細胞内共生に伴う偽遺伝子化のTG1門細菌を用いた解析
使用 TG1 细菌分析与内共生相关的假发生
基本信息
- 批准号:14J10527
- 负责人:
- 金额:$ 1.09万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2014
- 资助国家:日本
- 起止时间:2014-04-25 至 2016-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Elusimicrobium門細菌(TG1門細菌)は、多様なシロアリ腸内原生生物に共生しているが、共生の歴史が比較的浅いことが示唆されているのに加え、複数の腸内原生生物群について独立に共生したと考えられており、ゲノム多様性の存在する可能性が高い。また、数種のシロアリ腸内には細胞内共生体の祖先種と考えられる自由生活体も存在することが明らかとなっている。本研究では、これら自由生活型、細胞内共生型の各種Elusimicrobium門細菌について比較ゲノム解析を行うことで、細胞内共生細菌のゲノム多様性を明らかにすることを目的とした。平成27年度は当初の計画に従い、比較ゲノム解析に必要な、シロアリ腸内細胞内共生型のElusimicrobium門細菌のゲノム完全長の取得を目指した。本年度中に2種のゲノム完全長を取得し、報告されたシロアリ腸内自由生活体の培養株のゲノム配列との比較ゲノム解析を行った。その結果、特に制限修飾系とCRISPR/Casシステムの遺伝子群に大きな差異がみられた。この結果は、細胞内共生型Elusimicrobium門細菌においても、依然として外界との接触が頻繁に起きていることを示唆しており、これまでに報告されてきた昆虫菌細胞内の細胞内共生とは異なる環境におかれていることを明らかにした。この成果について3件の国内学会発表と2件の国際学会発表を行い、国際誌に論文を投稿中である。
Elusimmicrobium(TG1多核细菌)在共生上与多样化的白蚁肠道原生物共生,但除了暗示共生学的历史相对较短,还相信它们在多种肠道中独立地共生,并且在多种肠道上有可能具有较高的动物构成多样性。还可以透露,有一些自由的活体被认为是几种白蚁肠中细胞内共生物的祖先物种。这项研究旨在通过对各种类型的Elusimicrobium物种进行比较基因组分析(包括自由生活和细胞内共生生物学)来阐明细胞内共生细菌的基因组多样性。在2015年,根据原始计划,我们旨在获得白蚁肠内的全基因组长度,而细胞内共生型Elusimicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicmicrobium phylobacterium,这对于比较基因组分析是必不可少的。在今年中,获得了这两种物种的全长,并使用白蚁肠道无肠内生物体的基因组序列进行了基因组分析。结果,限制修饰系统和CRISPR/CAS系统的基因组存在显着差异。这些结果表明,细胞内共生型Elusimicrobium仍然经常与外界接触,表明它们处于迄今已报道的昆虫细菌中细胞内共生的环境中。关于此结果,已经在日本进行了三次演讲,并在国际学术会议上进行了两次演讲,并将论文提交给国际期刊。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Comparative genomics of endomicrobial symbionts associated with distinct protist species in the termite gut
白蚁肠道中与不同原生生物物种相关的内微生物共生体的比较基因组学
- DOI:
- 发表时间:2015
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Kazuki Izawa;Hirokazu Kuwahara;Kumiko Kihara;Nathan Lo;Masahiro Yuki;Moriya Ohkuma;Yuichi Hongoh
- 通讯作者:Yuichi Hongoh
新規Elusimicrobia門細胞内共生細菌のドラフトゲノム配列取得とその解析
获取并分析 Elusimicrobia 门新型内共生细菌的基因组序列草图
- DOI:
- 发表时间:2014
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:伊澤和輝;桑原宏和;木原久美子;雪真弘;Nathan Lo;伊藤武彦;大熊盛也;本郷裕一
- 通讯作者:本郷裕一
原生生物細胞内共生細菌の系統間多型からみるゲノム縮小進化
从原生内共生细菌的系间多态性看出基因组缩减进化
- DOI:
- 发表时间:2015
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:伊澤和輝;桑原宏和;伊藤武彦;本郷裕一
- 通讯作者:本郷裕一
シロアリ腸内原生生物細胞内共生Endomicrobium属細菌比較ゲノム解析
白蚁肠道原生生物中内共生内微菌的比较基因组分析
- DOI:
- 发表时间:2016
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:伊澤和輝;桑原宏和;木原久美子;Nathan Lo;雪真弘;大熊盛也;本郷裕一
- 通讯作者:本郷裕一
シロアリ腸内ファージメタゲノム解析と腸内細菌CRISPRスペーサー配列に基づく種特異性の解明
基于白蚁肠道噬菌体宏基因组分析和肠道细菌 CRISPR 间隔序列阐明物种特异性
- DOI:
- 发表时间:2016
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:麥島雄太;伊澤和輝;河合幹彦;桑原宏和;雪真弘;大熊盛也;本郷裕一
- 通讯作者:本郷裕一
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