Structure modeling and functional analysis of rotary motor state proteins based on mutational information

基于突变信息的旋转运动状态蛋白结构建模与功能分析

• 批准号: 23370066
• 负责人: KITAO Akio
• 金额: $ 12.81万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011-04-01 至 2015-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23370066/
• 关键词: 生体膜; 受容体; チャネル; 立体構造モデリング; チャンネル

项目成果

Free-energy analysis of lysozyme-triNAG binding modes with all-atom molecular dynamics simulation combined with the solution theory in the energy representation

全原子分子动力学模拟结合能量表示中的解理论对溶菌酶-triNAG结合模式进行自由能分析

• DOI: 10.1016/j.cplett.2012.12.063
• 发表时间: 2013
• 期刊: Chem. Phys. Lett
• 作者: K. Takemura;R. R. Burri;T. Ishikawa;T. Ishikura;S. Sakuraba;N. Matubayasi;K. Kuwata;and A. Kitao
• 通讯作者: and A. Kitao

Exploring protein conformational transition pathways with efficient molecular simulation method

用高效的分子模拟方法探索蛋白质构象转变途径

• 发表时间: 2013
• 作者: Imamoto;Y.;角野歩，山本大輔，岩本真幸，出羽毅久，老木成稔;桑田一夫;Akio Kitao
• 通讯作者: Akio Kitao

Conformational transition pathway and free energy analyses of proteins by parallel cascade selection molecular dynamics (PaCS-MD)

• DOI: 10.1063/1.4897682
• 发表时间: 2014-10
• 作者: R. Harada;Y. Nishihara;Nobuhiko Wakai;A. Kitao

Ligand-Induced Protein Responses and Mechanical Signal Propagation Described by Linear Response Theories

线性响应理论描述的配体诱导的蛋白质响应和机械信号传播

• DOI: 10.1016/j.bpj.2014.07.049
• 发表时间: 2014
• 期刊: Biophysical Journal
• 影响因子: 3.4
• 作者: Lee-Wei Yang;Akio Kitao;Bang-chieh Huang and Nobuhiro Go
• 通讯作者: Bang-chieh Huang and Nobuhiro Go

柔らかさを利用したタンパク質とその集合体の機能制御

利用柔软度对蛋白质及其聚集体进行功能控制

• 发表时间: 2014
• 作者: M. Iwamoto;S. Oiki;桑田一夫;井ノ口仁一;北尾彰朗
• 通讯作者: 北尾彰朗