Intron Sequences in the CCT7 gene Show Diverse Evolutionary Histories of the Four Lineages withinthe "Babesia microti-Group," a Genetically Related Species-Complex Including Pathogens of Humans.

CCT7 基因中的内含子序列显示了“小巴贝虫群”内四个谱系的不同进化历史，“巴贝虫群”是一个包括人类病原体在内的遗传相关物种复合体。

• 批准号: 22580352
• 负责人: ISHIHARA Chiaki
• 金额: $ 3.08万
• 依托单位: Rakuno Gakuen University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22580352/
• 关键词: Babesia microti; 進化系統解析; CCT7 遺伝子; イントロン; 輸血感染症; 新興感染症; バベシア症; 人獣共通感染症; CCT7遺伝子

Babesia microti, the main causal agent of human babesiosis, is a species-complex comprised of at least four taxa (the U.S., Kobe, Munich and Hobetsu). To further assess micro-evolutionary history and genetic variability within the taxon, we used a set of 6 introns in the CCT7 gene as a rapidly evolving DNA marker. Phylogenetic and comparative sequence analysis subdivided the U.S. taxon into three geographic subclades - North America, western to central Eurasia, and northeastern Eurasia. The Kobe taxon, which occurs only in a few geographic foci in Japan could further be subdivided into two subgroups. The Munich and Hobetsu taxa, common to Europe and Japan, respectively, exhibited little or no pairwise sequence divergence among geographically diverse samples, suggesting an extreme population bottleneck in the recent histories. We further conducted a field investigation at Nemuro on Hokkaidoisland and Sumoto on Awaji island, where up to two lineages co-occur with similar frequency in reservoir. Lineage specific PCR for rDNA-positive samples demonstrated that I. ovatus and I. persulcatus carried, respectively, the Hobetsu and U.S. parasites. No Kobe-parasote carrying tick was detected. This result indicate that, for the first time, Hobetsu and U.S. parasites are vectored by different Ixodid species.

Babesia Microti是人类Babesiosis的主要因果因素，是一种由至少四个分类单元（美国，科比，慕尼黑和霍比茨）组成的物种复杂性。为了进一步评估分类单元内的微观进化史和遗传变异性，我们使用CCT7基因中的6个内含子作为快速发展的DNA标记。系统发育和比较序列分析将美国分类单元分为三个地理子层 - 北美，欧亚大陆西部和欧亚大陆东北部。科比分类单元仅在日本的几个地理灶中发生，可以进一步细分为两个亚组。分别是欧洲和日本常见的慕尼黑和霍比茨类群，在地理上不同的样本中几乎没有或没有成对的序列差异，这表明最近的历史中有极端的种群瓶颈。我们进一步在Nemuro的北海道和Awaji岛的Sumoto上进行了现场调查，在储层中，多达两个谱系同时发生的频率相似。 rDNA阳性样品的谱系特异性PCR表明，卵形和孔硫酸I.分别携带的是霍巴茨和美国寄生虫。未检测到携带tick的神户参数。该结果表明，霍德图和美国寄生虫首次由不同的ixodid物种进行了介绍。

项目成果

B.microti原虫類の進化解析マーカーとしてのイントロン配列の有用性評価

评估内含子序列作为田鼠原生动物进化分析标记的有用性

• 发表时间: 2010
• 作者: Nagahata;H. et al (8);藤澤幸平・中嶋瑠衣・陳内理生・平田晴之・新倉綾・倉田貴子・石原智明
• 通讯作者: 藤澤幸平・中嶋瑠衣・陳内理生・平田晴之・新倉綾・倉田貴子・石原智明

Babesia microti の正体を探る

发现田鼠巴贝斯虫的真实身份

Babesia microti - a complex

田鼠巴贝斯虫 - 复合体