Understanding of viral replication through the interaction with coronavirus nsp1 and host proteins

通过与冠状病毒 nsp1 和宿主蛋白的相互作用了解病毒复制

• 批准号: 24790439
• 负责人: WATARU KAMITANI
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24790439/
• 关键词: ウイルス; RNA分解; ウイルス複製; RNA分解機構; 感染症; RNA; ヘリケース

Severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) is the etiological agent of a newly emerged disease. Nsp1 binds to 40S ribosome subunits, which causes a translational shutoff in the cells expressing nsp1. The nsp1-40S complex further induces an endonucleolytic RNA cleavage near the 5'UTR of host mRNA, resulting in the promotion of RNA decay. However, the mechanism by which nsp1-induced RNA cleavage is unknown. We identified Upf1 as a binding partner of nsp1 by pulldown purification and mass spectrometry. Upf1 is a predominantly cytoplasmic RNA-binding protein that is essential for nonsense-mediated RNA decay pathway. Coimmunoprecipitation analyses in transfected cells confirmed a specific interaction between nsp1 and Upf1. Small interfering RNA-mediated knockdown of Upf1 resulted in suppression of nsp1-mediated RNA cleavage. Our data indicate a novel mechanism of host mRNA cleavage by SARA-CoV nsp1 protein.

严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV）是一种新出现的疾病的病原体。 Nsp1 与 40S 核糖体亚基结合，导致表达 nsp1 的细胞翻译关闭。 nsp1-40S 复合物进一步诱导宿主 mRNA 5'UTR 附近的核酸内切 RNA 裂解，从而促进 RNA 衰变。然而，nsp1 诱导 RNA 切割的机制尚不清楚。我们通过下拉纯化和质谱鉴定 Upf1 是 nsp1 的结合伴侣。 Upf1 是一种主要存在于细胞质的 RNA 结合蛋白，对于无义介导的 RNA 衰减途径至关重要。转染细胞中的免疫共沉淀分析证实了 nsp1 和 Upf1 之间的特异性相互作用。小干扰 RNA 介导的 Upf1 敲低导致 nsp1 介导的 RNA 裂解受到抑制。我们的数据表明 SARA-CoV nsp1 蛋白切割宿主 mRNA 的新机制。

项目成果

SARS-CoVのnsp1タンパク質と相互作用する宿主因子の探索

寻找与 SARS-CoV 的 nsp1 蛋白相互作用的宿主因子

• 发表时间: 2012
• 作者: Tanaka T;Kamitani W;DeDiego ML;Enjuanes L;Matusura Y;田中智久,松浦善治,神谷亘
• 通讯作者: 田中智久,松浦善治,神谷亘

SARS coronavirus binds to the viral 5’UTR that induces host specific shutoff and mRNA degradation promotion

SARS 冠状病毒与病毒 5’UTR 结合，诱导宿主特异性关闭和促进 mRNA 降解

• 发表时间: 2012
• 作者: Tanaka T;Kamitani W;DeDiego ML;Enjuanes L;Matusura Y;田中智久,松浦善治,神谷亘;田中智久,松浦善治,神谷亘;田中智久，松浦善治，神谷 亘
• 通讯作者: 田中智久，松浦善治，神谷 亘