細胞核内環境を再現するヒストン模倣ナノ粒子の作製とそれによる転写活性の制御

创建模拟组蛋白的纳米颗粒，重现核环境并使用它们控制转录活性

• 批准号: 19750149
• 负责人: MIYOSHI Daisuke
• 金额: $ 2.4万
• 依托单位: Konan University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19750149/
• 关键词: ヒストン; 転写; 核酸; 分子クラウディング; ナノ粒子; ワトソン‐クリック塩基対; フーグスティーン塩基対; クロマチン; ワトソン-クリック塩基対

核酸の構造と熱力学的安定性に関して細胞核内を模倣した分子クラウディング条件下で検討した結果、分子クラウディングによって核酸の標準構造(二重らせん構造)が不安定化し、核酸の非標準構造は安定化した。さらに、細胞核内に存在するヒストンの核酸結合部位を化学的に合成し、核酸構造の安定性に及ぼす効果を検討したところ、ヒストン模倣ペプチドによって、核酸の非標準高次構造のみが安定化することが示された。また、これらの知見を用いることで、テロメラーゼなどの酵素機能も制御できた。

通过在模拟细胞核内部的分子拥挤条件下检查核酸的结构和热力学稳定性，我们发现分子拥挤会破坏核酸的标准结构（双螺旋结构）的稳定性，并且非标准结构会破坏核酸的稳定性。核酸结构稳定。此外，我们化学合成了细胞核中存在的组蛋白的核酸结合位点，并检查了其对核酸结构稳定性的影响，发现组蛋白模拟肽仅稳定核酸的非标准构象。被展示了。利用这些发现，他们还能够控制端粒酶等酶的功能。

项目成果

Hydration of Watson-Crick base pairs and dehydration of Hoogsteen base pairs inducing structural polymorphism under molecular crowding conditions

Watson-Crick 碱基对的水合和 Hoogsteen 碱基对的脱水在分子拥挤条件下诱导结构多态性

• 发表时间: 2009
• 作者: D. Miyoshi; K. Nakamura; H. Karimata; T. Ohmichi; N. Sugimoto
• 通讯作者: N. Sugimoto

Small-molecule-directed assembly of DNA : a gold-nanoparticle-based strategy for screening of a DNA duplex binders

DNA 小分子定向组装：基于金纳米颗粒的 DNA 双链体结合物筛选策略

• 发表时间: 2008
• 作者: G. Song; C. Chen; X. Qu; D. Miyoshi; J. Ren;N. Sugimoto
• 通讯作者: N. Sugimoto

Conformational switch of a functional nanowire based on the DNA G-quadruplex

基于DNA G-四链体的功能纳米线的构象转换

• 发表时间: 2007
• 作者: H. Karimata; D. Miyoshi; T. Fujimoto; K. Koumoto; Z.;N. Sugimoto
• 通讯作者: N. Sugimoto

DNAを用いたバイオ計測-センシング核酸の開発と新展開

使用 DNA 进行生物测量 -​​ 核酸传感的发展和新进展

• 发表时间: 2007
• 作者: 三好大輔・杉本直己

Effects of cosolutes on the thermodynamic stability of parallel DNA duplex and triplex.

共溶质对平行 DNA 双链体和三链体热力学稳定性的影响。

• 发表时间: 2007
• 作者: K. Nakamura; H. Karimata; T. Ohmichi; D. Miyoshi;N. Sugimoto
• 通讯作者: N. Sugimoto