Post-modification of triazole-linked analogues of DNA for positively charged variants

带正电荷变体的三唑连接 DNA 类似物的后修饰

• 批准号: 23550041
• 负责人: FUJINO Tomoko
• 金额: $ 3.41万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23550041/
• 关键词: DNA; 人工核酸; トリアゾリウム; トリアゾール; 酵素; オリゴヌクレオチド; リボヌクレオシド; 環状二量化核酸; 配座解析; 三重鎖形成; 水銀; トリアゾリウムカチオン; アルキル化反応; 錯形成

One of the most common problems accompanied with non-phosphorus, electroneutral DNA analogues is the low solubility of the oligomers. Despite the chemical and biological stability benefitted from the absence of the negatively charged phosphate linkages, the electroneutral strand lacks electrostatic supports for the solubility. This solubility issue also arose, when we prepared long oligomers of TLDNA. Specifically, unique functions of TLDNA congeners such as lure substrates for reverse-transcriptase prompted us to explore further applications with longer oligomers, but the solubility problem became severer as the oligomers lengthened. We reported a concise post-modification method for the preparation of positively charged variants, TLDNA+. A one-step methylation of oligothymine TLDNA successfully afforded TLDNA+ with an improved solubility in high yield. The pentamer TLDNA+ formed a triple helix with natural oligoadenine DNA in addition to a mercury-mediated self-duplex.

无磷、电中性 DNA 类似物最常见的问题之一是低聚物的溶解度低。尽管化学和生物稳定性得益于不带负电的磷酸酯键的存在，但电中性链缺乏对溶解度的静电支持。当我们制备 TLDNA 长寡聚物时，也出现了这个溶解度问题。具体而言，TLDNA同系物的独特功能（例如反转录酶的诱饵底物）促使我们探索更长寡聚体的进一步应用，但随着寡聚体的延长，溶解度问题变得更加严重。 我们报道了一种用于制备带正电变体 TLDNA+ 的简明后修饰方法。寡胸腺嘧啶 TLDNA 的一步甲基化成功地以高产率提供了溶解度提高的 TLDNA+。除了汞介导的自双链体之外，五聚体 TLDNA+ 还与天然寡腺嘌呤 DNA 形成三螺旋。

项目成果

Conformational restriction of cyclic dinucleotides with triazole-linked cyclophane analogues

• DOI: 10.1016/j.tetlet.2014.03.026
• 发表时间: 2014-04-16
• 期刊: TETRAHEDRON LETTERS
• 影响因子: 1.8
• 作者: Fujino, Tomoko;Okada, Koudai;Isobe, Hiroyuki
• 通讯作者: Isobe, Hiroyuki

Post-modification of Triazole-linked Analogue of DNA for Positively-charged DNA

带正电荷 DNA 的三唑连接 DNA 类似物的后修饰

• DOI: 10.3987/com-13-12697
• 发表时间: 2013
• 期刊: Heterocycles
• 影响因子: 0.6
• 作者: Fujino;T.; Miyauchi;Y.; Tsunaka;N.; Okada;K.; Isobe;H
• 通讯作者: H

Efficient and improved synthesis of triazole-linked DNA (TLDNA) oligomers

• DOI: 10.1016/j.tetlet.2011.12.026
• 发表时间: 2012-02
• 期刊: Tetrahedron Letters
• 影响因子: 1.8
• 作者: Tomoko Fujino;Naomi Yamazaki;Ai Hasome;K. Endo;H. Isobe

トリアゾール連結型RNAの合成

三唑连接的 RNA 的合成

• 发表时间: 2013
• 作者: 中本真晃;関口章;山﨑直美，藤野智子，遠藤健太，磯部寛之
• 通讯作者: 山﨑直美，藤野智子，遠藤健太，磯部寛之

Triazole-Linked Analogue of Cyclic Dinucleotide

三唑连接的环状二核苷酸类似物

• 发表时间: 2013