ＤＵＸ４融合遺伝子陽性Ｂ細胞性急性リンパ性白血病の病態解明

DUX4融合基因阳性B细胞急性淋巴细胞白血病病理学的阐明

• 批准号: 17J10130
• 负责人: 田中 庸介
• 金额: $ 1.79万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2017
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2017-04-26 至 2020-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17J10130/
• 关键词: 急性リンパ性白血病; エピゲノム; 転写活性

本研究はDUX4融合遺伝子を有する白血病におけるDUX4融合遺伝子の機能の解明を目標としている。昨年度までの研究では急性リンパ性白血病(ALL)におけるDUX4融合遺伝子の転写活性についてRNA-seq,ChIP-seq,ATAC-seqを用いて検討した。本年度はDUX4融合遺伝子を持つ白血病細胞株NALM6を用いたRNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seqを統合した解析を行った。まずATAC-seqでDUX4-IGHノックダウン前とノックダウン後のクロマチン状態を比較した際にATACのピークが増加する領域の結合モチーフを調べたところ、B細胞の分化に関わる転写因子の結合モチーフが多く認められた。それらの発現はDUX4-IGHノックダウン前後で上昇しており、臨床検体でも同様のパターンを認め、DUX4-IGHによるこれらの分化関連遺伝子の発現抑制が分化抑制に関連していることが示唆された。また、DUX4融合蛋白によるスーパーエンハンサー制御を検討した。スーパーエンハンサーを有する遺伝子のうち、DUX4融合蛋白の存在によって発現が亢進し、DUX4-IGHノックダウン前後で顕著にヒストンマークおよびATACシグナルが変化する遺伝子を同定した。この遺伝子のノックダウン、あるいは遺伝子がコードする蛋白の阻害剤投与でNALM6の増殖が低下することも確認しており、DUX4-IGHの標的ターゲットの一つと考えられた。また、昨年度から検討している、DUX4-IGHと結合するエピジェネティック制御に関わるタンパク群について機能解析を進めた。これらの蛋白のChIP-seqを行い、DUX4-IGHとの相互作用について確認した。以上の解析結果をDUX4-IGH陽性のALL患者検体を用いたPDXでも確認を行った。

这项研究旨在阐明Dux4融合基因在携带DUX4融合基因的白血病中的功能。在研究直到去年之前，使用RNA-Seq，ChIP-Seq和Atac-Seq研究了DUX4融合基因在急性淋巴细胞性白血病（ALL）中的转录活性。今年，我们使用NALM6进行了一项分析，NALM6是带有DUX4融合基因的白血病细胞系，其中RNA-Seq，ChIP-Seq和ATAC-Seq集成了其中。首先，当比较敲除之前和之后与ATAC-SEQ进行比较时，我们研究了ATAC峰增加的区域中的结合基序，并发现了许多参与B细胞分化的转录因子的结合基序。它们的表达在Dux4-igh敲低之前和之后增加，并且在临床标本中观察到了相似的模式，这表明通过Dux4-iGH抑制了这些分化相关基因的表达与分化抑制有关。此外，我们研究了DUX4融合蛋白对超增强剂的调节。在携带超增强剂的基因中，通过dux4融合蛋白的存在表达，其组蛋白标记和ATAC信号在dux4-igh敲低之前和之后发生了显着改变。还已经证实，该基因的敲低或由该基因编码的蛋白质抑制剂的给药降低了NALM6的增殖，被认为是Dux4-EIRG的靶标之一。此外，对与Dux4-iGH结合的表观遗传控制的蛋白质进行了功能分析，该蛋白质自去年以来一直在考虑。将这些蛋白质进行CHIP-SEQ，以确认它们与Dux4-iGR的相互作用。上述分析结果还使用DUX4-阳性的所有患者证实了PDX。

项目成果

DUX4-IGH融合遺伝子陽性B細胞急性リンパ性白血病における転写活性解析

DUX4-IGH融合基因阳性B细胞急性淋巴细胞白血病转录活性分析

• 发表时间: 2018
• 作者: 田中 庸介;河津 正人;安田 貴彦;早川 文彦;清井 仁;直江 知樹;間野 博行
• 通讯作者: 間野 博行

Chromatin Architecture Modulation in B-cell Acute Lymphoblastic Leukemia Carrying DUX4 Fusions

携带 DUX4 融合的 B 细胞急性淋巴细胞白血病的染色质结构调节

• 发表时间: 2019
• 作者: Yosuke Tanaka;Masahito Kawazu;Satoshi Inoue;Shinya Kojima;Ueno Toshihide;Toshiaki Uno;Moe Tamura;Susumu Goyama;Toshio Kitamura;Shinichi Morishita;Hiroyuki Mano
• 通讯作者: Hiroyuki Mano

Transcriptional activities of DUX4 fusions in B-cell acute lymphoblastic leukemia

• DOI: 10.3324/haematol.2017.183152
• 发表时间: 2018-10-31
• 期刊: HAEMATOLOGICA
• 影响因子: 10.1
• 作者: Tanaka, Yosuke;Kawazu, Masahito;Mano, Hiroyuki
• 通讯作者: Mano, Hiroyuki