海洋に広がる薬剤耐性遺伝子-海洋細菌の遺伝子伝達機構と耐性遺伝子新機能の解明

耐药基因在海洋中传播——阐明海洋细菌中耐药基因的基因转移机制和新功能

基本信息

批准号：
20780141
负责人：
野中里佐
金额：
$ 3.08万
依托单位：
Dokkyo Medical University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2010
项目状态：
已结题

项目摘要

昨年度は養殖場海水より分離したビブリオ科細菌Photobacterium damselae subsp. damselae04Ya311が保有する多剤耐性伝達性プラスミドの全塩基配列を高速シークエンサーを用いて決定後、coding sequence (CDS)の抽出およびアノテーションを行った。当該年度はアノテーションの結果から、配列情報が不確かと思われた約20箇所についてサンガー法を用いて配列を確認し、CDSを確定した後、DDBJ (DNA data bank of Japan)への登録を行った(2003年12月公開予定)。本プラスミドは235のCDSを含む204,052bpの環状プラスミドであった。このうち約3割に該当する78のCDSから予想されるアミノ酸配列は既知配列との比較により機能予測が可能であった。本プラスミドは合計7つの薬剤耐性遺伝子をコードする多剤耐性プラスミドであり、接合伝達実験により本プラスミドを受容した大腸菌では、テトラサイクリン系、ベータラクタム系、マクロライド系、フロルフェニコールおよびクロラムフェニコールに対する感受性が低下しており、伝達された耐性遺伝子が接合体においても機能していることが確認された。さらに本プラスミド上にはグラム陰性菌のtype IV secretion systemに必要とされる20の遺伝子セットがコードされており、プラスミドの伝達は本システムを介して行われていることが強く示唆された。また、プラスミド上にコードされているリラクゼース遺伝子を用いた解析により本プラスミドがMOB_Hというプラスミドグループに属する新しいタイプのプラスミドであることが明らかになった。この新しいタイプのプラスミドは他の養殖場由来菌からも検出され、海洋細菌固有のプラスミドタイプとして養殖環境内でのプラスミド伝播に寄与していることが示唆された。

去年，我们利用高速测序仪测定了从养殖场海水中分离出的弧菌科细菌Photobacter damselae subsp. damselae04Ya311携带的多药耐药转移质粒的完整碱基序列，然后提取并注释了编码序列（CDS）。 .今年，根据注释结果，我们使用Sanger方法确认了大约20个被认为序列信息不确定的位置的序列，确定CDS后，我们将其注册到DDBJ（日本DNA数据库）（预定于 2003 年 12 月发布）。该质粒是含有235个CDS的204,052bp环状质粒。其中，从约占30%的78个CDS中预测的氨基酸序列的功能可以通过与已知序列进行比较来预测。该质粒是编码总共7个耐药基因的多重耐药性质粒，在接合转移实验中接受该质粒的大肠杆菌中，确认了四环素类、β-内酰胺类、大环内酯类、氟苯尼考、氯霉素。转移的抗性基因仍在受精卵中发挥作用。此外，该质粒编码革兰氏阴性菌IV型分泌系统所需的一组20个基因，强烈表明质粒转移是通过该系统进行的。此外，使用该质粒上编码的松弛酶基因的分析表明，该质粒是属于质粒组MOB_H的新型质粒。这种新型质粒也在其他水产养殖来源的细菌中检测到，表明它作为海洋细菌特有的质粒类型有助于水产养殖环境中的质粒繁殖。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Novel lineage of transferable multi-drug resistance plasmids derived Vibrionaceae isolated from coastal aquaculture site

从沿海水产养殖场分离的弧菌科可转移多重耐药质粒的新谱系

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
Segawa T;Itou T;Echigoya Y;Suzuki M;Koie H;Sakai T.;野中里佐
通讯作者：
野中里佐

養殖場由来Photobacterium damselae subsp. damselaeの多剤耐性プラスミド全塩基配列解析とその伝達機構

农场来源的少女发光杆菌亚种多重耐药质粒的完整核苷酸序列分析及其传播机制

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
Itou T;Koie H;Segawa T;Kato M;Yanagisawa M;Ueda K;Kuwano R;Suzuki M;Moritomo T;Sakai T.;宮口英夫・土屋健司・森健一・田口哲菊池知彦・戸田龍樹;野中里佐
通讯作者：
野中里佐

海洋由来Vibrio sp. から大腸菌へ伝達されたテトラサイクリン耐性遺伝子挿入部位の解析

从海洋来源的弧菌转移到大肠杆菌的四环素抗性基因的插入位点分析。