Effects of DNA-protein crosslink lesions on DNA replication and transcription

DNA-蛋白质交联损伤对 DNA 复制和转录的影响

• 批准号: 21710059
• 负责人: NAKANO Toshiaki
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21710059/
• 关键词: 修復; 複製; 転写; DNA-タンパク質クロスリンク; DNA-タンパク質クロスリンク損傷; DNA複製; DnaB

DNA-protein crosslinks (DPCs) are extremely bulky genomic lesions and are not efficiently repaired by nucleotide excision repair, suggesting that DPCs will exert detrimental effects on DNA replication and transcription in cells. In this study, we have prepared model DNA substrates containing site-specific DPCs and assessed their effects on DNA replication and transcription in vitro. DPCs on the lagging strand inhibited the progression of DnaB, the replicative helicase of E. coif, in a DPC size-dependent manner. Conversely DPCs on the leading strand had no effects on the progression of DnaB. We also have prepared DNA templates containing DPCs for in vitro transcriptions studies with T7 RNA polymerase. We are currently assessing the effects of DPCs in transcribed and nontranscribed strands on transcription.

DNA-蛋白质交联 (DPC) 是极其庞大的基因组损伤，并且不能通过核苷酸切除修复有效修复，这表明 DPC 将对细胞中的 DNA 复制和转录产生有害影响。在这项研究中，我们制备了含有位点特异性 DPC 的模型 DNA 底物，并评估了它们对体外 DNA 复制和转录的影响。滞后链上的 DPC 以 DPC 大小依赖性方式抑制 DnaB（大肠杆菌的复制解旋酶）的进展。相反，前导链上的 DPC 对 DnaB 的进展没有影响。我们还准备了含有 DPC 的 DNA 模板，用于使用 T7 RNA 聚合酶进行体外转录研究。我们目前正在评估转录链和非转录链中的 DPC 对转录的影响。

项目成果

試験管内反応を用いたDNA-タンパク質クロスリンク損傷の転写反応阻害の検討

使用体外反应检查 DNA-蛋白质交联损伤引起的转录反应抑制

• 发表时间: 2010
• 作者: 中野敏彰;その他(3名)
• 通讯作者: その他(3名)

Activities of bacterial and human nucleotide excision repair systems for DNA-protein crosslink damage

细菌和人类核苷酸切除修复系统对 DNA-蛋白质交联损伤的活性

• 发表时间: 2009
• 作者: Toshiaki Nakano;et al.(3名)
• 通讯作者: et al.(3名)

Comparison of the activities of bacterial and mammalian nucleotide excision repaor for DNA-protein crosslinks

细菌和哺乳动物核苷酸切除修复对 DNA-蛋白质交联的活性比较

• 发表时间: 2009
• 期刊: Nucleic Acids Symposium. Series 53
• 作者: Nakano;T.;et.al
• 通讯作者: et.al

Assesment of the activity of mammalian nucleotie excision repair for superbulky DNA lesions, 11th International Workshop on Radiation

评估哺乳动物核酸切除修复超大 DNA 损伤的活性，第 11 届国际放射研讨会

• 发表时间: 2010
• 作者: Toshiaki Nakano;et al.(3名)
• 通讯作者: et al.(3名)

Assesment of the activity of mammalian nucleotide excision repair for superbulky DNA lesions

评估哺乳动物核苷酸切除修复超大 DNA 损伤的活性

• 发表时间: 2010
• 作者: Toshiaki Nakano;et al.
• 通讯作者: et al.