Roles of hyper-anisotropic dynamics and frustration on protein function investigated in sub-msec order
以亚毫秒级研究超各向异性动力学和挫败对蛋白质功能的作用
基本信息
- 批准号：19370062
- 负责人：
- 金额：$ 11.65万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- 财政年份：2007
- 资助国家：日本
- 起止时间：2007 至 2010
- 项目状态：已结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
To elucidate the detailed protein functional principle in broad time and space ranges, we focused on the dynamics of nano to sub-milli sec order, observed function relevant protein dynamics by molecular simulation, and studied the hyper anisotropy and frustration of the systems. We also have developed the methods to calculate free energy landscape from massive parallel simulations and to extract correlated motions in high dimensional dynamics and used them to investigate the relation between protein dynamics and function.
为了阐明在宽时和空间范围内详细的蛋白质功能原理，我们专注于纳米到亚米利SEC的动力学，通过分子模拟观察到功能相关的蛋白质动力学，并研究了系统的性各向异性和系统的挫败感。我们还开发了从大规模平行模拟中计算自由能景观并在高维动力学中提取相关运动的方法，并用它们来研究蛋白质动力学与功能之间的关系。
项目成果
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专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Collective Dynamics of Periplasmic Glutamine Binding Protein upon Domain Closure
- DOI：10.1016/j.bpj.2009.08.019
- 发表时间：2009-11-04
- 期刊：
- 影响因子：3.4
- 作者：Loeffler, Hannes H.;Kitao, Akio
- 通讯作者：Kitao, Akio
分子モデリングによる細菌べん毛モーター固定子MotA/MotB複合体の立体構造予測
通过分子建模预测细菌鞭毛运动定子MotA/MotB复合体的三维结构
- DOI：
- 发表时间：2010
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Jeremy C. Smith;Akio Kitao and Ahmed H. Zewail;北尾彰朗;北尾彰朗;竹村和浩;原田隆平;桜庭俊;北尾彰朗;Akio Kitao;二島渉;原田隆平;原田隆平;西原泰孝
- 通讯作者：西原泰孝
Molecular simulation study to examine the possibility of detecting protein conformational motions by coherent neutron scattering
分子模拟研究探讨通过相干中子散射检测蛋白质构象运动的可能性
- DOI：
- 发表时间：2008
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Y. Joti;A. Kitao
- 通讯作者：A. Kitao
Free energy landscape analysis of biomolecules by massive parallel multi-scale simulation
通过大规模并行多尺度模拟进行生物分子自由能景观分析
- DOI：
- 发表时间：2010
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Jeremy C. Smith;Akio Kitao and Ahmed H. Zewail;北尾彰朗;北尾彰朗;竹村和浩;原田隆平;桜庭俊;北尾彰朗;Akio Kitao;二島渉;原田隆平;原田隆平
- 通讯作者：原田隆平
細菌べん毛モーター固定子複合体MotA/MotBの分子モデリング
细菌鞭毛运动定子复合物 MotA/MotB 的分子建模
- DOI：
- 发表时间：2010
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Hitomi Takahashi;et al.;北尾彰朗;西原泰孝
- 通讯作者：西原泰孝
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$ 11.65万 - 项目类别：
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$ 11.65万 - 项目类别：
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$ 11.65万 - 项目类别：
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