Function and regulation of D-amino acid biosystem in eukaryote

真核生物D-氨基酸生物系统的功能与调控

• 批准号: 22380058
• 负责人: YOSHIMURA Tohru
• 金额: $ 11.4万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22380058/
• 关键词: D-アミノ酸; D-セリン; D-アスパラギン酸; Dictyostelium discoidium; D-セリンデヒドラターゼ; セリンラセマーゼ; D－セリン; アスパラギン酸ラセマーゼ; D－セリンデヒドラターゼ; 細胞性粘菌; ピリドキサルリン酸; ALS; D-Ser; D-セリンデヒドロターゼ

In these studies, we examined the role of zinc in the D-serine dehydratase of Saccharomycescerevisiae. We also studied the reaction mechanism of serine racemase of a slime cellularmold, Dictyostelium discoidium, and found that the enzyme reaction proceeds through thetwo-base mechanism with Lys56 and Ser81. In order to clarify the role of D-aspartatein mammals, we cloned the gene of mouse GOT1L1, which was suggested to be an asparateracemase, and attempted to purify the protein. We also studied the D-serine metabolismin D. discoidium to understand the role of D-serine in development. We constructed themutant D. discoidium cells lacking D-serine dehydratase, which is responsible for theD-serine degradation. The mutant cells contained D-serine at their multicellular stageand showed the defects in fruiting body formation. We also constructed the polyethyleneglycol-modified D-serine dehydratase, which can be a tool for the in vivo D-serinedegradation. The modified enzyme exhibited a decreased immunogenicity.

在这些研究中，我们研究了锌在酿酒酵母 D-丝氨酸脱水酶中的作用。我们还研究了粘菌盘基网柄菌丝氨酸消旋酶的反应机制，发现该酶反应通过Lys56和Ser81双碱基机制进行。为了阐明D-天冬氨酸在哺乳动物中的作用，我们克隆了小鼠GOT1L1（被认为是天冬氨酸消旋酶）的基因，并尝试纯化该蛋白。我们还研究了 D. discoidium 中的 D-丝氨酸代谢，以了解 D-丝氨酸在发育中的作用。我们构建了缺乏D-丝氨酸脱水酶的突变D.discoidium细胞，D-丝氨酸脱水酶负责D-丝氨酸降解。突变细胞在多细胞阶段含有D-丝氨酸，并在子实体形成中表现出缺陷。我们还构建了聚乙二醇修饰的D-丝氨酸脱水酶，它可以作为体内D-丝氨酸降解的工具。修饰后的酶表现出降低的免疫原性。

项目成果

GabR, a pyridoxal 5'-phosphate-dependent transcriptional regulator of Bacillus subtilis

GabR，枯草芽孢杆菌的吡哆醛 5-磷酸依赖性转录调节因子

• 发表时间: 2011
• 作者: 山野隆志;浅田温子;山原洋佑;中野博文;佐々木優;福澤秀哉;松下一信;Tohru Yoshimura
• 通讯作者: Tohru Yoshimura

D-Amino acid as a novel biofactor

D-氨基酸作为新型生物因子

• 发表时间: 2012
• 作者: 木村明音;ら;Yoshimura Tohru
• 通讯作者: Yoshimura Tohru

Simultaneous determination ofD-amino acids by the coupling method ofD-amino acid oxidase withhigh-performance liquid chromatography

D-氨基酸氧化酶与高效液相色谱偶联法同时测定D-氨基酸

• DOI: 10.1016/j.jchromb.2010.12.005
• 发表时间: 2012
• 期刊: J.Chromat
• 作者: Kato S;Kito Y;Hemmi H;Yoshimura T
• 通讯作者: Yoshimura T

ワイン発酵過程における菌叢とD-アミノ酸の動態

葡萄酒发酵过程中细菌菌群和D-氨基酸的动态

• 发表时间: 2010
• 作者: 加藤志郎;石原達也;川原麻紀;邊見久;吉村徹
• 通讯作者: 吉村徹

ピリドキサールリン酸に依存する細菌の転写制御因子、GabR

GabR，一种依赖磷酸吡哆醛的细菌转录调节因子

• 发表时间: 2011
• 作者: 白木俊介;奥田啓太;深田はるみ;後藤勝;邊見久;吉村徹
• 通讯作者: 吉村徹