生息環境に応じて生じた生活史変異に駆動される遺伝動態:進化生態学の新展開

由生活史变化响应栖息地驱动的遗传动力学:进化生态学的新进展

基本信息

  • 批准号:
    21J10814
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.96万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-28 至 2023-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

生物が生まれてから死ぬまでの一連の生命活動の過程を生活史という。本研究課題は北海道十勝地方に生息する多年生草本植物オオバナノエンレイソウを対象に、発芽してから成長・開花するまでの生活史過程に基づいて遺伝的多様性の時間変化を評価することを試みた。令和4年度は、まず12集団に2018年から設置している計41個の調査区において、個体モニタリング調査を継続することで、各集団の個体の生存・成長の成否や種子生産数を記録した。得られた4年分のモニタリングデータから、階層ベイズモデルの一種である統合個体群モデルを用いて、成長率や生存率、繁殖率などの生活史パラメーターを推定し、発芽してから開花・繁殖して種子が形成されるまでの生活史サイクルを明らかにした。次に、推定された生活史パラメーターの値に基づいて、昨年度構築した数理モデルを用いて各集団の遺伝的多様性の減少速度を理論的に予測した。最後に、得られた理論予測が、ddRAD-seq法で得られた一塩基多型データと一致するのかを検証した。その結果、理論予測と実データの間に不一致が見られ、理論予測では遺伝的多様性が高く維持されると考えられた集団でも、実際には遺伝的多様性の減少が進んでいることが示唆された。この原因として、野生の植物集団では、距離依存的な花粉・種子の分散や個体数変動があることで、実際に遺伝的に有効に集団として機能する個体数が、見かけ上の個体数よりもはるかに小さい可能性が示唆された。また実データから、発芽したばかりの実生段階から成熟した開花段階までの複数の生活史段階の間で、遺伝的多様性の高さが異なっていることが判明した。この結果は、減少しつつある野生集団の遺伝的多様性を維持する上で、特に重要な生活史段階が存在する可能性を示唆している。
从出生到死亡的一系列生活活动的过程称为生命史。这项研究挑战试图根据生活在北海道的Tokachi地区的多年生草书的发芽,增长和开花的生命过程来评估遗传多样性的时间变化。在一年中的第四年,在12个小组中,自2018年以来,总共有41个被调查的区域记录了每个小组的生存,增长和种子生产的生存和增长。从获得的四年监测数据中,我们使用分层贝叶斯模型的综合单个模型估算了生命历史参数,例如生长速率,生存率和繁殖率,并在发芽后发芽和繁殖。形成种子。接下来,根据估计的生活历史参数,去年建立的运动模型从理论上预测了每组遗传多样性的速度。最后,我们检查了获得的理论预测是否匹配了通过DDRAD-SEQ方法获得的一基数多个数据。结果,即使在理论预测和实际数据的群体中,该理论也预测了遗传多样性是高度维持的,遗传多样性的下降实际上也在减少。这个原因是,在野生植物群中,实际上作为一组花粉的个体数量在个体数量中起作用,依赖于遥远的花粉和种子的区别高于明显的人群有人建议它小得多。此外,实际数据表明,从新鲜发芽的种子到成熟的开花阶段,遗传多样性的高度不同。该结果表明,维持野生群体遗传多样性下降的生活历史阶段特别重要。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Genetic consequences of habitat fragmentation in a perennial plant Trillium camschatcense are subjected to its slow‐paced life history
多年生植物延龄草栖息地破碎化的遗传后果受到其缓慢生活史的影响
  • DOI:
    10.1002/1438-390x.12093
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    1.7
  • 作者:
    Tsuzuki Yoichi;Sato Mitsuhiko P.;Matsuo Ayumi;Suyama Yoshihisa;Ohara Masashi
  • 通讯作者:
    Ohara Masashi
Modeling temporal dynamics of genetic diversity in stage-structured plant populations with reference to demographic genetic structure
参考人口遗传结构对阶段结构植物种群遗传多样性的时间动态进行建模
  • DOI:
    10.1016/j.tpb.2022.11.001
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    1.4
  • 作者:
    Tsuzuki Yoichi;Takada Takenori;Ohara Masashi
  • 通讯作者:
    Ohara Masashi
How life history drives genetic diversity of fragmented perennial plant populations
生活史如何驱动零散的多年生植物种群的遗传多样性
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yoichi Tsuzuki;Mitsuhiko P. Sato;Takenori Takada;Masashi Ohara
  • 通讯作者:
    Masashi Ohara
Mathematical derivation of the temporal dynamics of genetic diversity in stage-structured plant populations gives population genetic insights into life history
阶段结构植物种群遗传多样性时间动态的数学推导为种群遗传提供了对生命史的洞察
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yoichi Tsuzuki;Takenori Takada;Masashi Ohara
  • 通讯作者:
    Masashi Ohara
多年生植物を対象にデモグラフィーと遺伝動態の接点を紐解く
揭示多年生植物的人口统计学和遗传动态之间的交叉点
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Sakata;N.;Ishiga;T. and Ishiga,Y.;都築洋一
  • 通讯作者:
    都築洋一
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使用结构化群体遗传动力学模型阐明生活史策略的进化后果
  • DOI:
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  • 期刊:
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    都築 洋一;高田 壯則;大原 雅
  • 通讯作者:
    大原 雅

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    2017
  • 资助金额:
    $ 0.96万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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