On-Chip Co-expression Microarrays for Precise Analysis of Transcriptional Regulatory Networks

用于精确分析转录调控网络的片上共表达微阵列

• 批准号: 22658111
• 负责人: DOI Nobuhide
• 金额: $ 2.3万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22658111/
• 关键词: プロテオーム; 蛋白質; 遺伝子; バイオテクノロジー; 発現制御

Protein microarrays, in which thousands of proteins are spotted on a slide glass, is a powerful proteomic tool for high-throughput parallel analysis of protein interactions. We have developed an on-chip transcription/translation microarray, in which protein synthesis is done on a slide glass by cell-free expression systems and subsequently captured by antibodies immobilized on the slide glass. We further developed on-chip co-expression microarrays that co-express a bait protein and a prey protein in a single spot. This approach has an advantage that a variety of combination of bait and prey proteins can be analyzed immediately on a slide. We used transcription factors Jun and Jun-binding proteins as a model, and successfully detected protein-protein and protein-DNA interactions by the on-chip co-expression microarray.

蛋白质微阵列在载玻片上发现了数千种蛋白质，是一种强大的蛋白质组学工具，用于蛋白质相互作用的高通量并行分析。我们开发了一种芯片上转录/翻译微阵列，其中蛋白质合成是通过无细胞表达系统在载玻片上完成的，随后被固定在载玻片上的抗体捕获。我们进一步开发了片上共表达微阵列，可在单个点上共表达诱饵蛋白和猎物蛋白。这种方法的优点是可以在载玻片上立即分析诱饵和猎物蛋白质的各种组合。我们以转录因子Jun和Jun结合蛋白为模型，通过芯片上的共表达微阵列成功检测了蛋白质-蛋白质和蛋白质-DNA相互作用。

项目成果

オンチップ共発現マイクロアレイによる転写制御ネットワーク解析

使用片上共表达微阵列进行转录调控网络分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 早坂俊二;井上鈴代;堀澤健一;柳川弘志;土居信英
• 通讯作者: 土居信英

Translationally-regulated proteomics using biotinylated puromycin

使用生物素化嘌呤霉素进行翻译调控的蛋白质组学

• 发表时间: 2011
• 作者: 大川皓司;堀澤健一;柳川弘志;土居信英
• 通讯作者: 土居信英