Genomic and physiological characterization of dehalorespiring bacteria in three phyla

三个门脱盐呼吸细菌的基因组和生理学特征

基本信息

批准号：
24710077
负责人：
YOSHIDA Naoko
金额：
$ 3.08万
依托单位：
Nagoya Institute of Technology (2013)Toyohashi University of Technology (2012)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2012
资助国家：
日本
起止时间：
2012-04-01 至 2014-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

Dehalorespiring bacteria grow by respiration using organohalides as electron acceptors and reductively dehalogenate organohalides to less halogenated compounds. I have also enriched and isolated phylogenetically and functionally different dehalorespiring bacteria of the three phyla from various environmental samples. Among them, Geobacter sp. AY showed unprecedented high dechlorination activity that detoxify 1,2-dichloroethane (1,2-DCA) of 1,000 ppm to ethene within a week. Geobacter sp. AY had following advantages to be applied in bioremediation; the high activity for high concentration of 1,2-DCA, culturability using only acetate as sole electron donor and carbon source, and the high activity in the culture grown without any organohalides. The genome analysis revealed the constitutive expression was probably resulted from a plasmid lacking of cAMP kinase transcriptional regulator transferred from obligate dehalorespiring Dehalobacter.

脱甲液刺细菌通过使用有机甲藻作为电子受体而呼吸生长，并还原脱核酸有机甲烷化，从而降低卤化化合物。我还从各种环境样品的三个门上富集和分离了系统发育和功能上不同的脱甲漏细菌。其中，Geobacter sp。 AY显示出前所未有的高脱氯活性，可以在一周内将1,2-二氯乙烷（1,2-DCA）解毒为1,000 ppm。 Geobacter sp。 Ay具有以下优点，可用于生物修复；高浓度1,2-DCA的高活性，仅使用乙酸盐作为唯一电子供体和碳源的培养性，以及在没有任何有机盐的培养物中的高活性。基因组分析表明，本构表达可能是由于缺乏从强制性脱甲螺旋杆菌转移的cAMP激酶转录调节剂的质粒引起的。

项目成果

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专利数量（0）

Anaerobic 4-chlorophenol mineralization in an enriched culture under iron-reducing conditions

铁还原条件下富集培养物中的厌氧 4-氯酚矿化

DOI：
10.1016/j.jbiosc.2014.04.007
发表时间：
2014
期刊：
Journal of Bioscience and Bioengineering
影响因子：
2.8
作者：
Zhiling Li;Daisuke Suzuki;Chunfang Zhang;Suyin Yang;Jun Nan;Naoko Yoshida;Aijie Wang;Arata Katayama
通讯作者：
Arata Katayama

Aquatic plant surface as a niche for methanotrophs.

DOI：
10.3389/fmicb.2014.00030
发表时间：
2014
期刊：
Frontiers in microbiology
影响因子：
5.2
作者：
Yoshida N;Iguchi H;Yurimoto H;Murakami A;Sakai Y
通讯作者：
Sakai Y

Aquatic plant surface 1 as a niche for methanotrophs

水生植物表面 1 作为甲烷氧化菌的生态位

DOI：
发表时间：
2014
期刊：
Frontiers in microbiology
影响因子：
5.2
作者：
N Yoshida;H Iguchi;H Yurimoto;A Murakami;Y Sakai
通讯作者：
Y Sakai

Simulation of the Reductive Dechlorination Processes in a Lab-Scale Anaerobic Biobarrier with the Enriched TCP Dechlorination Consortium

使用富集 TCP 脱氯联合体模拟实验室规模厌氧生物屏障中的还原脱氯过程

DOI：
10.1007/s12209-012-1768-8
发表时间：
2012
期刊：
Transactions of Tianjin University
影响因子：
7.1
作者：
Zhiling Li;Yasushi Inoue;Takuya Mizoguchi;Yohei Simizu;Naoko Y oshida andArata Katayama
通讯作者：
Naoko Y oshida andArata Katayama

多様な芳香族塩素化合物を脱塩素化するDehalobacter sp. FTH1株のドラフトゲノム解析に基づく脱ハロゲン化酵素遺伝子解析

基于 Dehalobacter sp. FTH1 菌株基因组草图分析的脱卤酶基因分析，可对各种芳香族氯化合物进行脱氯。