Molecular architecture and regulation mechanism of replication fork complex revealed by single partic le analysis

单粒子分析揭示复制叉复合物的分子结构和调控机制

• 批准号: 21570114
• 负责人: MAYANAGI Kouta
• 金额: $ 3.08万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21570114/
• 关键词: 可視化; 生物物理; 電子顕微鏡; ナノバイオ; 生体分子; 生態分子

We investigated the three-dimensional structure of the DNA polymerase B(PolB)-PCNA-DNA complex, which is the core components of the replisome, by single particle electron microscopy. Notably, besides the authentic interaction through a PCNA-interacting protein box(PIP-box), a novel contact was found between PolB and PCNA. The obtained molecular architecture of the complex, including the new contacts found in this work, provides clearer insights into the mechanism of switching between the two distinct modes of the complex.

我们通过单粒子电子显微镜研究了复制体核心成分DNA聚合酶B(PolB)-PCNA-DNA复合物的三维结构。值得注意的是，除了通过 PCNA 相互作用蛋白盒（PIP-box）进行真实的相互作用外，PolB 和 PCNA 之间还发现了一种新的接触。获得的复合物分子结构，包括在这项工作中发现的新接触，为复合物两种不同模式之间的切换机制提供了更清晰的见解。

项目成果

タンパク質の立体構造 7章構造決定法

蛋白质三维结构第七章结构测定方法

• 发表时间: 2010
• 作者: 真柳浩太;廣明秀一;白井剛
• 通讯作者: 白井剛

3D ultrastructure within intact cells explored by electron cryo-tomography in TEM and STEM

通过 TEM 和 STEM 电子冷冻断层扫描技术探索完整细胞内的 3D 超微结构

• 发表时间: 2012
• 作者: Shinji Aramaki;Kazuaki Aoyama;Kouta Mayanagi;Takuo Yasunaga
• 通讯作者: Takuo Yasunaga

Modeling of 3R complexes from structure database.

根据结构数据库对 3R 配合物进行建模。

• 发表时间: 2010
• 作者: Mayanagi K.;et al.
• 通讯作者: et al.

TheswitchingmechanismofreplicationfactorsasrevealedbythemoleculararchitectureoftheDNAligase-PCNA-DNAcomplex

DNA连接酶-PCNA-DNA复合物的分子结构揭示了复制因子的转换机制

• 发表时间: 2009
• 作者: 真柳浩太;清成信一;斉藤美保子;白井剛;五塁壁;森川取右
• 通讯作者: 森川取右

単粒子解析によるDNA複製関連複合体の構造研究

使用单粒子分析研究 DNA 复制相关复合物的结构

• 发表时间: 2009
• 作者: 真柳浩太;清成信一;斉藤美保子;白井剛;五塁壁;森川取右;真柳浩太
• 通讯作者: 真柳浩太