植物・昆虫に寄生する細胞内パラサイトの環境適応戦略

寄生植物和昆虫的细胞内寄生虫的环境适应策略

基本信息

  • 批准号:
    12J07546
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.73万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2012
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2012-04-01 至 2015-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究は植物病原細菌ファイトプラズマの植物ー昆虫間宿主転換メカニズムの解明に向けて研究を行ってきた。本年度は、ファイトプラズマ種に広く保存されている転写因子RpoDに着目し、そのDNA認識配列と、制御下にある遺伝子を明らかにすることを目的として研究を行った。まず、様々なファイトプラズマ遺伝子のプロモーター配列を用いてin vitro環境下でのRpoD転写活性解析を行った。ハウスキーピング遺伝子およびファイトプラズマの病原性や宿主細胞への接着に関わる遺伝子の上流配列をテンプレートとして用いたところ、転写産物が検出された。さらにこれらの遺伝子のコンセンサスプロモーター配列を特定するため、5´RACE法を用いて転写開始点を特定したところ、特定された転写開始点の上流-10および-35塩基付近に6塩基ほどの保存配列が確認された。その保存配列は大腸菌や枯草菌などでもよく保存されているRpoD認識配列とよく類似していた。従ってこれらのファイトプラズマ遺伝子はRpoDによって制御される遺伝子であることが強く示唆された。次に、RpoDによって制御されるファイトプラズマ遺伝子を網羅的に推定するため、本研究により推定されたコンセンサスプロモーター配列をファイトプラズマゲノム上にマッピングした。その結果、少なくとも88個の遺伝子がRpoDによって制御されていることが示唆された。本研究では、in vitro転写解析系を確立したことによってこれまで解析が困難であった難培養性細菌の転写制御について解析を行うことが可能となり、ファイトプラズマのプロモーター配列を特定することができた。本解析系は、ファイトプラズマの宿主転換メカニズムのみならず、多くの難培養性細菌の感染メカニズムの解明に寄与することができると考えられる。
进行了这项研究是为了阐明植物对植物致病细菌植物植物植物转化的机制。今年,我们专注于转录因子RPOD,该因子在植物植物中广泛保守,并进行了研究,目的是阐明其DNA识别序列和受到控制的基因。首先,在体外环境下使用各种植物基因的启动子序列分析了RPOD转录活性。管家基因的上游序列和涉及植物植物的致病性和对宿主细胞粘附的致病性的基因被用作模板,并检测到转录本。此外,为了识别这些基因的共有启动子序列,当使用5'race方法鉴定转录起始点时,左右在-10和-35碱基的上游确认了一个约6个碱基的保守序列。保守的序列与RPOD识别序列非常相似,后者通常在大肠杆菌和枯草芽孢杆菌中保守。因此,强烈提出这些植物基因是由RPOD调节的基因。接下来,为了全面估计由RPOD调节的植物基因,这项研究推导的共有启动子序列被映射到植物性基因组上。结果表明,至少88个基因受RPOD调节。在这项研究中,建立一个体外转录分析系统使我们能够分析难以培养细菌的转录控制,而这些细菌以前很难分析,并且我们能够鉴定植物性的启动子序列。人们认为,该分析系统不仅能够为植物植物的宿主转化机制做出贡献,还可以阐明许多难以培养细菌的感染机制。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
ファイトプラズマ感染が花の形態形成遺伝子の発現へ与える影響
植原体感染对花形态发生基因表达的影响
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Moriyama;T.;Nagai;M.;Oka;M;Yoneda;Y.;姫野未紗子・湊菜未・煉谷裕太朗・三浦千 裕・石川一也・桂馬拓也・前島健作・大島研郎・難波成任
  • 通讯作者:
    姫野未紗子・湊菜未・煉谷裕太朗・三浦千 裕・石川一也・桂馬拓也・前島健作・大島研郎・難波成任
植物-昆虫ホストスイッチング機構に関与するファイトプラズマ遺伝子の網羅的発現変動解析
植物-昆虫宿主转换机制植原体基因综合表达变异分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Akihiro Okamoto;Ryuhei Nakamura;Kazuhito Hashimoto;三浦千裕・大島研郎・難波成任
  • 通讯作者:
    三浦千裕・大島研郎・難波成任
ファイトプラズマのポストゲノム生物学-宿主スイッチングにおける網羅的遺伝子発現解析
植原体的后基因组生物学——宿主转换过程中的综合基因表达分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Miura C. ;Keima T.;Watanabe T.;Nijo T. ;Maejima K. ;Oshima K. and Namba S.;大島研郎・三浦千裕・湊菜未・煉谷裕太朗・石川一也・北沢優悟・二條貴通・渡邊翼・前島健作・難波成任
  • 通讯作者:
    大島研郎・三浦千裕・湊菜未・煉谷裕太朗・石川一也・北沢優悟・二條貴通・渡邊翼・前島健作・難波成任
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三浦 千裕其他文献

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  • DOI:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三浦 千裕;才所 美晴;佐藤 良勝;谷亀 高広;東山 哲也;大和 政秀;上中 弘典
  • 通讯作者:
    上中 弘典

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    2023
  • 资助金额:
    $ 1.73万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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  • 批准号:
    18J01755
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 1.73万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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    2017
  • 资助金额:
    $ 1.73万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

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    2023
  • 资助金额:
    $ 1.73万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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    2022
  • 资助金额:
    $ 1.73万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 1.73万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
高等真核生物RNAポリメラーゼIIによる伸長転写制御の解明
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    20K15736
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 1.73万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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    20K15718
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 1.73万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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