小児急性脳症の網羅的メタボローム・マイクロＲＮＡ解析を用いたバイオマーカー探索

使用综合代谢组和 microRNA 分析进行儿科急性脑病生物标志物搜索

• 批准号: 15J40217
• 负责人: 鳥居 ゆか
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2015
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2015-04-24 至 2018-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15J40217/
• 关键词: 脳症; エクソソーム; マイクロRNA; ヒトヘルペスウイルス6型; メタボローム解析; キノリン酸; キヌレニン

HHV-6感染が証明された症例をAESD(Acute encephalopathy with biphasic seizures and late reduced diffusion)タイプの脳症と診断された症例と、痙攣重積を起こしたが、その後意識回復良好で脳症に至らなかった症例の2群にわけ、それぞれ脳脊髄液エクソソーム中のマイクロRNAの発現プロファイルの比較解析を行った。髄液よりmiRCURY exosome isolatiom kitを用いてエクソソームを分離後、miRCURY RNA Isolation Kit Cell and Plantを用いてRNA抽出を行った。抽出したRNAからNEB Next Multiplex Small RNA Library Prep Set for Illuminaを用いてマイクロRNAのライブラリを作成した。作成したライブラリをMiseqでシーケンスを行った。脳症5例、対症5例の計10サンプルの解析を行い、出力したデータからマイクロRNA発現量を標準化して(RPAM: reads per annotated reads per million)比較解析をした。結果、10症例においてのべ292種のマイクロRNAが検出された。比較解析の結果、FDR(False Discovery Rate)<0.05を満たすのはmiR-381-3pのみであった。mir-381-3pは脳症群で有意に検出された。ターゲット遺伝子予測サイト(miRanda, Target Scan, mirDB)を用いて検索したところ、mir-381-3pの標的となると予測された遺伝子にはGRM8など神経伝達に関わる遺伝子もあり、病態との関連が考えられた。今回は10症例の検討のみであったが、PCRでの解析システムを確立して、より多くの症例を解析する必要があると思われた。

患有已验证的HHV-6感染的病例分为两组：诊断患有AESD的病例（急性脑病患有双相性癫痫发作和晚期降低扩散）类型的脑病类型，而Shursulsantis的病例随后又没有恢复了脑病，但未恢复过脑病。对脑脊液外泌体中microRNA表达谱进行比较分析。使用Mircury外泌体分离室试剂盒将外泌体从脑脊液分离，并使用Mircury RNA分离试剂盒和植物提取RNA。使用NEB使用NEB为Illumina创建了MicroRNA库，从提取的RNA中创建了一个多重RNA库准备。使用Miseq对创建的库进行了测序。总共分析了10个样本，其中包括5例脑病和5例症状疾病，并根据输出数据（RPAM）标准化microRNA表达水平并进行了比较分析。结果，在10例中总共检测到292个microRNA。比较分析的结果表明，miR-381-3p仅符合虚假发现率（FDR）<0.05。 MiR-381-3p在脑病组中显着检测到。在使用靶基因预测位点（Miranda，Target Scan，MirdB）进行搜索时，被预测针对miR-381-3p的基因包括参与神经传递的基因，例如GRM8，这些基因被认为与病理条件有关。这次，我们只看了10例，但是似乎有必要使用PCR建立一个分析系统来分析更多病例。

项目成果

Epstein-Barr virus infection-induced inflammasome activation in human monocytes.

• DOI: 10.1371/journal.pone.0175053
• 发表时间: 2017
• 期刊: PloS one
• 影响因子: 3.7
• 作者: Torii Y;Kawada JI;Murata T;Yoshiyama H;Kimura H;Ito Y
• 通讯作者: Ito Y

EBV関連腫瘍におけるトファシチニブの抗腫瘍効果の検討

托法替布在 EBV 相关肿瘤中的抗肿瘤作用研究

• 发表时间: 2015
• 作者: 安藤将太郎;川田潤一;鈴木道雄;渡辺崇広;鳥居ゆか;吉山裕規;清水則夫;木村宏;伊藤嘉規
• 通讯作者: 伊藤嘉規

次世代シーケンサーを用いた急性脳炎・脳症の病原ウイルスの検出

使用下一代测序检测引起急性脑炎和脑病的病毒

• 发表时间: 2016
• 作者: 川田 潤一;鳥居 ゆか;堀場 千尋;安藤 将太郎;鈴木 高子;神谷 泰子;小島 勢二;伊藤嘉規
• 通讯作者: 伊藤嘉規

次世代シーケンシングによる血流感染症の微生物ゲノム分布解析と臨床応用

利用新一代测序进行血流感染微生物基因组分布分析及临床应用

• 发表时间: 2017
• 作者: 堀場千尋;川田潤一;手塚宜行;武内俊;鈴木高子;安藤将太郎;神谷泰子;鳥居ゆか;伊藤嘉規
• 通讯作者: 伊藤嘉規

Inflammasome-mediated IL-1β production by Human Monocyte with primary EBV infection.

原发性 EBV 感染的人单核细胞产生炎症小体介导的 IL-1β。

• 发表时间: 2017
• 作者: Jun-ichi Kawada;Yuka Torii;Takayuki Murata;Hironori Yoshiyama;Hiroshi Kimura;Yoshihiro Ito
• 通讯作者: Yoshihiro Ito