肝分化指向性ヒトiPS細胞による胆管がんモデル作製

利用肝分化导向的人iPS细胞创建胆管癌模型

基本信息

批准号：
16K07135
负责人：
石川哲也
金额：
$ 3.24万
依托单位：
National Cancer Center Japan
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2016
资助国家：
日本
起止时间：
2016-04-01 至 2018-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

胆管上皮細胞や肝細胞に分化させるiPS細胞をがん組織由来の初代培養細胞から作製した。作製したiPS細胞のマイクロアレイによる網羅的遺伝子発現解析と次世代シークエンスとバイオインフォマティクス解析によるキノーム遺伝子及びがん関連遺伝子の変異を調べた。その結果、結腸がん組織または胃がん組織由来のiPS細胞は、線維芽細胞由来の標準的iPS細胞と比べ、各々特徴的な遺伝子発現プロファイルを示し、がん関連遺伝子の発現も上昇していた（Cancer Informatics, 15: 163-178, 2016)。一部の複数株は肝分化指向性のiPS細胞に特徴的な肝細胞遺伝子の発現上昇も同時に観察された。一方、結腸がん組織由来の初代培養細胞から作製したiPS細胞は、非がん組織には存在しないsingle nucleotide variants (SNVs)が検出された（World Journal of Stem Cells, in press)。胃がん組織由来の初代培養細胞から作製したiPS細胞にも、非がん組織には存在しないSNVsが検出された。これらの遺伝子変異の発がんやがん進展への関連性についてはまだ明らかではない。

IPS细胞分化为胆管上皮细胞和肝细胞，是从源自癌组织的第一个代代培养细胞中产生的。研究了由IPS细胞制成的全面基因表达分析，下一个代序列以及Cinomome基因和癌症相关基因分析的突变。结果，与来自纤维芽的标准IPS细胞相比，源自结肠癌或胃癌组织的IPS细胞显示出具有特征性的遗传表达曲线，并且癌症相关基因的表达已增长（（（）。癌症信息，15：163 -178，2016）。同时，还观察到以肝IPS细胞为特征的肝细胞基因表达的升高也同时观察到。另一方面，已经检测到了从奥质癌组织得出的初始培养细胞产生的IPS细胞（世界干细胞杂志，印刷中），这在非癌组织中找不到。在非癌组织中不存在的SNV也在从胃癌组织衍生的第一代培养细胞产生的IPS细胞中检测到。目前尚不清楚这些遗传突变与癌症和癌症发展的相关性。

项目成果

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会议论文数量（0）

专利数量（0）

Analysis of gene expression in artificial cancer stem cell using spherical self-organization map

使用球形自组织图分析人工癌症干细胞中的基因表达

DOI：
发表时间：
2016
期刊：
影响因子：
0
作者：
妹尾彬正;笠井智成;Arun Vaidyanath;増田潤子;水谷昭文、石川哲也、妹尾昌治
通讯作者：
水谷昭文、石川哲也、妹尾昌治

Characterization of Gene Expression Patterns among Artificially Developed Cancer Stem Cells Using Spherical Self-Organizing Map.

DOI：
10.4137/cin.s39839
发表时间：
2016
期刊：
Cancer informatics
影响因子：
2
作者：
Seno A;Kasai T;Ikeda M;Vaidyanath A;Masuda J;Mizutani A;Murakami H;Ishikawa T;Seno M
通讯作者：
Seno M

Next-generation sequencing traces human iPSC lines clonally generated from heterogeneous cancer tissue

下一代测序追踪从异质癌症组织克隆产生的人类 iPSC 系

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
World Journal of Stem Cells
影响因子：
4.1
作者：
Yoshiko Maida;Mami Yasukawa;Marco Ghilotti;Yoshinari Ando;Kenkichi Masutomi;Ishikawa T
通讯作者：
Ishikawa T

特定3因子を用いてがん組織から作製されたヒトiPS細胞の次世代シークエンス解析

使用三个特定因素对癌症组织产生的人类 iPS 细胞进行下一代序列分析