Development of a Sequence-specific detection probe of damaged nucleobase for noninvasive DNA damage imaging.

开发用于非侵入性 DNA 损伤成像的受损核碱基序列特异性检测探针。

基本信息

批准号：
20790010
负责人：
KODAMA Tetsuya
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2009
项目状态：
已结题

项目摘要

To develop a sequence-specific detection method of damaged nucleobase for noninvasive DNA damage imaging, we successfully created a novel bridged nucleic acid monomer that can recognize 8-hydroxyguanine in double-stranded DNA in a sequence-specific manner. Additionally, several nucleic acids, which convert into an oxidative lesion 5-formyluridne in double-stranded DNA in response to photo irradiation, were also synthesized. Moreover, we designed and synthesized a triplex forming oligonucleotide probe by organizing the 8-hydroxyguanine-recognizing nucleic acid monomer and acid-labile phosphoramidite linkage, and the fluorescent labeling of the probe was achieved for its noninvasive imaging use.

为了开发一种用于非侵入性DNA损伤成像的受损核碱基序列特异性检测方法，我们成功创建了一种新型桥接核酸单体，它可以以序列特异性方式识别双链DNA中的8-羟基鸟嘌呤。此外，还合成了几种核酸，它们响应光照射而转化为双链DNA中的氧化损伤5-甲酰尿苷。此外，我们通过组织8-羟基鸟嘌呤识别核酸单体和酸不稳定的亚磷酰胺键，设计并合成了三链体形成的寡核苷酸探针，并实现了探针的荧光标记用于非侵入性成像用途。

项目成果

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专利数量（0）

二重鎖DNA中の8-オキソグアニン塩基を選択的に認識する人工核酸プローブ

选择性识别双链DNA中8-氧代鸟嘌呤碱基的人工核酸探针

DOI：
发表时间：
2008
期刊：
影响因子：
0
作者：
兒玉哲也;三好哲也;小比賀聡;今西武;土肥寿文;兒玉哲也
通讯作者：
兒玉哲也

Synthesis of Light-Responsive Bridged Nucleic Acid and Changes in Affinity with Complementary ssRNA

光响应性桥接核酸的合成以及与互补 ssRNA 的亲和力变化

DOI：
发表时间：
2009
期刊：
ChemBioChem 10
影响因子：
0
作者：
DOHI;Toshifumi;et.al.;Kunihiko Morihiro(研究補助)
通讯作者：
Kunihiko Morihiro(研究補助)

Design, Synthesis, and Evaluation of a Novel Bridged Nucleic Acid, 2', 5'-BNAON, with S-type Sugar Conformation Fixed by N-O Linkage.

新型桥接核酸 2, 5-BNAON 的设计、合成和评估，其具有通过 N-O 连接固定的 S 型糖构象。

DOI：
发表时间：
2009
期刊：
Tetrahedron 65
影响因子：
0
作者：
Tetsuya Kodama;Chieko Matsuo;Hidetsugu Ori;Tetsuya Miyoshi;Satoshi Obika;Kazuyuki Miyashita;Takeshi Imanishi
通讯作者：
Takeshi Imanishi

Synthesis of Light-responsive Bridged Nucleic Acid and Changes in Affinity with Complementary ssRNA.

光响应桥接核酸的合成以及与互补 ssRNA 的亲和力变化。