Analysis of the proteins possessed by the last common ancestor and the organisms present before it

分析最后一个共同祖先及其之前存在的生物体所拥有的蛋白质

• 批准号: 23370097
• 负责人: YAMAGISHI Akihiko
• 金额: $ 6.49万
• 依托单位: Tokyo University of Pharmacy and Life Science
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011-11-18 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23370097/
• 关键词: 生命初期進化; 共通祖先; コモノート; NDK; 分子系統樹; タンパク質耐熱性; 酵素活性; アミノ酸単純化; 古細菌; 真正細菌; アミノ酸少数化

We have resurrected the gene of the nucleotidediphosphate kinase (NDK) possessed by the common ancestor of Bacteria and Archaea, and analyzed the thermal stability of the protein produced from the resurrected genes. The ancestral NDKs showed stability close to 110 degree C, suggesting the common ancestors of Bacteria and Archaea were thriving at the temperature between 80 and 100 degree C. The NDK of the last common ancestor, commonote, was also resurrected and reproduced. The ancestral NDK showed the high stability, suggesting that the commonote were living at 75 degree C or higher temperature. The ancestral NDKs from which one of the 20 amino acid species were removed, were produced and whose stability and activity were analyzed. The results showed the amino acid species that is not absolutely required for the stability and activity.

我们已经复活了细菌和古细菌的共同祖先所具有的核苷酸激酶（NDK）的基因，并分析了从复活基因产生的蛋白质的热稳定性。祖先NDK的稳定性接近110摄氏度，表明细菌和古细菌的共同祖先在温度在80至100摄氏度之间蓬勃。祖先的NDK显示出较高的稳定性，表明普通菌的温度为75度或更高的温度。 去除20种氨基酸物种之一的祖先NDK，产生并分析其稳定性和活性。结果表明，稳定性和活性绝对需要的氨基酸物种。

项目成果

全生物の共通祖先遺伝子の復元

重建所有生物的共同祖先基因

• 发表时间: 2014
• 期刊: バイオサイエンスとインダストリー
• 作者: 赤沼哲史;山岸明彦
• 通讯作者: 山岸明彦

祖先型設計による耐熱性を有するDNAジャイレース由来ATPaseドメインの構築

通过祖先设计构建热稳定性 DNA 旋转酶衍生的 ATP 酶结构域

• 发表时间: 2011
• 作者: 赤沼哲史;岩見祥子;中村奈々;横井珠希; 渡辺英哲; 横堀伸一;山岸明彦
• 通讯作者: 山岸明彦

全生物の共通祖先以前のコドンの進化

所有生物共同祖先之前密码子的进化

• 发表时间: 2012
• 作者: 赤沼哲史;島田真実;篠崎梢;中島慶樹;横堀伸一;山岸明彦
• 通讯作者: 山岸明彦

２つの祖先型化タンパク質の耐熱性の違いに関わるアミノ酸残基の同定

鉴定涉及两种祖先蛋白质热稳定性差异的氨基酸残基

• 发表时间: 2012
• 作者: 山口美奈子;赤沼哲史;小林愛美;山岸明彦
• 通讯作者: 山岸明彦

遺伝暗号の起源

遗传密码的起源

• 发表时间: 2013
• 作者: Naito;Y.I.;Y. Chikaraishi;N. Ohkouchi;and M. Yoneda;高田慎治;Kazuho Ikeo;Suzuki R. and Saitou N;赤沼哲史
• 通讯作者: 赤沼哲史