植物・昆虫に寄生する細胞内パラサイトの環境適応戦略
寄生植物和昆虫的细胞内寄生虫的环境适应策略
基本信息
- 批准号:12J07546
- 负责人:
- 金额:$ 1.73万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2012
- 资助国家:日本
- 起止时间:2012-04-01 至 2015-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本研究は植物病原細菌ファイトプラズマの植物ー昆虫間宿主転換メカニズムの解明に向けて研究を行ってきた。本年度は、ファイトプラズマ種に広く保存されている転写因子RpoDに着目し、そのDNA認識配列と、制御下にある遺伝子を明らかにすることを目的として研究を行った。まず、様々なファイトプラズマ遺伝子のプロモーター配列を用いてin vitro環境下でのRpoD転写活性解析を行った。ハウスキーピング遺伝子およびファイトプラズマの病原性や宿主細胞への接着に関わる遺伝子の上流配列をテンプレートとして用いたところ、転写産物が検出された。さらにこれらの遺伝子のコンセンサスプロモーター配列を特定するため、5´RACE法を用いて転写開始点を特定したところ、特定された転写開始点の上流-10および-35塩基付近に6塩基ほどの保存配列が確認された。その保存配列は大腸菌や枯草菌などでもよく保存されているRpoD認識配列とよく類似していた。従ってこれらのファイトプラズマ遺伝子はRpoDによって制御される遺伝子であることが強く示唆された。次に、RpoDによって制御されるファイトプラズマ遺伝子を網羅的に推定するため、本研究により推定されたコンセンサスプロモーター配列をファイトプラズマゲノム上にマッピングした。その結果、少なくとも88個の遺伝子がRpoDによって制御されていることが示唆された。本研究では、in vitro転写解析系を確立したことによってこれまで解析が困難であった難培養性細菌の転写制御について解析を行うことが可能となり、ファイトプラズマのプロモーター配列を特定することができた。本解析系は、ファイトプラズマの宿主転換メカニズムのみならず、多くの難培養性細菌の感染メカニズムの解明に寄与することができると考えられる。
本研究旨在阐明植物病原菌植原体的植物-昆虫宿主转换机制。今年,我们重点关注植原体物种中广泛保守的转录因子RpoD,进行了研究,旨在阐明其DNA识别序列及其控制的基因。首先,我们使用各种植原体基因的启动子序列在体外环境中分析了 RpoD 转录活性。使用管家基因和涉及植原体毒力和宿主细胞粘附的基因的上游序列作为模板,检测转录本。此外,为了鉴定这些基因的共有启动子序列,我们使用5´RACE方法鉴定了转录起始位点,并在鉴定的转录起始位点上游-10和-35碱基附近发现了约6个碱基的保守序列被证实。该保守序列与RpoD识别序列非常相似,RpoD识别序列在大肠杆菌和枯草芽孢杆菌中也非常保守。因此,强烈表明这些植原体基因受RpoD调节。接下来,为了全面估计RpoD控制的植原体基因,我们将本研究估计的共有启动子序列映射到植原体基因组上。结果表明至少有 88 个基因受 RpoD 调控。本研究通过建立体外转录分析系统,分析了以往难以分析的难培养细菌的转录调控,并鉴定了植原体的启动子序列。相信该分析系统不仅有助于阐明植原体的宿主转化机制,而且有助于阐明许多难以培养的细菌的感染机制。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
ファイトプラズマ感染が花の形態形成遺伝子の発現へ与える影響
植原体感染对花形态发生基因表达的影响
- DOI:
- 发表时间:2012
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Moriyama;T.;Nagai;M.;Oka;M;Yoneda;Y.;姫野未紗子・湊菜未・煉谷裕太朗・三浦千 裕・石川一也・桂馬拓也・前島健作・大島研郎・難波成任
- 通讯作者:姫野未紗子・湊菜未・煉谷裕太朗・三浦千 裕・石川一也・桂馬拓也・前島健作・大島研郎・難波成任
植物-昆虫ホストスイッチング機構に関与するファイトプラズマ遺伝子の網羅的発現変動解析
植物-昆虫宿主转换机制植原体基因综合表达变异分析
- DOI:
- 发表时间:2014
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Akihiro Okamoto;Ryuhei Nakamura;Kazuhito Hashimoto;三浦千裕・大島研郎・難波成任
- 通讯作者:三浦千裕・大島研郎・難波成任
ファイトプラズマのポストゲノム生物学-宿主スイッチングにおける網羅的遺伝子発現解析
植原体的后基因组生物学——宿主转换过程中的综合基因表达分析
- DOI:
- 发表时间:2012
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Miura C. ;Keima T.;Watanabe T.;Nijo T. ;Maejima K. ;Oshima K. and Namba S.;大島研郎・三浦千裕・湊菜未・煉谷裕太朗・石川一也・北沢優悟・二條貴通・渡邊翼・前島健作・難波成任
- 通讯作者:大島研郎・三浦千裕・湊菜未・煉谷裕太朗・石川一也・北沢優悟・二條貴通・渡邊翼・前島健作・難波成任
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上中 弘典
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