CGHとarray CGHを併用した分化型胃癌及び関連病変の網羅的ゲノム解析

使用 CGH 和阵列 CGH 对分化型胃癌及相关病变进行全面基因组分析

基本信息

批准号：
15790179
负责人：
向所賢一
金额：
$ 2.11万
依托单位：
Shiga University of Medical Science
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2004
项目状态：
已结题

项目摘要

1965年のLaurenの分類により、胃癌はintestinal typeとdiffuse typeに分けられて考えられるようになった。Laurenのintestinal type carcinomaは腺管形成傾向の明瞭な癌で、本邦では分化型腺癌に対応する。分化型腺癌は腸上皮化生から、未分化型癌は胃固有粘膜から発生するとされてきたが、粘液組織化学の発達により、通常の分化型癌のなかにも胃型の形質を発現するものが相当数ある事が証明され、このような癌が胃型分化型癌あるいは胃型腺癌と呼ばれるようになった。本研究では、分化型胃癌(特にこの胃型腺癌)に対して、comparative genome hybridization(CGH)及びarray CGHを用いて網羅的なゲノム解析を行う事を目的とした。まず、CGHの方法論に対する研究を行い、これまでのCGHの標識法であるnick translation標識よりもrandom priming標識の方が、FISHで直接求めたコピー数をよく反映していることがわかった(Tsubosa et al. in press)。そのため、今回の研究もrandom priming標識にてCGHを行った。完全な胃型の形質を示す早期の高分化型癌(胃型腺癌)で主に低異型度な症例を対象としてCGH法を用いて染色体異常を解析した結果、低異型度なものでも相当数の染色体異常が検出され、共通するものも多く存在することがわかった。また、その共通な染色体異常は、増幅では、17q24-qter,20qが、欠失としては、6qと18qが高頻度であり、amplificationとしては、15q26が検出された(九嶋ら、2003)。さらに、胃型の形質を持つ胃型(幽門腺型)腺腫〜胃型腺癌のsequenceを染色体異常の観点から初めて報告することができ、array CGHの結果から幽門腺腺腫の癌化には、p16及びHER2等が候補遺伝子として挙げられた。(九嶋ら、2003)。

1965年根据Lauren分类法，胃癌分为肠型和弥漫型。劳伦肠型癌是一种具有明显导管形成倾向的癌症，在日本相当于分化型腺癌。人们一直认为分化型腺癌源自肠上皮化生，未分化癌源自胃粘膜本身，但由于粘蛋白组织化学的发展，即使是正常的分化型癌症也已被证明有相当多的表现出胃型特征。癌症，这种类型的癌症被称为胃型分化癌或胃型腺癌。在本研究中，我们旨在利用比较基因组杂交（CGH）和阵列CGH对分化型胃癌（特别是胃腺癌）进行全面的基因组分析。首先，我们对CGH方法进行了研究，发现随机引物标记比切口平移标记更能反映FISH直接确定的拷贝数，切口平移标记是传统的CGH标记方法（Tsubosa等人，出版中）。因此，在本研究中，使用随机引发标记进行 CGH。对于具有完全胃型特征、以低度不典型增生为主的早期高分化癌（胃型腺癌），我们使用CGH法对染色体畸变进行了分析，结果发现，即使是低度不典型增生，检测到多种染色体异常，其中许多是常见的。此外，常见的染色体异常在17q24-qter、20q处扩增，在6q和18q处缺失，并在15q26处扩增（Kujima等，2003）。此外，我们还首次从染色体畸变的角度报告了胃型（幽门腺型）腺瘤到具有胃型特征的胃型腺癌的序列，并根据阵列CGH的结果，确定了幽门癌的发生情况。腺瘤的p16和HER2被列为候选基因。（Kushima 等人，2003）。