Development of novel methods for sequence comparison in the era of massive DNA sequencing data

海量DNA测序数据时代序列比对新方法的开发

基本信息

项目摘要

We focused on middle-to-long DNA reads generated by new generation sequencers, and developed a computer program named “Spaln” that maps and spliced-align a set of transcripts onto reference genomic sequences. When tested on full length cDNA or protein ami
我们专注于新一代测序仪生成的中间至长的DNA读取，并开发了一个名为“ Spaln”的计算机程序，该程序将一组转录本映射到参考基因组序列上。当在全长cDNA或蛋白AMI上测试时

项目成果

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A Method for fast and space-efficient whole-genome sequence alignment, in Proceeding of the 5th International Conference
一种快速且节省空间的全基因组序列比对方法，第五届国际会议论文集
  • DOI：
  • 发表时间：
    2010
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Nakato;R. and Gotoh;O
  • 通讯作者：
    O
RDF Curator : A Novel Workflow that Generates Semantic Graph from Literature for Curation Using Text Mining
RDF Curator：一种新颖的工作流程，使用文本挖掘从文献中生成语义图以进行策展
  • DOI：
  • 发表时间：
    2010
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Komiyama;Y.;Gotoh;O.
  • 通讯作者：
    O.
A Method for fast and space-efficient whole-genome sequence alignment
一种快速且节省空间的全基因组序列比对方法
  • DOI：
  • 发表时间：
    2010
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Nakato;R.;Gotoh;O.
  • 通讯作者：
    O.
Mapping middle-to-long RNA-seq reads onto genomic sequence
将中长 RNA-seq 读段映射到基因组序列上
  • DOI：
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Zeng;C.;Iwata;H.;Gotoh;O
  • 通讯作者：
    O
Online Alignment Programs
在线调整计划
  • DOI：
  • 发表时间：
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
  • 通讯作者：
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GOTOH Osamu其他文献

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