JapanesePlex: a method for identification of being Japanese using Japanese-specific SNPs
JapanesePlex:一种使用日本特有的 SNP 来识别日本人的方法
基本信息
- 批准号:23590849
- 负责人:
- 金额:$ 3.41万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2011
- 资助国家:日本
- 起止时间:2011 至 2013
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
To find out Japanese-specific SNPs, a total of 875 DNA samples from Japanese in Tottori and Okinawa, Koreans, Mongolians, Hans, Tibetans, Germans and Africans were investigated. Sixty-seven (nearly) Japanese-specific SNPs were observed. Of them, 57 showed the highest frequencies in Okinawa, and 43 were also observed in Koreans at lower frequencies. DNA samples from Jomon remains in Hokkaido were investigated for three SNPs at the GALNT11, H19 and PLA2G12A genes, and showed higher frequencies in every SNP than those from Okinawa, suggesting that the SNPs observed at the highest frequencies in Okinawa were of Jomon lineage. For forensic practice, 50 SNPs with high frequency and no linkage disequilibrium were selected. A multiplex typing method based on single-based primer extension technology were established. This JapanesePlex method permitted the identification of being Japanese with high probability.
为了找出日本人特有的SNP,我们对来自鸟取县和冲绳县的日本人、韩国人、蒙古人、汉人、西藏人、德国人和非洲人的总共875份DNA样本进行了调查。观察到 67 个(几乎)日本特有的 SNP。其中,57 个在冲绳出现频率最高,43 个在韩国人中出现频率较低。研究人员对北海道绳文遗骸的 DNA 样本中的 GALNT11、H19 和 PLA2G12A 基因的 3 个 SNP 进行了研究,结果显示每个 SNP 的频率均高于冲绳的 SNP,这表明在冲绳观察到频率最高的 SNP 属于绳文谱系。为了法医实践,选择了50个高频且无连锁不平衡的SNP。建立了基于单引物延伸技术的多重分型方法。这种 JapanesePlex 方法能够以很高的概率识别出日本人。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Mutations in COG2 encoding a subunit of the conserved oligomeric golgi complex cause a congenital disorder of glycosylation
- DOI:10.1111/cge.12417
- 发表时间:2015-05-01
- 期刊:
- 影响因子:3.5
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- 通讯作者:Saitsu, H.
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- DOI:
- 发表时间:2011
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:湯浅 勲;遠藤実;入澤淑人;他
- 通讯作者:他
Transferrin mutations at the glycosylation site complicate diagnosis of congenital disorders of glycosylation type I.
- DOI:10.1007/s10545-011-9311-y
- 发表时间:2011-08
- 期刊:
- 影响因子:4.2
- 作者:Guillard, Mailys;Wada, Yoshinao;Hansikova, Hana;Yuasa, Isao;Vesela, Katerina;Ondruskova, Nina;Kadoya, Machiko;Janssen, Alice;Van den Heuvel, Lambertus P. W. J.;Morava, Eva;Zeman, Jiri;Wevers, Ron A.;Lefeber, Dirk J.
- 通讯作者:Lefeber, Dirk J.
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- DOI:10.1002/elps.201100064
- 发表时间:2011
- 期刊:
- 影响因子:2.9
- 作者:Ueki M;Fuiihara J;Takeshita H;Kimura-Kataoka K;Iida R;Yuasa I;Kato H;Yasuda T
- 通讯作者:Yasuda T
日本人集団並びにドイツ人におけるSCN5A遺伝子R1193Q変異の頻度調査
日本人群和德国人群中SCN5A基因R1193Q突变频率调查
- DOI:
- 发表时间:2013
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:松末綾;湯浅勲;梅津和夫;柏木正之;原健二;Brian Waters;高山みお;高本睦夫;久保真一
- 通讯作者:久保真一
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