Elucidation of the protonation mechanisms of ferredoxin-dependent bilin reductase by neutron crystallography

通过中子晶体学阐明铁氧还蛋白依赖性胆碱还原酶的质子化机制

• 批准号: 22770096
• 负责人: UNNO Masaki
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Ibaraki University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22770096/
• 关键词: 酵素; フィコシアノビリン; PcyA; 中性子結晶解析; 水素原子; 反応機構; 大型結晶; 宇宙実験; 高分解能; 中性子結晶構造解析; ビリン還元酵素; シアノバクテリア; 結晶成長

We succeeded obtaining a big crystal of PcyA, a ferredoxin-dependent bilin reductase, which biosynthesizes an important pigment pytochromobilin. The crystal diffracted neutron up to 2.6 A resolution. If we can obtain bigger crystal than this one, we will able to structural analysis beyond 2 A resolution, and determine the position of hydrogen atoms in the structure. The reaction mechanism will be elucidated, soon.

我们成功地获得了PCYA的大晶体，PCYA是一种依赖铁蛋白依赖性的bilin还原酶，生物合成了重要的色素pytotothromobilin。晶体衍射的中子最高为2.6 A分辨率。如果我们可以获得比这更大的晶体，那么我们将能够结构分析2分辨率，并确定结构中氢原子的位置。反应机制将很快阐明。

项目成果

ブルー銅タンパク質シュウドアズリンにおける銅イオンのダイナミクス

蓝铜蛋白伪天青中的铜离子动力学

• 发表时间: 2011
• 作者: 浅村紗矢香;他
• 通讯作者: 他

中性子結晶構造解析を目指したフェレドキシン依存性ビリン還元酵素PcyAの結晶成長

用于中子晶体结构分析的铁氧还蛋白依赖性胆碱还原酶 PcyA 的晶体生长

• 发表时间: 2010
• 作者: 石川久美子;萩原義徳;和田啓;小原裕二;黒木良太;玉田太郎;福山恵一;海野昌喜
• 通讯作者: 海野昌喜

Structure-based Drug Design for Kainate-type Ionotropic Glutamate Receptors, GluK1 and GluK2, from Human Brain

基于结构的人脑红藻氨酸型离子型谷氨酸受体 GluK1 和 GluK2 药物设计

• 发表时间: 2010
• 期刊: Photon Factory Activity Report 2009, PART B
• 作者: Unno;M.;et al.
• 通讯作者: et al.

Understanding of Nitric Oxide-Binding Mechanism of Cytochrome c' Based on Atomic Resolution Structure

基于原子分辨率结构理解细胞色素c的一氧化氮结合机制

• 发表时间: 2010
• 作者: Kumiko Ishikawa;et al.;Masaki Unno
• 通讯作者: Masaki Unno

金属タンパク質のX線結晶構造解析:ヘム分解酵素の反応中間体

金属蛋白的X射线晶体结构分析：血红素降解酶的反应中间体

• 发表时间: 2011
• 期刊: 日本結晶学会誌
• 作者: Bunpei Hatano;Tomoharu Tachikawa;Tetsunori Mori;Keita Nagahashi;Tatsuro Kijima;海野昌喜,松井敏高,齋藤正男
• 通讯作者: 海野昌喜,松井敏高,齋藤正男