イネ直播適性に関わる遺伝子の同定と利用

水稻直播适播相关基因的鉴定及利用

基本信息

批准号：
12F02212
负责人：
寺内良平
金额：
$ 1.47万
依托单位：
Iwate Biotechnology Research Center
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2012
资助国家：
日本
起止时间：
2012 至 2013
项目状态：
已结题

项目摘要

申請者らの研究グループでは、東北地方の水稲栽培の省力化を目標とした研究を実施している。この目的のために、申請者らは、東北日本で重要なイネ品種「ひとめぼれ」を材料として、2種類の集団を作成した : (1)大規模EMS突然変異集団、(2)大規模組換え近交系(Recombinant Inbred Lines : RILs)。Fekih Ep Laribi Rym博士は、これらを利用して、直播適性に関わる遺伝子群の同定を目標に研究を開始した。後者の材料のQTL解析から、直播適性に関わる低温発芽性QTLの位置同定に至った。さらにFekih博士は、突然変異体の原因遺伝子を迅速に同定する手法として、MutMap+法の開発に成功した(Fekihら、PLoS One 2013)。MutMap+法は、既報のMutMap法(Abeら, Nature Biotech. 2012)を改良して、突然変異体と野生型親系統の交配由来のF2を材料として、突然変異形質を示す子孫のバルクDNAと野生型形質を示す子孫のバルクDNAの双方の全ゲノムシーケンスを実施して、互いにSNP分布を比較することにより、迅速に原因遺伝子を同定する技術である。MutMap+法を突然変異系統M3世代の集団に適用することにより、交配作業を経ずに原因遺伝子を同定することも可能となったため、致死突然変異体や不稔突然変異体の原因遺伝子同定に、今後大きな力を発揮するものと期待される。この成果に加えて、Fekih博士はイネ擬似病斑突然変異体の原因遺伝子同定にも成功し、その結果を論文発表する準備を進めている。

申请人的研究小组正在进行研究，目的是节省东北地区的水稻种植中的劳动力。为此，申请人使用水稻品种hitomebore创建了两种类型的种群，这是日本Tohoku的重要品种：（1）大规模的EMS突变种群，以及（2）大规模重组材料（RILS）。 Fekih Ep Laribi Rym博士使用这些研究开始了他的研究，目的是识别参与直接传播能力的基因组。对后一种材料的QTL分析导致鉴定与直接播种适用性相关的低温发芽QTL。此外，Fekih博士成功地开发了MutMap+方法作为快速识别突变体的致病基因的方法（Fekih等，PLOS One 2013）。 MutMap+方法是一种通过改进先前报道的MUTMAP方法（Abe等人，NatureBiotech。2012）来快速识别致病基因的技术，通过使用F2使用F2使用突变体和野生型亲属线之间的交叉来迅速识别致病基因，并使用材料的材料，使用整个生物组序列的整体序列，并展示了该群体的繁殖力。表现出野生型特征并将SNP分布进行比较的后代。通过将MUTMAP+方法应用于M3代人的突变线的种群，可以鉴定导致基因而不进行交配，并且预计它们将来会在识别致命和无菌突变体的病因基因方面发挥强大的力量。除了这一发现外，Fekih博士还成功地确定了水稻伪长突变体的致病基因，并准备发布结果。