蛋白質の大量発現で形成される封入体の固体核磁気共鳴法による構造解析

使用固态核磁共振对大规模蛋白质表达形成的包涵体进行结构分析

基本信息

  • 批准号:
    14780502
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.11万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 财政年份:
    2002
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2002 至 2003
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

昨年度は、ニワトリ卵白リゾチーム(HEL)を特異的に認識する抗体HyHEL10の一本鎖Fv断片(HyHEL10-scFv)が形成する封入体の構造解析を中心に行ってきたが、今年度は超好熱古細菌Pyrococcus horikohii OT3由来蛋白質の大腸菌発現で得られる封入体の構造解析とその構造を利用した巻き戻し法の開発を行った。まず、超耐熱性蛋白質が形成する不溶性顆粒のFT-IRスペクトルを測定したところ、他のものとは異なり非常に天然型構造と類似した二次構造を形成していることがわかった。さらに、二次元固体NMR法からValやAlaのCβ・Cγ化学シフト値を求めたところ、天然型と類似したαヘリックスの存在も確認され、超耐熱性蛋白質の二次構造は大腸菌内の発現で非常に速い時期に二次構造が形成されていることが示唆された(梅津他,FEBS Letters 557,49-56(2004))。次に、超耐熱性蛋白質に関して、不溶性顆粒中の構造を考慮した蛋白質再活性を試みたた。まず、不溶性顆粒の構造を変性させないで可溶化する方法として低濃度のカオトロピック剤を用いた。その結果、2Mグアニジン溶液で目的蛋白質は構造を保ちながら可溶化することがわかった。そして、そこから、アルギニン溶液を介してグアニジンを透析により除去していくと、高効率で蛋白質は天然型へ巻き戻り、耐熱性を示した。さらに、この手法を緑色蛍光蛋白質にも応用したところ、2Mグアニジン溶液ではなく2Mアルギニン溶液を用いることによって、天然型と同じ活性を持つ巻き戻りタンパク質が速やかに形成された。(津本,梅津他,Biochemical Biophysical Research Communications 312,1383-1386(2003))。以上から、不溶性顆粒中でも発現蛋白質はある程度天然型構造を形成しており、その構造を利用した蛋白質再活性法は十分可能であり、従来の手法よりも非常に簡便になることを示すことができた。
去年,我们重点分析了特异性识别鸡蛋清溶菌酶(HEL)的抗体 HyHEL10 的单链 Fv 片段(HyHEL10-scFv)形成的包涵体的结构,但今年,我们分析了通过在大肠杆菌中表达来自古菌Pyrococcus horikohii OT3的蛋白质而获得包涵体,并开发了利用该结构的解旋方法。首先,我们测量了超热稳定蛋白形成的不溶性颗粒的红外光谱,发现与其他颗粒不同,它们形成了与天然结构非常相似的二级结构。此外,当使用二维固态NMR方法测定Val和Ala的Cβ和Cγ化学位移值时,也证实了与天然类型类似的α-螺旋的存在,并且其二级结构通过在大肠杆菌中的表达来测定超热稳定的蛋白质,表明二级结构形成得非常快(Umezu 等人,FEBS Letters 557, 49-56 (2004))。接下来,我们尝试通过考虑不溶性颗粒的结构来重新激活超热稳定性蛋白质。首先,使用低浓度的离液剂来溶解不溶性颗粒而不改变其结构。结果发现,目标蛋白溶解在2M胍溶液中,同时保持其结构。然后,当通过精氨酸溶液透析去除胍时,蛋白质高效地重新卷回其天然形式并表现出耐热性。此外,当将该方法应用于绿色荧光蛋白时,通过使用2M精氨酸溶液代替2M胍溶液,快速形成与天然类型具有相同活性的解绕蛋白。 (Tsumoto, Umezu 等人,Biochemical Biophysical Research Communications 312, 1383-1386 (2003))。由上可知,表达的蛋白质即使在不溶性颗粒中也能在一定程度上形成天然结构,并且利用该结构的蛋白质再活化方法是完全可行的并且比常规方法简单得多。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
K.Tsumoto, M.Umetsu, et al.: "Immobilized oxidoreductase as an additive for refolding inclusion bodies : application to antibody fragments"Protein Engineering. 16. 535-541 (2003)
K.Tsumoto、M.Umetsu 等人:“固定化氧化还原酶作为重折叠包涵体的添加剂:应用于抗体片段”蛋白质工程。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
M.Umetsu, et al.: "Magic-Angle Spinning NMR under ultra-high field reveals two forms of intermolecular interaction within CH_2Cl_2-treated (3^1R)-type bacteriochlorophyll c solid aggregate"The Journal of Physical Chemistry B. 108. 2726-2734 (2004)
M.Umetsu 等人:“超高场下的魔角旋转核磁共振揭示了 CH_2Cl_2 处理的 (3^1R) 型细菌叶绿素 c 固体聚集体中分子间相互作用的两种形式”The Journal of Physical Chemistry B. 108。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
M.Umetsu, et al.: "Dynamic Exchange Properties of the Antiparallel Bacteriochlorophyll c dimers"The Journal of Physical Chemistry B. 107. 9876-9882 (2003)
M.Umetsu 等:“反平行细菌叶绿素 c 二聚体的动态交换特性”物理化学杂志 B.107.9876-9882 (2003)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

梅津 光央其他文献

材料特異性ペプチド・抗体分子を利用した多機能セラミックス構造制御
使用材料特异性肽和抗体分子对多功能陶瓷进行结构控制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    梅津 光央
  • 通讯作者:
    梅津 光央
無機材料工学へ侵食するバイオ工学
生物工程侵入无机材料工程
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    梅津 光央
  • 通讯作者:
    梅津 光央
ナノバイオ大事典(金ナノ粒子)
纳米生物百科全书(金纳米粒子)
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    梅津 光央
  • 通讯作者:
    梅津 光央
一本鎖抗体の自己会合特性を活かした多価・多重特異性抗体設計
利用单链抗体的自缔合特性的多价和多特异性抗体设计
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    梅津 光央; 藤井 滉人; 筋野 拓馬; 真鍋 法義; 中澤 光; 田中 良和; 浅野 竜太郎; 熊谷 泉
  • 通讯作者:
    熊谷 泉
クロム・銅・ヒ素(CCA)系保存剤で処理された木材に結合するペプチドの探索
寻找与经过铬铜砷 (CCA) 防腐剂处理的木材结合的肽
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    太田原 統;中澤 光;梅津 光央;吉田 誠
  • 通讯作者:
    吉田 誠

梅津 光央的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('梅津 光央', 18)}}的其他基金

機械学習が道先案内する進化分子工学:がん治療抗体のスマート成熟プロセス提案
机器学习引导的进化分子工程:提出癌症治疗抗体的智能成熟过程
  • 批准号:
    20H00315
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
蛋白質活性再生における添加剤効果の解明と汎用的蛋白質調製系の構築
阐明添加剂对蛋白质活性再生的影响并构建通用蛋白质制备系统
  • 批准号:
    16760628
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
蛋白質活性再生における添加剤効果の解明と汎用的蛋白質調製系の構築
阐明添加剂对蛋白质活性再生的影响并构建通用蛋白质制备系统
  • 批准号:
    16760628
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
色素分子の会合構造および電子構造解明によるアンテナクロロゾームの機能解析
通过阐明染料分子的缔合结构和电子结构对天线叶绿体进行功能分析
  • 批准号:
    97J06356
  • 财政年份:
    1998
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

相似海外基金

コロナウイルスの非構造蛋白質nsp1を介した複製機構と病原性発現機序の解明
阐明冠状病毒非结构蛋白nsp1介导的复制机制和致病性表达机制
  • 批准号:
    24K10242
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Characterizing Vulnerable Cell Types in C9orf72-FTD
表征 C9orf72-FTD 中的脆弱细胞类型
  • 批准号:
    10464266
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
The roles and mechanisms of inflammation resolution in the development of Rheumatoid Arthritis
炎症消退在类风湿关节炎发展中的作用和机制
  • 批准号:
    10733789
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
Developing a new platform to characterize and treat disease-associated polycystin variants
开发一个新平台来表征和治疗与疾病相关的多囊蛋白变体
  • 批准号:
    10726754
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
Determining how Doublesex and sex-specific steroid hormone signaling control gonad development
确定双性和性别特异性类固醇激素信号如何控制性腺发育
  • 批准号:
    10679359
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了