パーキンソン病のゲノム解析(嗅覚受容体につながる個々の神経細胞のゲノム解析研究)

帕金森病的基因组分析（与嗅觉受体连接的单个神经元的基因组分析研究）

基本信息

批准号：
10F00751
负责人：
CARNINCI Piero
金额：
$ 1.41万
依托单位：
The Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至 2012
项目状态：
已结题

项目摘要

本プロジェクトの目的は、活発にレトロ転位を起こす反復要素、LINEやSINEなどの複雑な転写制御における調節不全が、神経変性疾患の発病または進行に関与している可能性を調査することです。そのため、私たちの主たる目的は、原理の証明として、パーキンソン病(PD)およびアルツハイマー病(AD)に罹患しているドナーとコントロールのドナーについて、特定の脳領域におけるLINEおよびSINEのレトロ転位の違いを探すことでした。私たちの実験プロトコルは、ビオチン標識したRNAプローブを使い、現在ヒトゲノム内で活性化しているLINE-1およびSINEレトロトランスポゾンの特定の配列を捕獲するという方法に基づいています。このようにして捕獲したゲノムDNA断片を次世代ハイスループット・シークエンシングによって分析。また、ヒトゲノムのデータをマッピングすることで、患者およびコントロールのドナーの脳内におけるレトロ転位の範囲をモニターすることができました。さらに、体細胞で起きたレトロ転位イベントと生殖細胞で起きたレトロ転位イベントを区別するため、脳のサンプルと並行して、選択した脳以外の組織(腎臓)も調べました。私たちは、ADドナーの側頭葉において、罹患していないコントロールのドナーおよびPDドナーに比べ、レトロ転位が20%減少していることを示し、プロジェクトの第1段階を成功裏に完了しました。本研究を完結させるため、現在私たちはプロジェクトを拡大し、より多くのドナーから、さらに多くの脳領域を集めています。

该项目的目的是调查复杂转录控制中的失调（例如线和正弦）积极引起逆转录转换的可能性，可能与神经退行性疾病的发作或进展有关。因此，我们的主要目的是寻找患有帕金森氏病（PD）和阿尔茨海默氏病（AD）的供体的特定大脑区域的线条和正弦逆转录区域的差异。我们的实验方案是基于一种使用生物素标记的RNA探针来捕获当前在人基因组中激活的线1和正弦逆转录座子的特定序列的方法。通过下一代高通量测序分析以这种方式捕获的基因组DNA片段。此外，映射人类基因组数据使我们能够监测患者和对照供体的大脑中逆转录的程度。此外，我们还与脑样品并行检查了选定的非脑组织（肾脏），以区分在体细胞和生殖细胞中发生的逆转录事件。我们成功完成了该项目的第一阶段，与未受影响的对照供体和PD供体相比，AD供体的颞叶额叶中的逆转录降低了20％。为了完成这项研究，我们现在正在扩大我们的项目，以从更多的捐助者那里收集更多的大脑区域。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

L-PREC:神経変性疾患におけるde novoレトロ転位のインパクトをアッセイする新しい方法

L-PREC：一种测定从头逆转录转座对神经退行性疾病影响的新方法

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
De Antoni Andrea;Chris Feldman;John Traphagan (eds.);Elisa Sorrivi;SORRIVI Elisa;ギロッテイマルコ;Giovanni Pascarella
通讯作者：
Giovanni Pascarella

L-PREC : a novel approach to assay the impact of de novo retrotransposition in neurodegenerative diseases

L-PREC：一种测定从头逆转录转座对神经退行性疾病影响的新方法

DOI：
发表时间：
2011
期刊：
影响因子：
0
作者：
De Antoni Andrea;Chris Feldman;John Traphagan (eds.);Elisa Sorrivi;SORRIVI Elisa;ギロッテイマルコ;Giovanni Pascarella;Pascarella Giovanni
通讯作者：
Pascarella Giovanni

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通讯作者：
熊谷嘉人

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通讯作者：
CARNINCI Piero

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发表时间：
2008
期刊：
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影响因子：
0
作者：
Tomohiko Okazaki;Maiko Higuchi;Kohsuke Takeda;Makoto Miyagishi;Atsushi Kato;Mitsutoshi Yoneyama;Takashi Fujita;Hidenori Ichijo;and Yukiko Gotoh;前田慎市;CARNINCI Piero;M. Itoh and T. Inagaki
通讯作者：
M. Itoh and T. Inagaki