Biosyntheses and molecular functions of novel biofactors, D-amino acids : from microorganisms to mammals

新型生物因子 D-氨基酸的生物合成和分子功能：从微生物到哺乳动物

• 批准号: 19380059
• 负责人: YOSHIMURA Tohru
• 金额: $ 12.65万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19380059/
• 关键词: D-アミノ酸; D-セリンデヒドラターゼ; D-セリン定量; ピリドキサルリン酸; スクレイピー; 細胞性粘菌; Saccharomyces cerevisiae; Escherichia coli; D-セリン; セリンラセマーゼ; カイコ; 出芽酵母

In this study, we found a novel D-serine dehydratase in Saccharomyces cerevisiae, and studied its properties. With this enzyme exhibiting high substrate specificity for D-serine, we constructed a novel D-serine assay system. We examined the relationship between the concentration of D-amino acids in the various organs of a scrapy-infected hamster and the progress in the disease. We also studied the D-serine metabolism in a slime cellular mold, Dictyostellium discoidium, to understand the role of D-serine in development, and found that the cell contains serine racemase catalyzing D-serine synthesis, and D-serine dehydratase and D-amino acid oxidase catalyzing D-serine degradation. In this study, we also examine the function of E.coli YggS, a homolog of the unknown mammalian protein, PROSC, which exhibits the similarity in the primary structure with the bacterial alanine racemase.

在这项研究中，我们在酿酒酵母中发现了一种新型的D-丝氨酸脱水酶，并研究了其特性。利用这种对 D-丝氨酸表现出高底物特异性的酶，我们构建了一种新型的 D-丝氨酸测定系统。我们检查了感染刮痧的仓鼠各个器官中 D-氨基酸的浓度与疾病进展之间的关系。我们还研究了粘液细胞霉菌盘基网柄菌中的D-丝氨酸代谢，以了解D-丝氨酸在发育中的作用，发现该细胞含有催化D-丝氨酸合成的丝氨酸消旋酶，以及D-丝氨酸脱水酶和D-丝氨酸。氨基酸氧化酶催化D-丝氨酸降解。在这项研究中，我们还检查了大肠杆菌 YggS 的功能，它是未知哺乳动物蛋白 PROSC 的同源物，其一级结构与细菌丙氨酸消旋酶相似。

项目成果

真核生物型D-セリンデヒドラターゼの触媒機構

真核D-丝氨酸脱水酶的催化机制

• 发表时间: 2008
• 作者: 伊藤智和

D-アミノ酸測定法

D-氨基酸测定方法

• 发表时间: 2009

Eukaryotic D-serine dehydratase from Saccharomyces cerevisiae

来自酿酒酵母的真核 D-丝氨酸脱水酶

• 发表时间: 2009
• 作者: 岡本 紘一;細見 昭;竹川 薫;大熊盛也;Tohru Yoshimura
• 通讯作者: Tohru Yoshimura

Crystal Structure of a Homolog of Mammalian Serine Racemase from Schizosaccharomyces pombe

• DOI: 10.1074/jbc.m109.010470
• 发表时间: 2009-09-18
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Goto, Masaru;Yamauchi, Takae;Esaki, Nobuyoshi
• 通讯作者: Esaki, Nobuyoshi

A novel Zinc-dependent D-serine dehydratase of Saccharomyces cerevisiae and its application to enzymatic assay of D-serine.

一种新型酿酒酵母锌依赖性 D-丝氨酸脱水酶及其在 D-丝氨酸酶法检测中的应用。

• 发表时间: 2008
• 作者: 大熊盛也;大熊盛也;Hirofumi Ohba;Tohru Yoshimura
• 通讯作者: Tohru Yoshimura