adductome analysis of human tissues

人体组织加合组分析

基本信息

批准号：
22659072
负责人：
SUGIMURA Haruhiko
金额：
$ 1.94万
依托单位：
Hamamatsu University School of Medicine
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至 2011
项目状态：
已结题

项目摘要

High performance liquid chromatography and tandem mass spectrometry disclosed at least 10 lipid peroxidation related modified DNA bases in the DNAs extracted under anti-oxidation condition from human autopsy tissues. Among these 10 DNA adducts, 7 of them, 1, N6-etheno-2'-deoxyadenosine(εdA), butanone-etheno-2'-deoxycytidine(BεdC), butanone-etheno-2'-deoxy-5-methylcytidine(BεmedC), butanoneetheno-2'-deoxyadenosine(BεdA), heptanone-etheno-2'-deoxycytidine(HεdC), heptanone-etheno-2'-deoxyadenosine(HεdA), and heptanone-etheno-2'-deoxyguanosine(HεdG) were quantitated in gastric mucosa, resected for gastric cancer in Japan and China. The profiles of these DNA adducts identified the origin of the tissues(China or Japan), implying adductome profile may reflect environmental exposures of individual settings. We further tested the repair machinery against these modified bases and discovered TDG play s role in repairing some of these adducts.

高效液相色谱和串联质谱分析揭示了在抗氧化条件下从人体尸检组织中提取的DNA中至少有10个与脂质过氧化相关的修饰DNA碱基，其中7个是1,N6-etheno-2'。 -脱氧腺苷(εdA)、丁酮-乙烯-2'-脱氧胞苷(BεdC)、丁酮-乙烯-2'-脱氧-5-甲基胞苷(BεmedC)、丁酮乙烯-2'-脱氧腺苷(BεdA)、庚酮-乙烯-2'-脱氧胞苷(HεdC)、庚酮-乙烯-2'-脱氧腺苷(HεdA)、和对日本和中国胃癌切除的胃粘膜中的庚酮-乙烯-2'-脱氧鸟苷 (HεdG) 进行了定量。这些 DNA 加合物的谱鉴定了组织的起源（中国或日本），这意味着加合物谱可能反映了环境。我们进一步测试了针对这些修饰碱基的修复机制，发现 TDG 在修复其中一些加合物中发挥着作用。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Detection of Lipid Peroxidation-Induced DNA Adducts Caused by 4-Oxo-2(E)-nonenal and 4-Oxo-2(E)-hexenal in Human Autopsy Tissues

DOI：
10.1021/tx100047d
发表时间：
2010-09-01
期刊：
CHEMICAL RESEARCH IN TOXICOLOGY
影响因子：
4.1
作者：
Chou, Pei-Hsin;Kageyama, Shinji;Matsuda, Tomonari
通讯作者：
Matsuda, Tomonari

Novel Single Nucleotide Polymorphism of the CYP2A13 Gene in Japanese Individuals

日本人CYP2A13基因的新单核苷酸多态性

DOI：
10.2133/dmpk.dmpk-11-sc-033
发表时间：
2011
期刊：
Drug Metabolism and Pharmacokinetics
影响因子：
2.1
作者：
Tamaki;Y.;Honda;M.;Muroi;Y.;Arai;T.;Sugimura;H.;Matsubara;Y.;Kanno;S.;Ishikawa;M.;Hirasawa;N;Hiratsuka;M.
通讯作者：
M.

Adenine DNA glycosylase activity of 14 human MutY homolog (MUTYH) variant proteins found in patients with colorectal polyposis and cancer.

在结直肠息肉病和癌症患者中发现的 14 种人类 MutY 同源物 (MUTYH) 变异蛋白的腺嘌呤 DNA 糖基化酶活性。

DOI：
10.1002/humu.21363
发表时间：
2010-11
期刊：
HUMAN MUTATION
影响因子：
3.9
作者：
Goto, Masanori;Shinmura, Kazuya;Nakabeppu, Yusaku;Tao, Hong;Yamada, Hidetaka;Tsuneyoshi, Toshihiro;Sugimura, Haruhiko
通讯作者：
Sugimura, Haruhiko

酸化的DNA損傷修復に関わる遺伝子多型とヒト発がん

基因多态性参与氧化DNA损伤修复和人类致癌作用