戦略
避免灭绝的进化策略
  • 批准号:
    14J02983
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 2.83万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

相似国自然基金

长白山垂直带土壤动物多样性及其在凋落物分解和元素释放中的贡献
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    41171207
  • 批准年份:
    2011
  • 资助金额:
    85.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
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    40871120
  • 批准年份:
    2008
  • 资助金额:
    45.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

環境応答と生物間相互作用を考慮した群集の安定性と将来予測
考虑环境反应和生物相互作用的群落稳定性和未来预测
  • 批准号:
    22KJ0152
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.83万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Genomic Information Reveals Environmental Responses of Riverine Organisms: Conservation Focusing on Natural Selection and Functional Diversity
基因组信息揭示河流生物的环境响应:以自然选择和功能多样性为重点的保护
  • 批准号:
    22H01627
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 2.83万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
生息環境に応じて生じた生活史変異に駆動される遺伝動態:進化生態学の新展開
由生活史变化响应栖息地驱动的遗传动力学:进化生态学的新进展
  • 批准号:
    21J10814
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 2.83万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Evaluation for biodiversity and ecosystem services in the mega-cities
特大城市生物多样性和生态系统服务评价
  • 批准号:
    20K20002
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 2.83万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
遺伝と進化を関連付け現存生物の多様性と環境への適応を探究する学習プログラムの開発
开发一个将遗传学和进化论联系起来的学习计划,以探索现存生物的多样性及其对环境的适应。
  • 批准号:
    19H00099
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 2.83万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
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