Elucidation of thermodynamic roles of hydration structure in protein functions

阐明水合结构在蛋白质功能中的热力学作用

基本信息

批准号：
17H04854
负责人：
Oroguchi Tomotaka
金额：
$ 16.47万
依托单位：
Keio University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
财政年份：
2017
资助国家：
日本
起止时间：
2017-04-01 至 2021-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17H04854/
关键词：
生体分子機能的構造変化水和構造溶媒和自由エネルギー分子動力学シミュレーション溶液散乱実験ベイズ統計蛋白質構造アンサンブル自由エネルギー地形 MDシミュレーション溶液X線散乱生体分子の機能発揮機構 X線回折散乱実験蛋白質分子蛋白質ダイナミックス X線散乱回折実験

项目摘要

项目成果

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专利数量（0）

Protein Structural Fluctuations Investigated by X-ray Solution Scattering and Molecular Dynamics Simulation

通过 X 射线溶液散射和分子动力学模拟研究蛋白质结构波动

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
0
作者：
苙口友隆;中迫雅由;T. Oroguchi
通讯作者：
T. Oroguchi

Energy landscape of domain motion in glutamate dehydrogenase deduced from cryo‐electron microscopy

DOI：
10.1111/febs.15224
发表时间：
2020-01
期刊：
The FEBS Journal
影响因子：
0
作者：
Mao Oide;Takayuki Kato;Tomotaka Oroguchi;M. Nakasako
通讯作者：
Mao Oide;Takayuki Kato;Tomotaka Oroguchi;M. Nakasako

MDシミュレーションと溶液散乱実験による蛋白質構造揺らぎの可視化: ベイズ学習の適用に向けて

使用 MD 模拟和溶液散射实验可视化蛋白质结构波动：迈向贝叶斯学习的应用

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
水戸毅;吉田章吾;苙口友隆
通讯作者：
苙口友隆

Diffraction apparatus and procedure in tomography X-ray diffraction imaging for biological cells at cryogenic temperature using synchrotron X-ray radiation

DOI：
10.1107/s1600577518012687
发表时间：
2018-11-01
期刊：
JOURNAL OF SYNCHROTRON RADIATION
影响因子：
2.5
作者：
Kobayashi, Amane;Takayama, Yuki;Torizuka, Yasufumi
通讯作者：
Torizuka, Yasufumi

Common structural features of toxic intermediates from α-synuclein and GroES fibrillogenesis detected using cryogenic coherent X-ray diffraction imaging

DOI：
10.1093/jb/mvw052
发表时间：
2017-01-01
期刊：
JOURNAL OF BIOCHEMISTRY
影响因子：
2.7
作者：
Kameda, Hiroshi;Usugi, Sayaka;Kawata, Yasushi
通讯作者：
Kawata, Yasushi

DOI：
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作者：
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发表时间：
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Fukuda Asahi;Oroguchi Tomotaka;Nakasako Masayoshi;Sean Hansen-Romu
通讯作者：
Sean Hansen-Romu

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东方折叠全息 QCD 中的动力学对称性破缺

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Kobayashi Amane;Takayama Yuki;Oroguchi Tomotaka;Okajima Koji;Oide Mao;Yamamoto Masaki;Nakasako Masayoshi;Y.K.Zhou;杉本茂樹
通讯作者：
杉本茂樹

希土類添加半導体の新展開

稀土掺杂半导体的新进展

DOI：
发表时间：
2011
期刊：
マテリアルインテグレーション
影响因子：
0
作者：
Nakasako Masayoshi;Kobayashi Amane;Takayama Yuki;Asakura Kenta;Oide Mao;Okajima Koji;Oroguchi Tomotaka;Yamamoto Masaki;藤原康文
通讯作者：
藤原康文

Cryogenic Coherent X-ray Diffraction Imaging Techniques for Structural Analyses of Biological Cells and Cellular Organelles

用于生物细胞和细胞器结构分析的低温相干 X 射线衍射成像技术

DOI：
10.1017/s1431927618012503
发表时间：
2018
期刊：
Microscopy and Microanalysis
影响因子：
2.8
作者：
Kobayashi Amane;Takayama Yuki;Oroguchi Tomotaka;Okajima Koji;Oide Mao;Yamamoto Masaki;Nakasako Masayoshi
通讯作者：
Nakasako Masayoshi

Cyanidioschyzon merolae: A New Model Eukaryote for Cell and Organelle Biology/chapter 10 Coherent X-ray diffraction imaging of Cyanidioschyzon merolae

Cyanidioschyzon merolae：细胞和细胞器生物学的新模型真核生物/第 10 章 Cyanidioschyzon merolae 的相干 X 射线衍射成像

DOI：
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
0
作者：
Sekiguchi Yuki;Kobayashi Amane;Takayama Yuki;Oide Mao;Fukuda Asahi;Yamamoto Takahiro;Okajima Koji;Oroguchi Tomotaka;Hirakawa Takakeshi;Inui Yayoi;Matsunaga Sachihiro;Yamamoto Masaki;Nakasako Masayoshi
通讯作者：
Nakasako Masayoshi